More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0475 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0475  small GTP-binding protein  100 
 
 		 404 aa  810    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0490  small GTP-binding protein  100 
 
 		 404 aa  810    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1361  small GTP-binding protein  72.98 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.311924  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0245  small GTP-binding protein  71.46 
 
 		 403 aa  595  1e-169  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31412  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  53.69 
 
 		 398 aa  461  9.999999999999999e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0473  small GTP-binding protein  50 
 
 		 403 aa  388  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0038153  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1243  small GTP-binding protein  49.37 
 
 		 425 aa  385  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2276  small GTP-binding protein domain-containing protein  49.37 
 
 		 400 aa  375  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1277  small GTP-binding protein domain-containing protein  49.11 
 
 		 405 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.038791  hitchhiker  0.00000385407 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0683  small GTP-binding protein  48.35 
 
 		 408 aa  375  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00203334  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0042  small GTP-binding protein  47.07 
 
 		 400 aa  364  1e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19310  small GTP-binding protein  46.84 
 
 		 411 aa  364  2e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00194835  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0705  small GTP-binding protein  45.98 
 
 		 412 aa  363  3e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.131335  hitchhiker  0.000692522 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3256  small GTP-binding protein  46.33 
 
 		 412 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00305193  hitchhiker  0.00001491 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1629  GTPases  45.64 
 
 		 416 aa  361  1e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000232915  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1569  small GTP-binding protein  44.92 
 
 		 407 aa  358  9.999999999999999e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.627873  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0183  small GTP-binding protein  46.84 
 
 		 408 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3926  GTP-binding protein  45.69 
 
 		 394 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2152  small GTP-binding protein  46.48 
 
 		 409 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0165  small GTP-binding protein  47.09 
 
 		 427 aa  356  5e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1843  small GTP-binding protein  45.95 
 
 		 422 aa  353  2e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1387  small GTP-binding protein  46.08 
 
 		 410 aa  352  5e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0637341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0318  small GTP-binding protein domain-containing protein  44.53 
 
 		 402 aa  351  1e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2081  small GTP-binding protein  44.19 
 
 		 416 aa  346  4e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000627073  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1494  small GTP-binding protein  43.64 
 
 		 412 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1501  small GTP-binding protein  45.14 
 
 		 408 aa  335  1e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.206775  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0146  small GTP-binding protein  46.38 
 
 		 398 aa  333  4e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0325934  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16490  iron-only hydrogenase maturation protein HydF  42.57 
 
 		 416 aa  326  3e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.520712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3103  small GTP-binding protein  40.41 
 
 		 396 aa  318  2e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2638  small GTP-binding protein  38.72 
 
 		 394 aa  285  1.0000000000000001e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0103  GTP-binding protein  37.1 
 
 		 440 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000228129  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0106  GTP-binding protein  37.56 
 
 		 440 aa  283  5.000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0272  small GTP-binding protein  39.34 
 
 		 382 aa  247  3e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.934792  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0266  small GTP-binding protein  36.5 
 
 		 377 aa  240  4e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.410874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1098  small GTP-binding protein domain-containing protein  37.74 
 
 		 262 aa  164  3e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1445  GTP-binding protein Era  38.1 
 
 		 298 aa  87.8  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1376  GTP-binding protein Era  38.18 
 
 		 298 aa  86.7  7e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2974  GTP-binding protein Era  37.14 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0899132  hitchhiker  0.00507105 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3038  tRNA modification GTPase TrmE  37.16 
 
 		 448 aa  80.5  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.38062  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  35.36 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2889  tRNA modification GTPase TrmE  34.57 
 
 		 464 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0137  tRNA modification GTPase TrmE  34.27 
 
 		 457 aa  79  0.0000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  33.96 
 
 		 458 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1122  GTP-binding protein Era  31.79 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1401  GTP-binding protein Era  31.79 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13281  GTP-binding protein Era-like protein  33.53 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.593826 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3073  tRNA modification GTPase TrmE  32.1 
 
 		 446 aa  76.3  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  31.76 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3159  tRNA modification GTPase TrmE  44.44 
 
 		 457 aa  76.3  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2929  tRNA modification GTPase TrmE  32.1 
 
 		 446 aa  75.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  35.16 
 
 		 462 aa  74.3  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  32.92 
 
 		 458 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0848  GTP-binding protein Era  31.14 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  32.92 
 
 		 458 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  32.92 
 
 		 458 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  32.92 
 
 		 458 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  32.92 
 
 		 458 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  32.92 
 
 		 458 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1753  ribosome-associated GTPase EngA  33.13 
 
 		 477 aa  73.2  0.000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  32.92 
 
 		 458 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  28.57 
 
 		 458 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0371  GTP-binding protein Era  31.18 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  30.95 
 
 		 298 aa  72.4  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  31.21 
 
 		 451 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  31.21 
 
 		 449 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2126  GTP-binding protein EngA  32.35 
 
 		 449 aa  72  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.127058  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  31.01 
 
 		 461 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  39.32 
 
 		 447 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  32.3 
 
 		 458 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17011  GTP-binding protein Era  30.77 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.205656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  38.89 
 
 		 452 aa  71.6  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4310  tRNA modification GTPase TrmE  30.91 
 
 		 460 aa  71.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.671502  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  38.89 
 
 		 473 aa  71.6  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1339  GTP-binding protein EngA  38.03 
 
 		 463 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  32.52 
 
 		 459 aa  71.2  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  31.68 
 
 		 458 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1247  GTP-binding protein Era  30.12 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.734456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0752  GTP-binding protein EngA  32.14 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00177757 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  35.29 
 
 		 454 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1387  GTP-binding protein Era  32.77 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.263237  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0737  GTP-binding protein EngA  31.55 
 
 		 440 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  32.16 
 
 		 458 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  33.13 
 
 		 458 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4070  tRNA modification GTPase TrmE  33.54 
 
 		 467 aa  70.1  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125734  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4055  tRNA modification GTPase TrmE  33.54 
 
 		 454 aa  70.5  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.765231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3161  tRNA modification GTPase TrmE  34.52 
 
 		 471 aa  70.5  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.258894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4177  tRNA modification GTPase TrmE  33.54 
 
 		 467 aa  70.1  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  30.25 
 
 		 462 aa  70.1  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4234  tRNA modification GTPase TrmE  33.54 
 
 		 467 aa  70.1  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4127  tRNA modification GTPase TrmE  33.54 
 
 		 454 aa  70.5  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0392  GTP-binding protein EngA  30.54 
 
 		 494 aa  69.7  0.00000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1024  GTP-binding protein EngA  30.06 
 
 		 440 aa  69.7  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127427  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1783  tRNA modification GTPase TrmE  37.3 
 
 		 454 aa  69.7  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.028326  normal  0.377376 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  31.1 
 
 		 439 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  31.52 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2392  tRNA modification GTPase TrmE  35.8 
 
 		 468 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0118764  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3591  GTP-binding protein Era  29.65 
 
 		 308 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1582  tRNA modification GTPase TrmE  31.01 
 
 		 462 aa  68.9  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  31.87 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0008  tRNA modification GTPase TrmE  37.42 
 
 		 453 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185087  hitchhiker  0.000721309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>