More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0245 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0245  small GTP-binding protein  100 
 
 		 403 aa  813    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31412  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1361  small GTP-binding protein  71.79 
 
 		 396 aa  598  1e-170  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.311924  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0490  small GTP-binding protein  71.46 
 
 		 404 aa  595  1e-169  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0475  small GTP-binding protein  71.46 
 
 		 404 aa  595  1e-169  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  53.38 
 
 		 398 aa  447  1.0000000000000001e-124  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0473  small GTP-binding protein  50.88 
 
 		 403 aa  392  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0038153  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1243  small GTP-binding protein  48.74 
 
 		 425 aa  384  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2276  small GTP-binding protein domain-containing protein  48.87 
 
 		 400 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1277  small GTP-binding protein domain-containing protein  47.09 
 
 		 405 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.038791  hitchhiker  0.00000385407 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0165  small GTP-binding protein  47.15 
 
 		 427 aa  367  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0683  small GTP-binding protein  47.06 
 
 		 408 aa  363  2e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00203334  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2152  small GTP-binding protein  46.33 
 
 		 409 aa  361  1e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0042  small GTP-binding protein  46.82 
 
 		 400 aa  360  3e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19310  small GTP-binding protein  45.43 
 
 		 411 aa  354  1e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00194835  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0318  small GTP-binding protein domain-containing protein  46.06 
 
 		 402 aa  352  5e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1629  GTPases  45.61 
 
 		 416 aa  351  1e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000232915  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1387  small GTP-binding protein  44.81 
 
 		 410 aa  351  1e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0637341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0183  small GTP-binding protein  45.23 
 
 		 408 aa  350  2e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1843  small GTP-binding protein  45.43 
 
 		 422 aa  345  1e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3256  small GTP-binding protein  44.47 
 
 		 412 aa  343  4e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00305193  hitchhiker  0.00001491 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2081  small GTP-binding protein  44.3 
 
 		 416 aa  342  5e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000627073  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3926  GTP-binding protein  45.34 
 
 		 394 aa  342  9e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0705  small GTP-binding protein  43.97 
 
 		 412 aa  340  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.131335  hitchhiker  0.000692522 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1494  small GTP-binding protein  43.89 
 
 		 412 aa  335  5.999999999999999e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1501  small GTP-binding protein  43.8 
 
 		 408 aa  333  4e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.206775  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1569  small GTP-binding protein  44.05 
 
 		 407 aa  327  3e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.627873  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16490  iron-only hydrogenase maturation protein HydF  43.5 
 
 		 416 aa  318  1e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.520712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0146  small GTP-binding protein  43.91 
 
 		 398 aa  307  3e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0325934  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3103  small GTP-binding protein  40.57 
 
 		 396 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2638  small GTP-binding protein  40.92 
 
 		 394 aa  295  1e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0106  GTP-binding protein  38.48 
 
 		 440 aa  282  7.000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0103  GTP-binding protein  38.25 
 
 		 440 aa  282  9e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000228129  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0272  small GTP-binding protein  39.39 
 
 		 382 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.934792  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0266  small GTP-binding protein  39.22 
 
 		 377 aa  250  3e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.410874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1098  small GTP-binding protein domain-containing protein  38.31 
 
 		 262 aa  152  8e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2632  small GTP-binding protein  35.15 
 
 		 434 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6542  small GTP-binding protein  35.85 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  35.82 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  32.95 
 
 		 462 aa  76.6  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02641  tRNA modification GTPase TrmE  37.68 
 
 		 464 aa  76.6  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0053  GTP-binding protein EngA  33.88 
 
 		 460 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1556  tRNA modification GTPase TrmE  37.68 
 
 		 464 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  34.21 
 
 		 459 aa  74.7  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0137  tRNA modification GTPase TrmE  34.27 
 
 		 457 aa  74.7  0.000000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  25.86 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0392  GTP-binding protein EngA  33.73 
 
 		 494 aa  74.3  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1753  ribosome-associated GTPase EngA  34.73 
 
 		 477 aa  74.3  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2974  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0899132  hitchhiker  0.00507105 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0193  GTP-binding protein EngA  34.12 
 
 		 495 aa  73.6  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3751  GTP-binding protein EngA  32.5 
 
 		 449 aa  73.2  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  37.96 
 
 		 452 aa  72.4  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0848  GTP-binding protein Era  32.79 
 
 		 313 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  37.96 
 
 		 473 aa  72.4  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  36.42 
 
 		 447 aa  72.8  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  31.28 
 
 		 451 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17011  GTP-binding protein Era  32.79 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.205656  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  34.19 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2143  GTP-binding protein EngA  27.33 
 
 		 437 aa  71.2  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0777  GTP-binding protein EngA  32.54 
 
 		 462 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1172  small GTP-binding protein  35.26 
 
 		 438 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  31.67 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0764  GTP-binding protein EngA  30.3 
 
 		 437 aa  70.9  0.00000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000517804  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  32.95 
 
 		 462 aa  70.1  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1445  GTP-binding protein Era  31.74 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  30.68 
 
 		 461 aa  69.7  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13281  GTP-binding protein Era-like protein  29.65 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.593826 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1339  GTP-binding protein EngA  33.74 
 
 		 463 aa  69.7  0.00000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1075  small GTP-binding protein  34.07 
 
 		 438 aa  69.3  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  30.17 
 
 		 449 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1369  GTP-binding protein EngA  32.3 
 
 		 434 aa  69.7  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.911808  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2263  GTP-binding protein EngA  30.9 
 
 		 506 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1024  GTP-binding protein EngA  38.21 
 
 		 440 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127427  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl199  GTP-binding protein EngA  36.88 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.316366  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2662  small GTP-binding protein  31.48 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.144738  hitchhiker  0.00576403 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0886  tRNA modification GTPase TrmE  32.73 
 
 		 478 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00940326 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1758  small GTP-binding protein  36.76 
 
 		 448 aa  68.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1401  GTP-binding protein Era  32.84 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03489  tRNA modification GTPase TrmE  30.91 
 
 		 446 aa  68.6  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1122  GTP-binding protein Era  32.84 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3038  tRNA modification GTPase TrmE  36.36 
 
 		 448 aa  68.2  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.38062  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1477  GTP-binding protein EngA  26.62 
 
 		 454 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1376  GTP-binding protein Era  31.14 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2136  tRNA modification GTPase TrmE  37.9 
 
 		 451 aa  67.8  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2453  tRNA modification GTPase TrmE  37.4 
 
 		 450 aa  67.8  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0314  tRNA modification GTPase TrmE  31.61 
 
 		 450 aa  68.2  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00576337  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2103  GTP-binding protein EngA  32.28 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  28.41 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2392  tRNA modification GTPase TrmE  31.14 
 
 		 468 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0118764  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2146  GTP-binding protein EngA  45.56 
 
 		 493 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2016  GTP-binding protein EngA  31.71 
 
 		 435 aa  67  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3857  small GTP-binding protein  34.56 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000791891  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0751  GTP-binding protein EngA  37.41 
 
 		 440 aa  67  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0001  tRNA modification GTPase TrmE  34.66 
 
 		 453 aa  67  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.201746  hitchhiker  0.00000000323985 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1177  GTP-binding protein  31.58 
 
 		 441 aa  67  0.0000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  36.5 
 
 		 438 aa  67  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  36.5 
 
 		 438 aa  67  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  28.82 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3526  GTP-binding protein EngA  44.44 
 
 		 494 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.928011 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  32.35 
 
 		 441 aa  66.6  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0504  GTP-binding protein EngA  34.15 
 
 		 442 aa  66.6  0.0000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.696313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>