More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1843 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1843  small GTP-binding protein  100 
 
 		 422 aa  845    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1629  GTPases  67.95 
 
 		 416 aa  600  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000232915  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1494  small GTP-binding protein  70.2 
 
 		 412 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1277  small GTP-binding protein domain-containing protein  60.64 
 
 		 405 aa  467  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.038791  hitchhiker  0.00000385407 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0183  small GTP-binding protein  58.78 
 
 		 408 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1243  small GTP-binding protein  58.5 
 
 		 425 aa  460  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0683  small GTP-binding protein  55.26 
 
 		 408 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00203334  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0318  small GTP-binding protein domain-containing protein  57.39 
 
 		 402 aa  453  1.0000000000000001e-126  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1387  small GTP-binding protein  55.45 
 
 		 410 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0637341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2152  small GTP-binding protein  54.99 
 
 		 409 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0165  small GTP-binding protein  56.06 
 
 		 427 aa  445  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2276  small GTP-binding protein domain-containing protein  54.04 
 
 		 400 aa  429  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0473  small GTP-binding protein  53.62 
 
 		 403 aa  426  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0038153  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0042  small GTP-binding protein  51.74 
 
 		 400 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3256  small GTP-binding protein  50.76 
 
 		 412 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00305193  hitchhiker  0.00001491 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19310  small GTP-binding protein  49.39 
 
 		 411 aa  399  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00194835  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0705  small GTP-binding protein  49.87 
 
 		 412 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.131335  hitchhiker  0.000692522 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1569  small GTP-binding protein  48.76 
 
 		 407 aa  394  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.627873  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3926  GTP-binding protein  50 
 
 		 394 aa  387  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2081  small GTP-binding protein  48.14 
 
 		 416 aa  385  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000627073  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0146  small GTP-binding protein  53.77 
 
 		 398 aa  383  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0325934  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3103  small GTP-binding protein  47.72 
 
 		 396 aa  366  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0475  small GTP-binding protein  45.95 
 
 		 404 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0490  small GTP-binding protein  45.95 
 
 		 404 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1501  small GTP-binding protein  47.8 
 
 		 408 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.206775  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16490  iron-only hydrogenase maturation protein HydF  46.81 
 
 		 416 aa  345  6e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.520712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0245  small GTP-binding protein  45.43 
 
 		 403 aa  345  1e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31412  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1361  small GTP-binding protein  45.66 
 
 		 396 aa  343  5e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.311924  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2638  small GTP-binding protein  44.05 
 
 		 394 aa  333  3e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0103  GTP-binding protein  43.12 
 
 		 440 aa  333  3e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000228129  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0106  GTP-binding protein  42.89 
 
 		 440 aa  332  6e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  41.5 
 
 		 398 aa  314  1.9999999999999998e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0272  small GTP-binding protein  43 
 
 		 382 aa  277  2e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.934792  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0266  small GTP-binding protein  40.93 
 
 		 377 aa  270  5e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.410874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1098  small GTP-binding protein domain-containing protein  43.43 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0314  tRNA modification GTPase TrmE  38.64 
 
 		 450 aa  87  6e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00576337  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3984  tRNA modification GTPase TrmE  38.22 
 
 		 464 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4469  tRNA modification GTPase TrmE  38.22 
 
 		 464 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0533201 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0536  GTP-binding protein EngA  34.1 
 
 		 461 aa  81.3  0.00000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0435  GTP-binding protein EngA  35.62 
 
 		 460 aa  79.7  0.00000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0053  GTP-binding protein EngA  33.54 
 
 		 460 aa  79.7  0.00000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0409  GTP-binding protein EngA  35.62 
 
 		 460 aa  79.7  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0005  tRNA modification GTPase TrmE  37.28 
 
 		 481 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75194  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0777  GTP-binding protein EngA  34.97 
 
 		 462 aa  77.4  0.0000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1572  GTP-binding protein EngA  35 
 
 		 460 aa  77.4  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0392  GTP-binding protein EngA  31.61 
 
