More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2152 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2152  small GTP-binding protein  100 
 
 		 409 aa  837    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0183  small GTP-binding protein  63.9 
 
 		 408 aa  527  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1243  small GTP-binding protein  63.28 
 
 		 425 aa  525  1e-148  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1277  small GTP-binding protein domain-containing protein  63.16 
 
 		 405 aa  521  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.038791  hitchhiker  0.00000385407 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0683  small GTP-binding protein  60.54 
 
 		 408 aa  513  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00203334  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0318  small GTP-binding protein domain-containing protein  60.49 
 
 		 402 aa  511  1e-144  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0165  small GTP-binding protein  60.93 
 
 		 427 aa  498  1e-140  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0473  small GTP-binding protein  61.31 
 
 		 403 aa  496  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0038153  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1629  GTPases  54.9 
 
 		 416 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000232915  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0042  small GTP-binding protein  56.86 
 
 		 400 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19310  small GTP-binding protein  54.39 
 
 		 411 aa  451  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00194835  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2081  small GTP-binding protein  53.62 
 
 		 416 aa  445  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000627073  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1843  small GTP-binding protein  54.99 
 
 		 422 aa  446  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1494  small GTP-binding protein  56.61 
 
 		 412 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1569  small GTP-binding protein  53.77 
 
 		 407 aa  424  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.627873  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2276  small GTP-binding protein domain-containing protein  51.87 
 
 		 400 aa  404  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3256  small GTP-binding protein  51.26 
 
 		 412 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00305193  hitchhiker  0.00001491 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0705  small GTP-binding protein  50.75 
 
 		 412 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.131335  hitchhiker  0.000692522 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1387  small GTP-binding protein  49.14 
 
 		 410 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0637341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0146  small GTP-binding protein  53.27 
 
 		 398 aa  396  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0325934  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3926  GTP-binding protein  50.13 
 
 		 394 aa  380  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16490  iron-only hydrogenase maturation protein HydF  48.51 
 
 		 416 aa  375  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.520712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0245  small GTP-binding protein  46.33 
 
 		 403 aa  361  1e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31412  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1501  small GTP-binding protein  46.72 
 
 		 408 aa  358  6e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.206775  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0106  GTP-binding protein  44.01 
 
 		 440 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0490  small GTP-binding protein  46.48 
 
 		 404 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0475  small GTP-binding protein  46.48 
 
 		 404 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0103  GTP-binding protein  43.09 
 
 		 440 aa  355  1e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000228129  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3103  small GTP-binding protein  45.09 
 
 		 396 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2638  small GTP-binding protein  46.94 
 
 		 394 aa  350  4e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1361  small GTP-binding protein  45.18 
 
 		 396 aa  347  2e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.311924  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  44.42 
 
 		 398 aa  330  3e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0272  small GTP-binding protein  39.69 
 
 		 382 aa  272  8.000000000000001e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.934792  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0266  small GTP-binding protein  41.33 
 
 		 377 aa  270  2e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.410874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1098  small GTP-binding protein domain-containing protein  44.9 
 
 		 262 aa  186  5e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  36.45 
 
 		 464 aa  103  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  39.24 
 
 		 462 aa  94.4  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  38.18 
 
 		 441 aa  93.2  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1458  GTP-binding protein EngA  37.29 
 
 		 445 aa  91.7  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548717  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  40.46 
 
 		 461 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4200  tRNA modification GTPase TrmE  35.19 
 
 		 448 aa  90.5  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0153583 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3656  tRNA modification GTPase TrmE  39.26 
 
 		 460 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3751  GTP-binding protein EngA  36.97 
 
 		 449 aa  90.1  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  39.88 
 
 		 463 aa  90.1  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  35.29 
 
 		 444 aa  89.7  8e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3073  tRNA modification GTPase TrmE  40.25 
 
 		 446 aa  89.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  35.62 
 
 		 461 aa  89.4  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0374  GTP-binding protein EngA  35.8 
 
