More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3103 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3103  small GTP-binding protein  100 
 
 		 396 aa  802    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2638  small GTP-binding protein  53.83 
 
 		 394 aa  434  1e-120  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0146  small GTP-binding protein  52.54 
 
 		 398 aa  403  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0325934  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0318  small GTP-binding protein domain-containing protein  50.13 
 
 		 402 aa  391  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19310  small GTP-binding protein  49.75 
 
 		 411 aa  385  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00194835  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1629  GTPases  49.74 
 
 		 416 aa  381  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000232915  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1494  small GTP-binding protein  49.49 
 
 		 412 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1569  small GTP-binding protein  51.26 
 
 		 407 aa  378  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.627873  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0683  small GTP-binding protein  48.09 
 
 		 408 aa  375  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00203334  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0103  GTP-binding protein  46.77 
 
 		 440 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000228129  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1277  small GTP-binding protein domain-containing protein  48.09 
 
 		 405 aa  373  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.038791  hitchhiker  0.00000385407 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0106  GTP-binding protein  46.54 
 
 		 440 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1243  small GTP-binding protein  45.71 
 
 		 425 aa  372  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0165  small GTP-binding protein  45.69 
 
 		 427 aa  369  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0042  small GTP-binding protein  46.58 
 
 		 400 aa  366  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1843  small GTP-binding protein  47.72 
 
 		 422 aa  366  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0183  small GTP-binding protein  46.1 
 
 		 408 aa  364  1e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0473  small GTP-binding protein  47.7 
 
 		 403 aa  361  1e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0038153  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2152  small GTP-binding protein  45.09 
 
 		 409 aa  353  2e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2276  small GTP-binding protein domain-containing protein  44.02 
 
 		 400 aa  348  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0705  small GTP-binding protein  45.55 
 
 		 412 aa  345  5e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.131335  hitchhiker  0.000692522 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2081  small GTP-binding protein  44.22 
 
 		 416 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000627073  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3256  small GTP-binding protein  45.55 
 
 		 412 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00305193  hitchhiker  0.00001491 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3926  GTP-binding protein  44.96 
 
 		 394 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1387  small GTP-binding protein  43.32 
 
 		 410 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0637341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16490  iron-only hydrogenase maturation protein HydF  41.71 
 
 		 416 aa  331  1e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.520712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0272  small GTP-binding protein  46.55 
 
 		 382 aa  325  9e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.934792  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0490  small GTP-binding protein  40.41 
 
 		 404 aa  318  2e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0475  small GTP-binding protein  40.41 
 
 		 404 aa  318  2e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0245  small GTP-binding protein  40.57 
 
 		 403 aa  306  3e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31412  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  41.56 
 
 		 398 aa  303  4.0000000000000003e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1361  small GTP-binding protein  39.85 
 
 		 396 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.311924  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1501  small GTP-binding protein  39.49 
 
 		 408 aa  281  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.206775  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0266  small GTP-binding protein  37.27 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.410874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1098  small GTP-binding protein domain-containing protein  41.97 
 
 		 262 aa  171  3e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4469  tRNA modification GTPase TrmE  33.33 
 
 		 464 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0533201 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3984  tRNA modification GTPase TrmE  32.72 
 
 		 464 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3152  tRNA modification GTPase TrmE  29.84 
 
 		 464 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000246642 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2547  tRNA modification GTPase TrmE  29.84 
 
 		 464 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0461446  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3161  tRNA modification GTPase TrmE  29.84 
 
 		 464 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.399046  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4200  tRNA modification GTPase TrmE  33.74 
 
 		 448 aa  77.4  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0153583 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0392  GTP-binding protein EngA  30.72 
 
 		 494 aa  77  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3179  tRNA modification GTPase TrmE  29.84 
 
 		 464 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0373252  hitchhiker  0.000409063 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2707  tRNA modification GTPase TrmE  33.73 
 
 		 466 aa  77  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622975  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6518  tRNA modification GTPase TrmE  29.32 
 
 		 464 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3097  tRNA modification GTPase TrmE  29.84 
 
 		 464 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151562  normal  0.0117151 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3073  tRNA modification GTPase TrmE  33.12 
 
 		 446 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2472  tRNA modification GTPase TrmE  30.16 
 