 		 494 aa  77.4  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02641  tRNA modification GTPase TrmE  36.42 
 
 		 464 aa  77  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  32.34 
 
 		 458 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2945  tRNA modification GTPase TrmE  38.65 
 
 		 465 aa  76.6  0.0000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0139032  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1556  tRNA modification GTPase TrmE  35.76 
 
 		 464 aa  76.6  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3456  tRNA modification GTPase TrmE  36.47 
 
 		 481 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3152  tRNA modification GTPase TrmE  35.67 
 
 		 464 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000246642 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2547  tRNA modification GTPase TrmE  35.67 
 
 		 464 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0461446  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  35.33 
 
 		 460 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3161  tRNA modification GTPase TrmE  35.67 
 
 		 464 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.399046  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6518  tRNA modification GTPase TrmE  37.11 
 
 		 464 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3213  tRNA modification GTPase TrmE  35.67 
 
 		 489 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  36.6 
 
 		 461 aa  73.9  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2136  tRNA modification GTPase TrmE  36.97 
 
 		 451 aa  73.9  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  38.36 
 
 		 458 aa  73.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3179  tRNA modification GTPase TrmE  35.67 
 
 		 464 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0373252  hitchhiker  0.000409063 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3097  tRNA modification GTPase TrmE  35.67 
 
 		 464 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151562  normal  0.0117151 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3096  tRNA modification GTPase TrmE  37.89 
 
 		 466 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000134747 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2316  tRNA modification GTPase TrmE  36.22 
 
 		 456 aa  73.6  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.64098  normal  0.135497 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3233  tRNA modification GTPase TrmE  39.51 
 
 		 467 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0356  GTP-binding protein Era  32.1 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.792486 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  39.2 
 
 		 447 aa  73.2  0.000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  40 
 
 		 458 aa  73.2  0.000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3755  tRNA modification GTPase TrmE  35.88 
 
 		 481 aa  73.2  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  34.18 
 
 		 458 aa  73.2  0.000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  40 
 
 		 461 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4517  GTP-binding protein Era  30.16 
 
 		 337 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  34.18 
 
 		 458 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0111  tRNA modification GTPase TrmE  38.27 
 
 		 467 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2243  tRNA modification GTPase TrmE  38.27 
 
 		 488 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0096  tRNA modification GTPase TrmE  38.27 
 
 		 467 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3395  tRNA modification GTPase TrmE  38.27 
 
 		 467 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.408647  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0307  tRNA modification GTPase TrmE  38.27 
 
 		 467 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1753  ribosome-associated GTPase EngA  28.92 
 
 		 477 aa  72  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3547  tRNA modification GTPase TrmE  38.27 
 
 		 488 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2775  tRNA modification GTPase TrmE  32.05 
 
 		 452 aa  72  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4729  tRNA modification GTPase TrmE  37.11 
 
 		 454 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0953  ribosome-associated GTPase EngA  34.78 
 
 		 437 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2842  tRNA modification GTPase TrmE  38.27 
 
 		 488 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00155334  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1186  GTP-binding protein EngA  33.99 
 
 		 461 aa  72  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  34.73 
 
 		 460 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4483  GTP-binding protein Era  32.28 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1122  GTP-binding protein Era  38.98 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2392  tRNA modification GTPase TrmE  37.42 
 
 		 468 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0118764  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1401  GTP-binding protein Era  38.98 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2103  GTP-binding protein EngA  35.53 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  34.25 
 
 		 454 aa  71.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  30 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  30 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  39.17 
 
 		 456 aa  70.9  0.00000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  42.62 
 
 		 455 aa  70.5  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0555  tRNA modification GTPase TrmE  38.62 
 
 		 438 aa  70.5  0.00000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  36.62 
 
 		 461 aa  70.1  0.00000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0886  tRNA modification GTPase TrmE  35.67 
 
 		 478 aa  70.1  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00940326 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4791  tRNA modification GTPase TrmE  35.23 
 
 		 482 aa  69.7  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>