More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0473 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_0473  small GTP-binding protein  100 
 
 		 403 aa  813    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0038153  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0683  small GTP-binding protein  64.82 
 
 		 408 aa  532  1e-150  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00203334  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1277  small GTP-binding protein domain-containing protein  63.57 
 
 		 405 aa  504  1e-141  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.038791  hitchhiker  0.00000385407 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2152  small GTP-binding protein  61.31 
 
 		 409 aa  496  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0183  small GTP-binding protein  61.9 
 
 		 408 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0318  small GTP-binding protein domain-containing protein  59.55 
 
 		 402 aa  481  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0042  small GTP-binding protein  59.25 
 
 		 400 aa  472  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1243  small GTP-binding protein  59.15 
 
 		 425 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2081  small GTP-binding protein  55.86 
 
 		 416 aa  445  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000627073  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19310  small GTP-binding protein  55.28 
 
 		 411 aa  443  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00194835  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1569  small GTP-binding protein  57.07 
 
 		 407 aa  438  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.627873  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0165  small GTP-binding protein  55.89 
 
 		 427 aa  436  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1843  small GTP-binding protein  53.62 
 
 		 422 aa  426  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2276  small GTP-binding protein domain-containing protein  50.88 
 
 		 400 aa  408  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1629  GTPases  51.86 
 
 		 416 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000232915  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1387  small GTP-binding protein  52.13 
 
 		 410 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0637341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1494  small GTP-binding protein  50.37 
 
 		 412 aa  403  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0245  small GTP-binding protein  50.88 
 
 		 403 aa  392  1e-108  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31412  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0146  small GTP-binding protein  50.38 
 
 		 398 aa  388  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0325934  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0490  small GTP-binding protein  50 
 
 		 404 aa  388  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0475  small GTP-binding protein  50 
 
 		 404 aa  388  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16490  iron-only hydrogenase maturation protein HydF  47.9 
 
 		 416 aa  388  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.520712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3256  small GTP-binding protein  47.1 
 
 		 412 aa  363  3e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00305193  hitchhiker  0.00001491 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0705  small GTP-binding protein  46.6 
 
 		 412 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.131335  hitchhiker  0.000692522 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3103  small GTP-binding protein  47.7 
 
 		 396 aa  361  1e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1361  small GTP-binding protein  47.06 
 
 		 396 aa  357  9.999999999999999e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.311924  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3926  GTP-binding protein  46.67 
 
 		 394 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  47.33 
 
 		 398 aa  354  2e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2638  small GTP-binding protein  46.72 
 
 		 394 aa  350  2e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0103  GTP-binding protein  45.54 
 
 		 440 aa  348  8e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000228129  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0106  GTP-binding protein  46 
 
 		 440 aa  346  5e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1501  small GTP-binding protein  45 
 
 		 408 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.206775  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0272  small GTP-binding protein  44.7 
 
 		 382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.934792  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0266  small GTP-binding protein  41.36 
 
 		 377 aa  265  1e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.410874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1098  small GTP-binding protein domain-containing protein  42.13 
 
 		 262 aa  177  3e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0062  GTP-binding protein EngA  32.53 
 
 		 455 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  34.36 
 
 		 461 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2263  GTP-binding protein EngA  36.42 
 
 		 506 aa  77  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  33.13 
 
 		 462 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0193  GTP-binding protein EngA  32.7 
 
 		 495 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2392  tRNA modification GTPase TrmE  34.15 
 
 		 468 aa  74.7  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0118764  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2159  GTP-binding protein EngA  31.55 
 
 		 436 aa  73.9  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000018961  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  32.93 
 
 		 461 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  36.14 
 
 		 460 aa  73.2  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0886  tRNA modification GTPase TrmE  32.94 
 
 		 478 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00940326 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  35.19 
 
 		 458 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  35.19 
 
 		 458 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  31.29 
 
 		 458 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  31.29 
 
 		 458 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  31.29 
 
 		 458 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  31.29 
 
 		 458 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  34.78 
 
 		 463 aa  71.2  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  31.29 
 
 		 458 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  31.29 
 
 		 458 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  33.73 
 
 		 459 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  41.32 
 
 		 447 aa  71.2  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1291  GTP-binding protein EngA  32.52 
 
 		 436 aa  71.2  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0244351  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  31.29 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0460  GTP-binding protein EngA  31.93 
 
 		 436 aa  70.5  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  31.06 
 
 		 461 aa  70.1  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  33.13 
 
 		 463 aa  70.1  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  31.9 
 
 		 458 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0199  tRNA modification GTPase TrmE  33.97 
 
 		 426 aa  70.1  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.649237 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0217  tRNA modification GTPase TrmE  31.46 
 
 		 476 aa  70.5  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0500389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0526  tRNA modification GTPase TrmE  38.52 
 
 		 446 aa  70.1  0.00000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  35.67 
 
 		 462 aa  70.1  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  31.29 
 
 		 458 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  32.32 
 
 		 458 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2599  tRNA modification GTPase TrmE  32.72 
 
 		 437 aa  69.3  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.157289 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  31.29 
 
 		 458 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1753  ribosome-associated GTPase EngA  29.76 
 
 		 477 aa  68.9  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0764  GTP-binding protein EngA  29.88 
 
 		 437 aa  68.9  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000517804  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15330  cytidylate kinase  31.33 
 
 		 755 aa  68.9  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.201651  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  34.15 
 
 		 464 aa  69.3  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2889  tRNA modification GTPase TrmE  32.14 
 
 		 464 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  33.76 
 
 		 460 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3073  tRNA modification GTPase TrmE  33.13 
 
 		 446 aa  68.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2453  tRNA modification GTPase TrmE  37.19 
 
 		 450 aa  68.9  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4133  tRNA modification GTPase TrmE  35.9 
 
 		 456 aa  68.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0053  GTP-binding protein EngA  32.93 
 
 		 460 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1227  GTP-binding protein EngA  29.94 
 
 		 436 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.718862  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  30.71 
 
 		 460 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1458  GTP-binding protein EngA  31.35 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548717  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5049  tRNA modification GTPase TrmE  31.25 
 
 		 471 aa  68.2  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0840037  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2929  tRNA modification GTPase TrmE  33.73 
 
 		 446 aa  68.2  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  32.53 
 
 		 473 aa  67.8  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  35.4 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1559  GTP-binding protein EngA  29.34 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0922672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1631  GTP-binding protein EngA  29.34 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1414  GTP-binding protein EngA  29.34 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1386  GTP-binding protein EngA  29.34 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.844345  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02641  tRNA modification GTPase TrmE  32.02 
 
 		 464 aa  67.4  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1667  GTP-binding protein EngA  29.34 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1386  GTP-binding protein EngA  29.34 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0845142  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3656  tRNA modification GTPase TrmE  32.72 
 
 		 460 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1598  GTP-binding protein EngA  29.34 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000589883 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1525  GTP-binding protein EngA  29.34 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0223  small GTP-binding protein  32.53 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294804  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  32.53 
 
 		 452 aa  67.8  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02181  tRNA modification GTPase TrmE  36.89 
 
 		 461 aa  67.4  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>