More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1477 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1477  GTP-binding protein EngA  100 
 
 
454 aa  924    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2263  GTP-binding protein EngA  64.55 
 
 
506 aa  619  1e-176  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0193  GTP-binding protein EngA  61.87 
 
 
495 aa  616  1e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0062  GTP-binding protein EngA  63.92 
 
 
455 aa  586  1e-166  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0504  GTP-binding protein EngA  51.66 
 
 
441 aa  444  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0192  GTP-binding protein EngA  46.7 
 
 
445 aa  410  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1406  GTP-binding protein EngA  40.4 
 
 
439 aa  330  2e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0340673  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1630  small GTP-binding protein  38.39 
 
 
440 aa  325  1e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.52918  hitchhiker  0.00197431 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10530  small GTP-binding protein  39.33 
 
 
438 aa  325  1e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1160  GTP-binding protein EngA  40.09 
 
 
439 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0769833  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2108  GTP-binding protein EngA  40 
 
 
443 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000750275  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1177  GTP-binding protein  39.34 
 
 
441 aa  314  2.9999999999999996e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1204  GTP-binding protein EngA  39.51 
 
 
442 aa  313  4.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.109244  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  38.9 
 
 
441 aa  312  9e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1458  GTP-binding protein EngA  37.2 
 
 
445 aa  312  1e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548717  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  40.8 
 
 
444 aa  311  1e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  40 
 
 
438 aa  310  2e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0223  small GTP-binding protein  40.04 
 
 
440 aa  311  2e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294804  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1395  GTP-binding protein EngA  38.6 
 
 
441 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  37.53 
 
 
441 aa  310  5e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  39.33 
 
 
441 aa  309  5.9999999999999995e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3587  small GTP-binding protein  39.07 
 
 
495 aa  308  1.0000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.748458  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1809  small GTP-binding protein  39.46 
 
 
446 aa  307  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000018958  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1024  GTP-binding protein EngA  37.42 
 
 
440 aa  306  6e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127427  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2134  GTP-binding protein EngA  39.64 
 
 
458 aa  305  7e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0583205  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2146  GTP-binding protein EngA  39.21 
 
 
493 aa  306  7e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2045  GTP-binding protein EngA  37.81 
 
 
464 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1172  small GTP-binding protein  40.13 
 
 
438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2126  GTP-binding protein EngA  39.37 
 
 
449 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.127058  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1227  GTP-binding protein EngA  37.53 
 
 
436 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.718862  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2159  GTP-binding protein EngA  37.67 
 
 
436 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000018961  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3526  GTP-binding protein EngA  38.77 
 
 
494 aa  303  5.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.928011 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3106  GTP-binding protein EngA  39.54 
 
 
479 aa  303  5.000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.564911 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1075  small GTP-binding protein  38.27 
 
 
438 aa  303  6.000000000000001e-81  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  38.53 
 
 
438 aa  301  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2896  GTP-binding protein EngA  37.74 
 
 
453 aa  301  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0739755  hitchhiker  0.000158888 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2292  GTP-binding protein EngA  39.23 
 
 
465 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0406895  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1654  GTP-binding protein EngA  39.23 
 
 
465 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1360  small GTP-binding protein  36.53 
 
 
445 aa  300  4e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.508315  hitchhiker  0.00000394324 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1598  GTP-binding protein EngA  37.53 
 
 
436 aa  300  5e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000589883 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1631  GTP-binding protein EngA  37.53 
 
 
436 aa  300  5e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1414  GTP-binding protein EngA  37.53 
 
 
436 aa  300  5e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1386  GTP-binding protein EngA  37.53 
 
 
436 aa  300  5e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.844345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1386  GTP-binding protein EngA  37.53 
 
 
436 aa  300  5e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0845142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1525  GTP-binding protein EngA  37.53 
 
 
436 aa  300  5e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1559  GTP-binding protein EngA  37.53 
 
 
436 aa  300  5e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0922672  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1686  GTP-binding protein EngA  38.12 
 
 
460 aa  300  5e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0325003  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  37.56 
 
 
438 aa  300  5e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  37.56 
 
 
438 aa  300  5e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1667  GTP-binding protein EngA  37.53 
 
 
436 aa  300  5e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2204  GTP-binding protein EngA  39.23 
 
 
465 aa  299  6e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199328  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  38.14 
 
 
439 aa  298  9e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1758  small GTP-binding protein  39.64 
 
