More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0504 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0504  GTP-binding protein EngA  100 
 
 
441 aa  889    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0192  GTP-binding protein EngA  56.92 
 
 
445 aa  508  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0062  GTP-binding protein EngA  50.33 
 
 
455 aa  457  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2263  GTP-binding protein EngA  50.62 
 
 
506 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1477  GTP-binding protein EngA  51.66 
 
 
454 aa  434  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0193  GTP-binding protein EngA  46.31 
 
 
495 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  43.76 
 
 
444 aa  340  2e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1160  GTP-binding protein EngA  41.99 
 
 
439 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0769833  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  40.45 
 
 
439 aa  334  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10530  small GTP-binding protein  41.78 
 
 
438 aa  333  4e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  41.14 
 
 
438 aa  332  5e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1630  small GTP-binding protein  41.26 
 
 
440 aa  331  2e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.52918  hitchhiker  0.00197431 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  43.67 
 
 
438 aa  331  2e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1809  small GTP-binding protein  39.91 
 
 
446 aa  330  3e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000018958  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2108  GTP-binding protein EngA  40.91 
 
 
443 aa  328  8e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000750275  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0223  small GTP-binding protein  41.46 
 
 
440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294804  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  39.37 
 
 
438 aa  326  6e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  39.37 
 
 
438 aa  326  6e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  42.12 
 
 
441 aa  325  8.000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1498  GTP-binding protein EngA  40 
 
 
462 aa  323  3e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1406  GTP-binding protein EngA  41.36 
 
 
439 aa  323  5e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0340673  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1169  GTP-binding protein EngA  41.31 
 
 
433 aa  322  6e-87  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.306254 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1485  GTP-binding protein EngA  39.77 
 
 
462 aa  322  9.999999999999999e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2126  GTP-binding protein EngA  40.23 
 
 
449 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.127058  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2159  GTP-binding protein EngA  40.45 
 
 
436 aa  320  3e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000018961  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1024  GTP-binding protein EngA  40.09 
 
 
440 aa  318  2e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127427  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  38.58 
 
 
441 aa  317  2e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0752  GTP-binding protein EngA  39.09 
 
 
440 aa  317  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00177757 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1458  GTP-binding protein EngA  40.23 
 
 
445 aa  317  2e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548717  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0460  GTP-binding protein EngA  40 
 
 
436 aa  317  3e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1172  small GTP-binding protein  41.91 
 
 
438 aa  317  4e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2203  ribosome-associated GTPase EngA  40.23 
 
 
567 aa  316  5e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2896  GTP-binding protein EngA  40.13 
 
 
453 aa  315  7e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0739755  hitchhiker  0.000158888 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0737  GTP-binding protein EngA  38.86 
 
 
440 aa  315  8e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1227  GTP-binding protein EngA  39.23 
 
 
436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.718862  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3526  GTP-binding protein EngA  41.81 
 
 
494 aa  314  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.928011 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3587  small GTP-binding protein  42.05 
 
 
495 aa  313  2.9999999999999996e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.748458  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1438  GTP-binding protein EngA  39 
 
 
471 aa  313  4.999999999999999e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.432419  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1224  ribosome-associated GTPase EngA  42.31 
 
 
447 aa  312  5.999999999999999e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3149  GTP-binding protein EngA  38.18 
 
 
441 aa  311  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.421281  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1727  GTP-binding protein EngA  40.68 
 
 
448 aa  311  1e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0596  GTP-binding protein EngA  40.81 
 
 
467 aa  311  2e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115321  hitchhiker  0.00000000000000451977 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1360  small GTP-binding protein  38.6 
 
 
445 aa  311  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.508315  hitchhiker  0.00000394324 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  40.68 
 
 
441 aa  310  4e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1614  GTP-binding protein EngA  39.73 
 
 
499 aa  309  5e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106208 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2146  GTP-binding protein EngA  41.5 
 
 
493 aa  309  5.9999999999999995e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1561  GTP-binding protein EngA  39.73 
 
 
453 aa  309  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.53751  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1631  GTP-binding protein EngA  39 
 
 
436 aa  308  8e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1620  GTP-binding protein EngA  39.73 
 
 
436 aa  308  8e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1414  GTP-binding protein EngA  39 
 
