More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1862 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  100 
 
 		 398 aa  800    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0490  small GTP-binding protein  53.69 
 
 		 404 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0475  small GTP-binding protein  53.69 
 
 		 404 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0245  small GTP-binding protein  53.38 
 
 		 403 aa  447  1.0000000000000001e-124  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31412  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1361  small GTP-binding protein  51.26 
 
 		 396 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.311924  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0473  small GTP-binding protein  47.33 
 
 		 403 aa  354  2e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0038153  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1569  small GTP-binding protein  47.21 
 
 		 407 aa  343  2e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.627873  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19310  small GTP-binding protein  44.58 
 
 		 411 aa  341  1e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00194835  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0042  small GTP-binding protein  44.27 
 
 		 400 aa  341  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0318  small GTP-binding protein domain-containing protein  46.19 
 
 		 402 aa  336  5e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0683  small GTP-binding protein  44.42 
 
 		 408 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00203334  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1277  small GTP-binding protein domain-containing protein  44.19 
 
 		 405 aa  331  1e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.038791  hitchhiker  0.00000385407 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2152  small GTP-binding protein  44.42 
 
 		 409 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2276  small GTP-binding protein domain-containing protein  43.78 
 
 		 400 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0183  small GTP-binding protein  44.47 
 
 		 408 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0705  small GTP-binding protein  42.08 
 
 		 412 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.131335  hitchhiker  0.000692522 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3256  small GTP-binding protein  41.83 
 
 		 412 aa  324  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00305193  hitchhiker  0.00001491 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2081  small GTP-binding protein  42.47 
 
 		 416 aa  323  4e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000627073  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3926  GTP-binding protein  42.03 
 
 		 394 aa  322  6e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1243  small GTP-binding protein  42.11 
 
 		 425 aa  317  2e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1629  GTPases  41.9 
 
 		 416 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000232915  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1843  small GTP-binding protein  41.5 
 
 		 422 aa  314  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16490  iron-only hydrogenase maturation protein HydF  41 
 
 		 416 aa  312  6.999999999999999e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.520712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0165  small GTP-binding protein  41.77 
 
 		 427 aa  310  2.9999999999999997e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2638  small GTP-binding protein  43.49 
 
 		 394 aa  308  9e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1494  small GTP-binding protein  42 
 
 		 412 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1387  small GTP-binding protein  39.59 
 
 		 410 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0637341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0146  small GTP-binding protein  42.89 
 
 		 398 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0325934  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3103  small GTP-binding protein  41.56 
 
 		 396 aa  303  4.0000000000000003e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1501  small GTP-binding protein  40.81 
 
 		 408 aa  301  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.206775  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0106  GTP-binding protein  36.18 
 
 		 440 aa  267  2e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0103  GTP-binding protein  35.94 
 
 		 440 aa  266  4e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000228129  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0272  small GTP-binding protein  38.36 
 
 		 382 aa  239  5e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.934792  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0266  small GTP-binding protein  37.31 
 
 		 377 aa  227  3e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.410874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1098  small GTP-binding protein domain-containing protein  40.29 
 
 		 262 aa  161  2e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1753  ribosome-associated GTPase EngA  36.2 
 
 		 477 aa  84  0.000000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1160  GTP-binding protein EngA  31.16 
 
 		 439 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0769833  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  42.5 
 
 		 447 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4483  GTP-binding protein Era  40.46 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0536  GTP-binding protein EngA  37.09 
 
 		 461 aa  77.4  0.0000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2959  GTP-binding protein Era  36.22 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000390486  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0409  GTP-binding protein EngA  35.76 
 
 		 460 aa  76.3  0.0000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0435  GTP-binding protein EngA  35.76 
 
 		 460 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4517  GTP-binding protein Era  32.52 
 
 		 337 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  33.54 
 
 		 458 aa  75.5  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  35.22 
 
 		 461 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  37.8 
 
 		 449 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1572  GTP-binding protein EngA  35.76 
 
 		 460 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1122  GTP-binding protein Era  30.64 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1401  GTP-binding protein Era  30.64 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  36.25 
 
 		 460 aa  74.7  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  34.27 
 
 		 462 aa  74.7  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  35.94 
 
 		 451 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  37.4 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02641  tRNA modification GTPase TrmE  38.71 
 
 		 464 aa  73.9  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0392  GTP-binding protein EngA  39.84 
 
 		 494 aa  73.6  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  31.4 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2472  tRNA modification GTPase TrmE  33.53 
 
 		 487 aa  73.2  0.000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000689916 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  31.4 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4247  GTP-binding protein EngA  32.87 
 
 		 498 aa  72.4  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  33.76 
 
 		 458 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0887  GTP-binding protein Era  33.08 
 
 		 311 aa  72.4  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  30.05 
 
 		 455 aa  72.4  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3456  tRNA modification GTPase TrmE  30.95 
 
 		 481 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17011  GTP-binding protein Era  27.92 
 
 		 313 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.205656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0848  GTP-binding protein Era  27.92 
 
 		 313 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  32.86 
 
 		 444 aa  71.6  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1339  GTP-binding protein EngA  41.32 
 
 		 463 aa  72  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  33.76 
 
 		 458 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3755  tRNA modification GTPase TrmE  30.77 
 
 		 481 aa  72  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1186  GTP-binding protein EngA  40.98 
 
 		 461 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  33.76 
 
 		 458 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0359  GTP-binding protein EngA  33.91 
 
 		 436 aa  71.6  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3038  tRNA modification GTPase TrmE  39.13 
 
 		 448 aa  71.2  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.38062  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  32.48 
 
 		 458 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4133  tRNA modification GTPase TrmE  34.27 
 
 		 456 aa  71.2  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  33.12 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  31.32 
 
 		 463 aa  70.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  37.61 
 
 		 464 aa  70.9  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0160  GTP-binding protein Era  35.94 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.709103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3096  tRNA modification GTPase TrmE  35.33 
 
 		 466 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000134747 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  38.52 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0777  GTP-binding protein EngA  42.62 
 
 		 462 aa  70.5  0.00000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1617  GTP-binding protein EngA  33.88 
 
 		 460 aa  70.5  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  38.33 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  38.33 
 
 		 473 aa  70.5  0.00000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1556  tRNA modification GTPase TrmE  37.9 
 
 		 464 aa  70.5  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  40.17 
 
 		 456 aa  70.5  0.00000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0053  GTP-binding protein EngA  38.84 
 
 		 460 aa  70.1  0.00000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0005  tRNA modification GTPase TrmE  30.36 
 
 		 481 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75194  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  33.12 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2103  GTP-binding protein EngA  29.94 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0376  tRNA modification GTPase TrmE  39.34 
 
 		 464 aa  69.7  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.831872  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2143  tRNA modification GTPase TrmE  31.43 
 
 		 478 aa  69.7  0.00000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0104732  hitchhiker  0.000152188 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3526  GTP-binding protein EngA  28.49 
 
 		 494 aa  69.7  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.928011 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14421  GTP-binding protein Era  33.74 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3073  tRNA modification GTPase TrmE  39.5 
 
 		 446 aa  69.7  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3456  tRNA modification GTPase TrmE  33.33 
 
 		 475 aa  69.7  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0132  tRNA modification GTPase TrmE  31.87 
 
 		 452 aa  69.7  0.00000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.849325  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  33.54 
 
 		 455 aa  69.7  0.00000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>