 
448 aa  298  1e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3785  GTP-binding protein EngA  36.85 
 
 
436 aa  298  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0456792  normal  0.0699486 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3149  GTP-binding protein EngA  36.44 
 
 
441 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.421281  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1428  GTP-binding protein EngA  36.63 
 
 
436 aa  298  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2632  small GTP-binding protein  38.79 
 
 
434 aa  297  3e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0885  GTP-binding protein EngA  37.23 
 
 
452 aa  297  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0460  GTP-binding protein EngA  36.85 
 
 
436 aa  296  5e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2545  GTP-binding protein EngA  39.87 
 
 
458 aa  295  8e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0752  GTP-binding protein EngA  37.97 
 
 
440 aa  295  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00177757 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3505  GTP-binding protein EngA  38.63 
 
 
459 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0442058  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3492  small GTP-binding protein  36.65 
 
 
473 aa  295  1e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.166224 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44322  predicted protein  39.41 
 
 
555 aa  295  1e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00480829  normal  0.0297324 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0737  GTP-binding protein EngA  37.42 
 
 
440 aa  293  4e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1662  GTP-binding protein EngA  39.33 
 
 
465 aa  293  5e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.908743  normal  0.0937106 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1224  ribosome-associated GTPase EngA  39.87 
 
 
447 aa  293  6e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1727  GTP-binding protein EngA  39.2 
 
 
448 aa  293  6e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0916  small GTP-binding protein  34.37 
 
 
439 aa  292  7e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.704291  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3566  ribosome-associated GTPase EngA  36.4 
 
 
454 aa  292  7e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.173152  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0121  GTP-binding protein EngA  37.97 
 
 
452 aa  292  8e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2028  GTP-binding protein EngA  36.76 
 
 
455 aa  292  8e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.89204  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0118  GTP-binding protein EngA  37.97 
 
 
452 aa  292  8e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.132129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3776  GTP-binding protein EngA  38.31 
 
 
456 aa  292  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350234  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3005  GTP-binding protein EngA  37.42 
 
 
460 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.325  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1937  GTP-binding protein EngA  38.83 
 
 
449 aa  290  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  35.57 
 
 
439 aa  290  3e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1609  GTP-binding protein EngA  38.83 
 
 
449 aa  290  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0528486 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2279  GTP-binding protein EngA  37.58 
 
 
460 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0830899  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1614  GTP-binding protein EngA  38.31 
 
 
499 aa  290  4e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106208 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2155  GTP-binding protein EngA  39.43 
 
 
471 aa  290  4e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.616734  normal  0.133544 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0644  GTP-binding protein EngA  36.03 
 
 
455 aa  290  5.0000000000000004e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04431  GTP-binding protein EngA  35.31 
 
 
456 aa  290  5.0000000000000004e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0422674  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2858  small GTP-binding protein protein  37.5 
 
 
467 aa  289  7e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0596  GTP-binding protein EngA  39.17 
 
 
467 aa  289  8e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115321  hitchhiker  0.00000000000000451977 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1043  GTP-binding protein EngA  35.79 
 
 
436 aa  288  1e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.617691  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04795  GTP-binding protein EngA  37.56 
 
 
434 aa  288  1e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0751  GTP-binding protein EngA  35.63 
 
 
440 aa  288  1e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0333  GTP-binding protein EngA  35.59 
 
 
453 aa  288  1e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01058  GTP-binding protein EngA  38.72 
 
 
465 aa  288  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189601  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1726  GTP-binding protein EngA  35.09 
 
 
456 aa  287  2e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2390  GTP-binding protein EngA  38.2 
 
 
441 aa  288  2e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000149599  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06108  GTP-binding protein EngA  38.72 
 
 
465 aa  288  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0692336  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3386  GTP-binding protein EngA  38.34 
 
 
442 aa  288  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2886  GTP-binding protein EngA  35.74 
 
 
490 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000684219  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1369  GTP-binding protein EngA  37.25 
 
 
434 aa  287  2.9999999999999996e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.911808  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1879  GTP-binding protein EngA  37.95 
 
 
437 aa  286  4e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2203  ribosome-associated GTPase EngA  38.89 
 
 
567 aa  286  5.999999999999999e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1131  GTP-binding protein EngA  37.05 
 
 
473 aa  286  5.999999999999999e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02365  hypothetical protein  35.74 
 
 
490 aa  286  7e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00134909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>