More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0103 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0103  GTP-binding protein  100 
 
 		 440 aa  884    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000228129  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0106  GTP-binding protein  98.18 
 
 		 440 aa  867    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3103  small GTP-binding protein  46.77 
 
 		 396 aa  375  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0146  small GTP-binding protein  45.54 
 
 		 398 aa  364  2e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0325934  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1569  small GTP-binding protein  47.38 
 
 		 407 aa  361  1e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.627873  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2152  small GTP-binding protein  43.09 
 
 		 409 aa  355  1e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19310  small GTP-binding protein  44.39 
 
 		 411 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00194835  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0318  small GTP-binding protein domain-containing protein  42.99 
 
 		 402 aa  353  2.9999999999999997e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0165  small GTP-binding protein  41.55 
 
 		 427 aa  353  4e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2081  small GTP-binding protein  45.21 
 
 		 416 aa  349  7e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000627073  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0473  small GTP-binding protein  45.54 
 
 		 403 aa  348  9e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0038153  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0683  small GTP-binding protein  44.65 
 
 		 408 aa  348  1e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00203334  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0183  small GTP-binding protein  43.02 
 
 		 408 aa  345  1e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1277  small GTP-binding protein domain-containing protein  43.02 
 
 		 405 aa  342  5e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.038791  hitchhiker  0.00000385407 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1243  small GTP-binding protein  41.91 
 
 		 425 aa  342  9e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0705  small GTP-binding protein  40.68 
 
 		 412 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.131335  hitchhiker  0.000692522 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2276  small GTP-binding protein domain-containing protein  41.65 
 
 		 400 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1494  small GTP-binding protein  43.22 
 
 		 412 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3256  small GTP-binding protein  40.91 
 
 		 412 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00305193  hitchhiker  0.00001491 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1629  GTPases  42.2 
 
 		 416 aa  336  5.999999999999999e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000232915  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1843  small GTP-binding protein  42.89 
 
 		 422 aa  334  2e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16490  iron-only hydrogenase maturation protein HydF  40.23 
 
 		 416 aa  332  7.000000000000001e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.520712  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2638  small GTP-binding protein  43.36 
 
 		 394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3926  GTP-binding protein  41.63 
 
 		 394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0042  small GTP-binding protein  41.46 
 
 		 400 aa  319  7.999999999999999e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1387  small GTP-binding protein  38.58 
 
 		 410 aa  309  6.999999999999999e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0637341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0475  small GTP-binding protein  37.1 
 
 		 404 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0490  small GTP-binding protein  37.1 
 
 		 404 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0245  small GTP-binding protein  38.25 
 
 		 403 aa  282  1e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31412  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1501  small GTP-binding protein  35.62 
 
 		 408 aa  272  7e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.206775  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  35.94 
 
 		 398 aa  266  4e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1361  small GTP-binding protein  35.33 
 
 		 396 aa  260  4e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.311924  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0272  small GTP-binding protein  36.26 
 
 		 382 aa  253  7e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.934792  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0266  small GTP-binding protein  35.19 
 
 		 377 aa  205  1e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.410874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1098  small GTP-binding protein domain-containing protein  42.05 
 
 		 262 aa  152  1e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1965  tRNA modification GTPase TrmE  31.1 
 
 		 468 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0392  GTP-binding protein EngA  40.57 
 
 		 494 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1766  small GTP-binding protein  34.21 
 
 		 184 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1477  GTP-binding protein EngA  34.21 
 
 		 454 aa  68.2  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0886  tRNA modification GTPase TrmE  26.7 
 
 		 478 aa  67.4  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00940326 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0062  GTP-binding protein EngA  34.29 
 
 		 455 aa  67  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0777  GTP-binding protein EngA  40.38 
 
 		 462 aa  64.7  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0193  GTP-binding protein EngA  35.33 
 
 		 495 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2472  tRNA modification GTPase TrmE  28.21 
 
 		 487 aa  64.7  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000689916 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3610  tRNA modification GTPase TrmE  29.93 
 
