More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1766 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1766  small GTP-binding protein  100 
 
 		 184 aa  367  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1029  small GTP-binding protein  98.37 
 
 		 184 aa  362  1e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0915  small GTP-binding protein  97.28 
 
 		 184 aa  360  4e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.793666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0947  small GTP-binding protein  84.78 
 
 		 184 aa  317  7e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.445595  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0351  small GTP-binding protein  67.21 
 
 		 189 aa  259  1e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0271058  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1458  GTP-binding protein EngA  30.73 
 
 		 445 aa  79  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548717  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3103  small GTP-binding protein  35.9 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0103  GTP-binding protein  34.21 
 
 		 440 aa  67.8  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000228129  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1243  small GTP-binding protein  34.08 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0106  GTP-binding protein  33.16 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6613  GTP-binding protein Era  29.17 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0683  small GTP-binding protein  31.67 
 
 		 408 aa  65.5  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00203334  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0208  GTP-binding protein Era  26.44 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1851  GTP-binding protein Era  27.43 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7362  GTP-binding protein Era  28.49 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448501  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  28.32 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16490  iron-only hydrogenase maturation protein HydF  32.14 
 
 		 416 aa  62.4  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.520712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  29.07 
 
 		 459 aa  62.4  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3591  GTP-binding protein Era  25.7 
 
 		 308 aa  62.4  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0548  tRNA modification GTPase TrmE  33.58 
 
 		 442 aa  62  0.000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1758  small GTP-binding protein  30.81 
 
 		 448 aa  61.6  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  26.7 
 
 		 451 aa  61.6  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  30.06 
 
 		 458 aa  61.2  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0577  GTP-binding protein EngA  29.57 
 
 		 435 aa  61.2  0.000000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.416412  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0137  tRNA modification GTPase TrmE  27.94 
 
 		 457 aa  60.8  0.000000009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  29.05 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0490  small GTP-binding protein  31.82 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0475  small GTP-binding protein  31.82 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0053  GTP-binding protein EngA  32.43 
 
 		 460 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2081  small GTP-binding protein  29.19 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000627073  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1369  GTP-binding protein EngA  28.25 
 
 		 434 aa  58.9  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.911808  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  24.58 
 
 		 436 aa  58.9  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0490  small GTP-binding protein  32.73 
 
 		 429 aa  58.9  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1617  GTP-binding protein EngA  27.27 
 
 		 460 aa  58.9  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0750  GTP-binding protein EngA  28.41 
 
 		 451 aa  58.9  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524371  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0743  GTP-binding protein Era  27.07 
 
 		 294 aa  58.5  0.00000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3568  GTP-binding protein EngA  25.14 
 
 		 455 aa  58.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  29.48 
 
 		 458 aa  58.5  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1323  GTP-binding protein Era  28.08 
 
 		 298 aa  58.5  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0411499  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1277  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.25 
 
 		 405 aa  58.2  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.038791  hitchhiker  0.00000385407 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0027  tRNA modification GTPase TrmE  25.53 
 
 		 454 aa  58.2  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3233  tRNA modification GTPase TrmE  28.68 
 
 		 467 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3096  tRNA modification GTPase TrmE  28.36 
 
 		 466 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000134747 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  27.62 
 
 		 438 aa  57.8  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  27.62 
 
 		 438 aa  57.8  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1738  GTP-binding protein Era  24.48 
 
 		 329 aa  57.8  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.355873  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0371  GTP-binding protein Era  23.28 
 
 		 307 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  24.72 
 
 		 464 aa  57  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0808  GTP-binding protein Era  32.58 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0789  small GTP-binding protein  27.68 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000826073  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0319  small GTP-binding protein  27.23 
 
 		 464 aa  57.4  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.236663 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0460  GTP-binding protein EngA  28.49 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1159  GTP-binding protein EngA  31.1 
 
 		 436 aa  57  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427593  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1338  GTP-binding protein EngA  30.82 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.53279  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09700  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  26.2 
 
 		 438 aa  57  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.253075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0990  GTP-binding protein Era  28.92 
 
 		 310 aa  57  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1227  GTP-binding protein EngA  28.32 
 
 		 436 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.718862  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0165  small GTP-binding protein  30.43 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0999  GTP-binding protein Era  32.14 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17106  normal  0.215056 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1428  GTP-binding protein EngA  29.59 
 
 		 436 aa  56.6  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.49 
 
 		 493 aa  56.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  33.33 
 
 		 447 aa  56.2  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11728  GTP-binding protein EngA  29.34 
 
 		 463 aa  57  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000105319  normal  0.501933 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2276  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.97 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1841  ferrous iron transport protein B  25.54 
 
 		 769 aa  56.2  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.547404  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0392  GTP-binding protein EngA  26.63 
 
 		 494 aa  56.2  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1075  small GTP-binding protein  31.72 
 
 		 438 aa  56.2  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2973  GTP-binding protein Era  26.19 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2652  GTP-binding protein Era  27.38 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0337857 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3610  tRNA modification GTPase TrmE  27.14 
 
 		 475 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  25.57 
 
 		 449 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1172  small GTP-binding protein  29.63 
 
 		 438 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4292  tRNA modification GTPase TrmE  26.47 
 
 		 454 aa  57  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1152  GTP-binding protein Era  29.05 
 
 		 313 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3785  GTP-binding protein EngA  28.57 
 
 		 436 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0456792  normal  0.0699486 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0764  GTP-binding protein EngA  27.01 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000517804  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3005  GTP-binding protein EngA  28.49 
 
 		 490 aa  55.8  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.198767  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1631  GTP-binding protein EngA  29.59 
 
 		 436 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1667  GTP-binding protein EngA  29.59 
 
 		 436 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1559  GTP-binding protein EngA  29.59 
 
 		 436 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0922672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1414  GTP-binding protein EngA  29.59 
 
 		 436 aa  55.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1386  GTP-binding protein EngA  29.59 
 
 		 436 aa  55.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.844345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1386  GTP-binding protein EngA  29.59 
 
 		 436 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0845142  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4615  tRNA modification GTPase TrmE  26.74 
 
 		 454 aa  56.2  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1525  GTP-binding protein EngA  29.59 
 
 		 436 aa  55.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1348  GTP-binding protein EngA  30.34 
 
 		 439 aa  55.8  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.124719  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  26.59 
 
 		 458 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1506  GTP-binding protein Era  25.97 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.094805  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0951  GTP-binding protein Era  25 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  29.14 
 
 		 439 aa  55.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4263  tRNA modification GTPase TrmE  26.06 
 
 		 454 aa  55.8  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226045  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0146  small GTP-binding protein  29.61 
 
 		 398 aa  56.2  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0325934  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3778  small GTP-binding protein  26.09 
 
 		 433 aa  56.2  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1598  GTP-binding protein EngA  29.59 
 
 		 436 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000589883 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1793  GTP-binding protein Era  26.57 
 
 		 307 aa  55.5  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000375473  normal  0.0439993 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2927  GTP-binding protein EngA  29.08 
 
 		 471 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0692  GTP-binding protein EngA  26.47 
 
 		 470 aa  55.8  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  28.72 
 
 		 441 aa  55.5  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0096  tRNA modification GTPase TrmE  28.36 
 
 		 467 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0111  tRNA modification GTPase TrmE  28.36 
 
 		 467 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>