 
436 aa  308  9e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1386  GTP-binding protein EngA  39 
 
 
436 aa  308  9e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.844345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1386  GTP-binding protein EngA  39 
 
 
436 aa  308  9e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0845142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1525  GTP-binding protein EngA  39 
 
 
436 aa  308  9e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1598  GTP-binding protein EngA  39 
 
 
436 aa  308  9e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000589883 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1667  GTP-binding protein EngA  39 
 
 
436 aa  308  9e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1559  GTP-binding protein EngA  39 
 
 
436 aa  308  9e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0922672  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1131  GTP-binding protein EngA  37.75 
 
 
473 aa  307  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2632  small GTP-binding protein  40.14 
 
 
434 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0822  small GTP-binding protein domain-containing protein  41.76 
 
 
464 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.460708  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1758  small GTP-binding protein  40.81 
 
 
448 aa  306  6e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5109  GTP-binding protein EngA  38.78 
 
 
445 aa  306  6e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314704  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0644  GTP-binding protein EngA  37.33 
 
 
455 aa  306  7e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1075  small GTP-binding protein  38.76 
 
 
438 aa  306  7e-82  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1598  GTP-binding protein EngA  39.23 
 
 
445 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111864  normal  0.122269 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1428  GTP-binding protein EngA  38.32 
 
 
436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1746  GTP-binding protein EngA  38.78 
 
 
445 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0359  GTP-binding protein EngA  39.15 
 
 
436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3785  GTP-binding protein EngA  38.32 
 
 
436 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0456792  normal  0.0699486 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2537  GTP-binding protein EngA  39 
 
 
445 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358302  hitchhiker  0.0000595621 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1719  GTP-binding protein EngA  38.78 
 
 
445 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.576586 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6271  GTP-binding protein EngA  38.55 
 
 
445 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1832  GTP-binding protein EngA  38.55 
 
 
445 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1808  GTP-binding protein EngA  38.55 
 
 
445 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2134  GTP-binding protein EngA  38.88 
 
 
458 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0583205  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2892  GTPase family protein  37.87 
 
 
463 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1609  GTP-binding protein EngA  40.14 
 
 
449 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0528486 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1937  GTP-binding protein EngA  40.14 
 
 
449 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1043  GTP-binding protein EngA  37.99 
 
 
436 aa  303  4.0000000000000003e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.617691  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2028  GTP-binding protein EngA  37.13 
 
 
455 aa  303  5.000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.89204  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  39.12 
 
 
439 aa  302  8.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0751  GTP-binding protein EngA  39.23 
 
 
440 aa  302  9e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01058  GTP-binding protein EngA  41.08 
 
 
465 aa  301  1e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189601  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004345  GTP-binding protein EngA  38.59 
 
 
498 aa  301  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06108  GTP-binding protein EngA  41.08 
 
 
465 aa  301  1e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0692336  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2045  GTP-binding protein EngA  38.41 
 
 
464 aa  301  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0292  GTP-binding protein EngA  37.82 
 
 
494 aa  301  2e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1759  GTP-binding protein EngA  37.7 
 
 
473 aa  300  2e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739039 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21511  GTP-binding protein EngA  37.78 
 
 
461 aa  300  4e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0916  small GTP-binding protein  37.81 
 
 
439 aa  300  4e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.704291  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04431  GTP-binding protein EngA  37.25 
 
 
456 aa  299  5e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0422674  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1467  GTP-binding protein EngA  37.87 
 
 
445 aa  300  5e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496612  normal  0.453892 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2858  small GTP-binding protein protein  37.25 
 
 
467 aa  299  5e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01071  GTP-binding protein EngA  38.17 
 
 
498 aa  299  6e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0733  GTP-binding protein EngA  37.66 
 
 
500 aa  299  8e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2143  GTP-binding protein EngA  39.23 
 
 
437 aa  298  9e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1726  GTP-binding protein EngA  37.02 
 
 
456 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2238  GTP-binding protein EngA  38.55 
 
 
445 aa  298  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.746998  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1416  GTP-binding protein EngA  38.46 
 
 
446 aa  297  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000592606 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3566  ribosome-associated GTPase EngA  39.01 
 
 
454 aa  298  2e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.173152  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1291  GTP-binding protein EngA  38.88 
 
 
436 aa  297  2e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0244351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>