More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1841 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3855  hypothetical protein  44.86 
 
 		 776 aa  675    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107886  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2517  ferrous iron transport protein B  44.87 
 
 		 764 aa  657    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.487661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0169  ferrous iron transport protein B  43.19 
 
 		 778 aa  638    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1818  Fe2+ transport system protein B  45.11 
 
 		 770 aa  654    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.375819  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0623  ferrous iron transport protein B  44.39 
 
 		 783 aa  644    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.626283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1841  ferrous iron transport protein B  100 
 
 		 769 aa  1582    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.547404  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2470  ferrous iron transport protein B  45.59 
 
 		 786 aa  664    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2690  ferrous iron transport protein B  46.26 
 
 		 764 aa  668    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.878145  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3122  ferrous iron transport protein B  44.4 
 
 		 764 aa  647    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000440223 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0754  ferrous iron transport protein B  42.65 
 
 		 786 aa  647    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0018483  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2071  ferrous iron transport protein B  46.54 
 
 		 774 aa  676    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1933  ferrous iron transport protein B  46.16 
 
 		 774 aa  676    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.651093  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0465  ferrous iron transport protein B  45.9 
 
 		 770 aa  664    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1664  ferrous iron transport protein B  43.23 
 
 		 758 aa  634  1e-180  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1481  ferrous iron transport protein B  43.29 
 
 		 764 aa  629  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.725722  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2759  ferrous iron transport protein B  43.24 
 
 		 764 aa  623  1e-177  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383541  hitchhiker  0.00159456 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01364  hypothetical protein  42.67 
 
 		 758 aa  623  1e-177  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22730  ferrous iron transport protein B  43.9 
 
 		 778 aa  624  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524583  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1618  ferrous iron transport protein B  43.37 
 
 		 764 aa  624  1e-177  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00477082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1532  ferrous iron transport protein B  44.47 
 
 		 764 aa  624  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1584  ferrous iron transport protein B  43.37 
 
 		 764 aa  625  1e-177  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000129381  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1595  ferrous iron transport protein B  43.37 
 
 		 764 aa  625  1e-177  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000195581  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1784  ferrous iron transport protein B  42.84 
 
 		 764 aa  619  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2504  ferrous iron transport protein B  42.97 
 
 		 764 aa  622  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00112841  hitchhiker  0.00221536 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2572  ferrous iron transport protein B  42.97 
 
 		 764 aa  621  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.148151  normal  0.0102392 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004103  ferrous iron transport protein B  42.86 
 
 		 758 aa  619  1e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2616  ferrous iron transport protein B  41.84 
 
 		 770 aa  617  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2670  ferrous iron transport protein B  42.44 
 
 		 764 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.360786  normal  0.0737302 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2258  ferrous iron transport protein FeoB  42.22 
 
 		 758 aa  611  1e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.694686  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2414  ferrous iron transport protein B  42.28 
 
 		 772 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331306  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0107  ferrous iron transport protein B  40.49 
 
 		 778 aa  604  1.0000000000000001e-171  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.803376  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2711  ferrous iron transporter B  42.25 
 
 		 751 aa  587  1e-166  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2584  ferrous iron transporter B  42.11 
 
 		 751 aa  586  1e-166  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0321  ferrous iron transport protein B  41.6 
 
 		 751 aa  586  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.397467  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1215  ferrous iron transport protein B  42.72 
 
 		 764 aa  588  1e-166  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1959  ferrous iron transport protein B  40.15 
 
 		 816 aa  581  1e-164  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0239  ferrous iron transport protein B  40.15 
 
 		 816 aa  581  1e-164  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0648  ferrous iron transport protein B  40.31 
 
 		 727 aa  567  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56680  ferrous iron transport protein B  39.55 
 
 		 766 aa  558  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4929  ferrous iron transport protein B  39.32 
 
 		 766 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875416  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0654  ferrous iron transport protein B  39.81 
 
 		 693 aa  539  9.999999999999999e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3746  ferrous iron transport protein B  40.69 
 
 		 771 aa  542  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3985  ferrous iron transport protein B  40.69 
 
 		 771 aa  541  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0168  ferrous iron transport protein B  40.69 
 
 		 771 aa  541  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.426324  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4629  ferrous iron transport protein B  39.97 
 
 		 771 aa  532  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0304  ferrous iron transport protein B  41.22 
 