 		 473 aa  88.6  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2929  tRNA modification GTPase TrmE  40.12 
 
 		 446 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  36.75 
 
 		 458 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  45 
 
 		 460 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  38.93 
 
 		 454 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2392  tRNA modification GTPase TrmE  38.75 
 
 		 468 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0118764  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1582  tRNA modification GTPase TrmE  36.42 
 
 		 462 aa  88.6  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0118  GTP-binding protein EngA  35.36 
 
 		 452 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.132129 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0121  GTP-binding protein EngA  35.36 
 
 		 452 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  45 
 
 		 460 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2103  GTP-binding protein EngA  34.48 
 
 		 441 aa  87.8  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4774  tRNA modification GTPase TrmE  36.42 
 
 		 467 aa  87.8  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2572  GTPase  36.64 
 
 		 459 aa  87.8  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.329632  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1024  GTP-binding protein EngA  32.84 
 
 		 440 aa  87.4  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127427  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2340  GTP-binding protein EngA  38.75 
 
 		 453 aa  86.3  8e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.160254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  38.06 
 
 		 459 aa  86.7  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0886  tRNA modification GTPase TrmE  36.2 
 
 		 478 aa  86.3  9e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00940326 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  36.84 
 
 		 450 aa  85.9  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0435  GTP-binding protein EngA  34.78 
 
 		 460 aa  86.3  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0409  GTP-binding protein EngA  34.78 
 
 		 460 aa  85.9  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  37.71 
 
 		 450 aa  86.3  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3106  GTP-binding protein EngA  33.33 
 
 		 479 aa  85.9  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.564911 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3161  tRNA modification GTPase TrmE  39.87 
 
 		 471 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.258894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  35.4 
 
 		 447 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  34.64 
 
 		 438 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  34.64 
 
 		 438 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1203  small GTP-binding protein  37.04 
 
 		 490 aa  85.5  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.996743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1609  GTP-binding protein EngA  35.33 
 
 		 449 aa  84.7  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0528486 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  35.19 
 
 		 463 aa  84.7  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1937  GTP-binding protein EngA  35.33 
 
 		 449 aa  84.7  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  36.84 
 
 		 458 aa  84.3  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0885  GTP-binding protein EngA  34.24 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1009  GTPase  38.27 
 
 		 442 aa  84  0.000000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.369054  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1339  GTP-binding protein EngA  36.02 
 
 		 463 aa  84  0.000000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1572  GTP-binding protein EngA  34.16 
 
 		 460 aa  84  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1561  GTP-binding protein EngA  32.77 
 
 		 453 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.53751  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1753  ribosome-associated GTPase EngA  33.53 
 
 		 477 aa  83.2  0.000000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0536  GTP-binding protein EngA  34.34 
 
 		 461 aa  82.8  0.000000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  36.65 
 
 		 462 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4729  tRNA modification GTPase TrmE  37.42 
 
 		 454 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04098  tRNA modification GTPase  38.92 
 
 		 462 aa  81.6  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1336  tRNA modification GTPase TrmE  34.57 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  35.4 
 
 		 460 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl199  GTP-binding protein EngA  34.29 
 
 		 435 aa  81.6  0.00000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.316366  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2824  tRNA modification GTPase TrmE  35.76 
 
 		 446 aa  82  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3566  ribosome-associated GTPase EngA  33.33 
 
 		 454 aa  81.6  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.173152  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  30.26 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1291  GTP-binding protein EngA  30.56 
 
 		 436 aa  81.6  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0244351  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1556  tRNA modification GTPase TrmE  34.32 
 
 		 464 aa  81.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4133  tRNA modification GTPase TrmE  34.38 
 
 		 456 aa  81.3  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0097  tRNA modification GTPase TrmE  34.03 
 
 		 455 aa  81.6  0.00000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  36.88 
 
 		 461 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>