 		 475 aa  64.7  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  29.95 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  31.62 
 
 		 461 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3456  tRNA modification GTPase TrmE  29.61 
 
 		 481 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2632  small GTP-binding protein  31.88 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1753  ribosome-associated GTPase EngA  38.3 
 
 		 477 aa  63.9  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1029  small GTP-binding protein  34.21 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3456  tRNA modification GTPase TrmE  29.93 
 
 		 475 aa  63.9  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1758  small GTP-binding protein  32.14 
 
 		 448 aa  63.5  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0005  tRNA modification GTPase TrmE  28.89 
 
 		 481 aa  63.2  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75194  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3755  tRNA modification GTPase TrmE  29.61 
 
 		 481 aa  63.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  36.26 
 
 		 447 aa  62.4  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1339  GTP-binding protein EngA  37.86 
 
 		 463 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0764  GTP-binding protein EngA  25.89 
 
 		 437 aa  63.2  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000517804  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  31.91 
 
 		 305 aa  62.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2103  GTP-binding protein EngA  27.75 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03489  tRNA modification GTPase TrmE  30.15 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2263  GTP-binding protein EngA  30.56 
 
 		 506 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0915  small GTP-binding protein  33.68 
 
 		 184 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.793666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  34.69 
 
 		 460 aa  62  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2342  small GTP-binding protein  29.52 
 
 		 448 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4509  small GTP-binding protein domain-containing protein  33.09 
 
 		 457 aa  61.6  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02181  tRNA modification GTPase TrmE  38.24 
 
 		 461 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  32.09 
 
 		 473 aa  60.8  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0053  GTP-binding protein EngA  38.3 
 
 		 460 aa  60.5  0.00000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  32.09 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2180  tRNA modification GTPase TrmE  32.16 
 
 		 472 aa  60.5  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2393  small GTP-binding protein  32.86 
 
 		 448 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1186  GTP-binding protein EngA  37.5 
 
 		 461 aa  60.5  0.00000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3709  small GTP-binding protein  30.72 
 
 		 462 aa  60.5  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0876  tRNA modification GTPase TrmE  27.57 
 
 		 518 aa  59.3  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0947  small GTP-binding protein  32.09 
 
 		 184 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.445595  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0409  GTP-binding protein EngA  35.42 
 
 		 460 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0435  GTP-binding protein EngA  35.42 
 
 		 460 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3787  GTP-binding protein Era  25.96 
 
 		 468 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.0434052 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1572  GTP-binding protein EngA  35.42 
 
 		 460 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  35.37 
 
 		 458 aa  59.7  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3751  GTP-binding protein EngA  30.66 
 
 		 449 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6368  tRNA modification GTPase TrmE  31.58 
 
 		 455 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1506  GTP-binding protein Era  29.41 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.094805  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2148  small GTP-binding protein  53.12 
 
 		 495 aa  58.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3839  small GTP-binding protein  29.57 
 
 		 481 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.674432 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73400  tRNA modification GTPase TrmE  31.58 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000503354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4041  tRNA modification GTPase TrmE  37 
 
 		 449 aa  58.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.934487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1224  ribosome-associated GTPase EngA  29.53 
 
 		 447 aa  58.2  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  28.86 
 
 		 463 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1876  GTP-binding protein EngA  30.6 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.900999 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0536  GTP-binding protein EngA  34.21 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf303  GTP-binding protein EngA  28.11 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.778638  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2143  tRNA modification GTPase TrmE  28.47 
 
 		 478 aa  57.8  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0104732  hitchhiker  0.000152188 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  25.49 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1159  GTP-binding protein EngA  28.83 
 
 		 436 aa  57.8  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427593  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4633  GTP-binding protein EngA  32.65 
 
 		 511 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4133  tRNA modification GTPase TrmE  33.08 
 
 		 456 aa  57.8  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2387  tRNA modification GTPase TrmE  31.63 
 
 		 465 aa  57.8  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.188748  hitchhiker  0.000106684 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4619  tRNA modification GTPase TrmE  30.08 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>