 		 773 aa  526  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2524  ferrous iron transport protein B  39.05 
 
 		 766 aa  526  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3884  ferrous iron transport protein B  41.22 
 
 		 773 aa  526  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2152  ferrous iron transport protein B  39.05 
 
 		 782 aa  526  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.264076  hitchhiker  0.0000442692 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0304  ferrous iron transport protein B  41.22 
 
 		 773 aa  526  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0656913 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3606  ferrous iron transport protein B  41.22 
 
 		 773 aa  526  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4716  ferrous iron transport protein B  41.22 
 
 		 773 aa  526  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03261  ferrous iron transport protein B  41.08 
 
 		 773 aa  525  1e-147  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.313443  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3690  ferrous iron transport protein B  41.08 
 
 		 773 aa  525  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03213  hypothetical protein  41.08 
 
 		 773 aa  525  1e-147  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.267012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3790  ferrous iron transport protein B  41.08 
 
 		 773 aa  525  1e-147  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3813  ferrous iron transport protein B  40.62 
 
 		 772 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3779  ferrous iron transport protein B  40.62 
 
 		 772 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3707  ferrous iron transport protein B  40.62 
 
 		 772 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3704  ferrous iron transport protein B  40.62 
 
 		 772 aa  519  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3875  ferrous iron transport protein B  40.62 
 
 		 772 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3822  ferrous iron transport protein B  40 
 
 		 772 aa  512  1e-144  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.848053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3383  ferrous iron transport protein B  37.52 
 
 		 683 aa  483  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.378196 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3658  ferrous iron transport protein B  35.76 
 
 		 741 aa  442  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0793  ferrous iron transport protein B  35.12 
 
 		 728 aa  429  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.585929  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3765  ferrous iron transport protein B  34.89 
 
 		 743 aa  429  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3293  ferrous iron transport protein B  35.01 
 
 		 741 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.608312  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1785  ferrous iron transport protein B  33.65 
 
 		 713 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.84236  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4105  ferrous iron transport protein B  35.53 
 
 		 738 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281443  normal  0.296674 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3268  ferrous iron transport protein B  34.39 
 
 		 747 aa  415  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.309598  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3412  ferrous iron transport protein B  35.2 
 
 		 740 aa  415  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3368  ferrous iron transport protein B  34.29 
 
 		 740 aa  416  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3524  ferrous iron transport protein B  33.2 
 
 		 697 aa  404  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000134401  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  37.34 
 
 		 680 aa  397  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  34.87 
 
 		 676 aa  389  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3459  ferrous iron transport protein B  34.16 
 
 		 715 aa  387  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000760098  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  33.15 
 
 		 669 aa  388  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1194  ferrous iron transport protein B  35.19 
 
 		 714 aa  385  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  36.8 
 
 		 669 aa  382  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  34.31 
 
 		 631 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2658  ferrous iron transport protein B  37.71 
 
 		 664 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  34.73 
 
 		 631 aa  379  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1088  ferrous iron transport protein B  34.4 
 
 		 753 aa  374  1e-102  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000362942  hitchhiker  0.0000000000000163165 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  34.92 
 
 		 691 aa  375  1e-102  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0654  Fe2+ transport system protein B  33.93 
 
 		 712 aa  374  1e-102  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  38.06 
 
 		 676 aa  370  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1458  ferrous iron transport protein B  32.9 
 
 		 716 aa  370  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.137578  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0901  ferrous iron transport protein B  33.24 
 
 		 708 aa  369  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000608812  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  33.2 
 
 		 680 aa  369  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0618  ferrous iron transport protein B  33.73 
 
 		 721 aa  366  1e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0536695  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1508  ferrous iron transport protein B  36.3 
 
 		 665 aa  362  1e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.225021  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  36.26 
 
 		 662 aa  361  3e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1343  ferrous iron transport protein B  36.42 
 
 		 662 aa  360  4e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.547756  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  36.05 
 
 		 666 aa  360  5e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0637  ferrous iron transport protein B  30.25 
 
 		 739 aa  360  6e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000736261  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  36.26 
 
 		 662 aa  360  7e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  36.26 
 
 		 662 aa  360  7e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  36.26 
 
 		 662 aa  360  7e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  36.26 
 
 		 662 aa  360  8e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  36.42 
 
 		 662 aa  359  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>