 		 487 aa  75.5  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000689916 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3213  tRNA modification GTPase TrmE  29.84 
 
 		 489 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2084  tRNA modification GTPase TrmE  31.14 
 
 		 457 aa  75.9  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.103263  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3233  tRNA modification GTPase TrmE  31.71 
 
 		 467 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0132  tRNA modification GTPase TrmE  33.54 
 
 		 452 aa  74.7  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.849325  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0876  tRNA modification GTPase TrmE  34.13 
 
 		 518 aa  74.3  0.000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2929  tRNA modification GTPase TrmE  33.76 
 
 		 446 aa  73.9  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3096  tRNA modification GTPase TrmE  28.65 
 
 		 466 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000134747 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2143  tRNA modification GTPase TrmE  29.63 
 
 		 478 aa  72.4  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0104732  hitchhiker  0.000152188 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1753  ribosome-associated GTPase EngA  29.71 
 
 		 477 aa  72.8  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04098  tRNA modification GTPase  32.95 
 
 		 462 aa  72  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  30.57 
 
 		 475 aa  71.6  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3610  tRNA modification GTPase TrmE  32.6 
 
 		 475 aa  71.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  33.54 
 
 		 461 aa  70.5  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2498  GTP-binding protein EngA  32.54 
 
 		 602 aa  70.1  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02641  tRNA modification GTPase TrmE  34.34 
 
 		 464 aa  70.5  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1458  GTP-binding protein EngA  32.54 
 
 		 445 aa  69.7  0.00000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548717  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1766  small GTP-binding protein  35.9 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  34.81 
 
 		 458 aa  69.3  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3395  tRNA modification GTPase TrmE  30.49 
 
 		 467 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.408647  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1556  tRNA modification GTPase TrmE  34.94 
 
 		 464 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0111  tRNA modification GTPase TrmE  30.49 
 
 		 467 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0307  tRNA modification GTPase TrmE  30.49 
 
 		 467 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1029  small GTP-binding protein  35.9 
 
 		 184 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0062  GTP-binding protein EngA  32.52 
 
 		 455 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0751  GTP-binding protein EngA  32.95 
 
 		 440 aa  69.3  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0096  tRNA modification GTPase TrmE  30.49 
 
 		 467 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0915  small GTP-binding protein  36.54 
 
 		 184 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.793666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  29.14 
 
 		 301 aa  69.3  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1477  GTP-binding protein EngA  30.36 
 
 		 454 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  32.12 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2824  tRNA modification GTPase TrmE  30.63 
 
 		 446 aa  68.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2842  tRNA modification GTPase TrmE  30.49 
 
 		 488 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00155334  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2243  tRNA modification GTPase TrmE  30.49 
 
 		 488 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3547  tRNA modification GTPase TrmE  30.49 
 
 		 488 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3038  tRNA modification GTPase TrmE  31.58 
 
 		 448 aa  67.8  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.38062  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0005  tRNA modification GTPase TrmE  29.34 
 
 		 481 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75194  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0789  small GTP-binding protein  34.73 
 
 		 443 aa  67.8  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000826073  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0750  GTP-binding protein EngA  31.28 
 
 		 451 aa  67.8  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524371  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2775  tRNA modification GTPase TrmE  28.57 
 
 		 452 aa  67.8  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  36.07 
 
 		 447 aa  67.8  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4263  tRNA modification GTPase TrmE  30.25 
 
 		 454 aa  67.8  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226045  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5298  tRNA modification GTPase TrmE  29.14 
 
 		 471 aa  67.4  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  31.25 
 
 		 441 aa  67.4  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  33.94 
 
 		 454 aa  67.4  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0764  GTP-binding protein EngA  29.52 
 
 		 437 aa  67.4  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000517804  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0947  small GTP-binding protein  35.67 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.445595  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73400  tRNA modification GTPase TrmE  32.08 
 
 		 455 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000503354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4292  tRNA modification GTPase TrmE  30.25 
 
 		 454 aa  67.4  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4619  tRNA modification GTPase TrmE  30.82 
 
 		 455 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6368  tRNA modification GTPase TrmE  32.08 
 
 		 455 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  31.17 
 
 		 459 aa  67  0.0000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4241  tRNA modification GTPase TrmE  31.95 
 
 		 469 aa  67  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>