More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0199 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0199  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 
426 aa  825    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.649237 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1230  tRNA modification GTPase TrmE  54.55 
 
 
428 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2891  tRNA modification GTPase TrmE  54.55 
 
 
428 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2864  tRNA modification GTPase TrmE  53.72 
 
 
428 aa  400  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2667  tRNA modification GTPase TrmE  54.31 
 
 
428 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0398705  normal  0.380735 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3454  tRNA modification GTPase TrmE  52.67 
 
 
429 aa  388  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1833  tRNA modification GTPase TrmE  46.42 
 
 
431 aa  299  5e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0890064  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0858  tRNA modification GTPase TrmE  42.89 
 
 
442 aa  295  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1272  tRNA modification GTPase TrmE  46.07 
 
 
438 aa  291  1e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.803467 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2587  tRNA modification GTPase TrmE  42.2 
 
 
448 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1284  tRNA modification GTPase TrmE  42.37 
 
 
451 aa  287  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2062  tRNA modification GTPase TrmE  41.51 
 
 
442 aa  281  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00847213  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1982  tRNA modification GTPase TrmE  41.51 
 
 
442 aa  281  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.535641  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0003  tRNA modification GTPase TrmE  44.32 
 
 
419 aa  280  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0297  tRNA modification GTPase TrmE  43.15 
 
 
441 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3931  tRNA modification GTPase TrmE  41.57 
 
 
437 aa  270  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4390  tRNA modification GTPase TrmE  40.55 
 
 
436 aa  269  8.999999999999999e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1029  tRNA modification GTPase TrmE  44.49 
 
 
434 aa  266  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.111023  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2964  tRNA modification GTPase TrmE  42.37 
 
 
438 aa  266  4e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0098  tRNA modification GTPase TrmE  40.75 
 
 
456 aa  266  7e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0727899 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0392  tRNA modification GTPase TrmE  42.3 
 
 
460 aa  266  7e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3205  tRNA modification GTPase TrmE  40.5 
 
 
440 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3472  tRNA modification GTPase TrmE  41.06 
 
 
442 aa  263  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1658  tRNA modification GTPase TrmE  42.66 
 
 
444 aa  260  4e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.844134  normal  0.296272 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0429  tRNA modification GTPase TrmE  40.6 
 
 
462 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0164  tRNA modification GTPase TrmE  41.76 
 
 
445 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.364073  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4257  tRNA modification GTPase TrmE  40.14 
 
 
437 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.910878 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1580  tRNA modification GTPase TrmE  42.56 
 
 
444 aa  255  9e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.183316 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5023  tRNA modification GTPase TrmE  41.09 
 
 
447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584026  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0010  tRNA modification GTPase TrmE  37.36 
 
 
435 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000341639  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0717  tRNA modification GTPase TrmE  44.74 
 
 
550 aa  252  9.000000000000001e-66  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4484  tRNA modification GTPase TrmE  37.33 
 
 
459 aa  252  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000179125 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3612  tRNA modification GTPase TrmE  39.7 
 
 
455 aa  251  2e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4001  tRNA modification GTPase TrmE  37.28 
 
 
453 aa  250  4e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.73411  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0008  tRNA modification GTPase TrmE  37.47 
 
 
453 aa  250  4e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185087  hitchhiker  0.000721309 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4378  tRNA modification GTPase TrmE  37.04 
 
 
453 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0292979  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0106  tRNA modification GTPase TrmE  40.35 
 
 
457 aa  249  5e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.446893  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4324  tRNA modification GTPase TrmE  37.04 
 
 
453 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0616134  unclonable  0.00000000000430527 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1411  tRNA modification GTPase TrmE  42.25 
 
 
437 aa  249  7e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4520  tRNA modification GTPase TrmE  37.04 
 
 
453 aa  249  9e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.30842  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4379  tRNA modification GTPase TrmE  37.04 
 
 
479 aa  249  9e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000434128  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0005  tRNA modification GTPase TrmE  36.95 
 
 
453 aa  247  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.135343  hitchhiker  0.00000014804 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3939  tRNA modification GTPase TrmE  37.06 
 
 
453 aa  247  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000114268 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2407  tRNA modification GTPase TrmE  40.74 
 
 
433 aa  245  9e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0003  tRNA modification GTPase TrmE  36.92 
 
 
457 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0001  tRNA modification GTPase TrmE  36.82 
 
 
453 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.201746  hitchhiker  0.00000000323985 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4031  tRNA modification GTPase TrmE  36.73 
 
 
453 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.608873  hitchhiker  0.001302 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4256  tRNA modification GTPase TrmE  37.04 
 
 
453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257081  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3774  tRNA modification GTPase TrmE  37.64 
 
 
466 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0161001  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3865  tRNA modification GTPase TrmE  36.7 
 
 
453 aa  244  3e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000363316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1859  tRNA modification GTPase TrmE  42.33 
 
 
444 aa  244  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4062  tRNA modification GTPase TrmE  36.84 
 
 
453 aa  243  5e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.112278  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4013  tRNA modification GTPase TrmE  36.6 
 
 
456 aa  243  6e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.205295  normal  0.289015 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4081  tRNA modification GTPase TrmE  41.65 
 
 
441 aa  242  7e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0162579 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0132  tRNA modification GTPase TrmE  37.75 
 
 
452 aa  242  7e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.849325  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4148  tRNA modification GTPase TrmE  37.53 
 
 
454 aa  241  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.421634  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0291  tRNA modification GTPase TrmE  39.56 
 
 
449 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3894  tRNA modification GTPase TrmE  39.96 
 
 
456 aa  240  2.9999999999999997e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4158  tRNA modification GTPase TrmE  37.85 
 
 
454 aa  240  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000196641  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4183  tRNA modification GTPase TrmE  37.85 
 
 
454 aa  239  5e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000380111  normal  0.0649437 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4245  tRNA modification GTPase TrmE  37.85 
 
 
454 aa  239  5.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00411948  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4292  tRNA modification GTPase TrmE  36.72 
 
 
454 aa  238  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1940  tRNA modification GTPase TrmE  39.23 
 
 
435 aa  238  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.704243  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2775  tRNA modification GTPase TrmE  36.02 
 
 
452 aa  238  1e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00435  tRNA modification GTPase TrmE  36.97 
 
 
453 aa  237  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4055  tRNA modification GTPase TrmE  37.06 
 
 
454 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.765231  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4177  tRNA modification GTPase TrmE  37.06 
 
 
467 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4127  tRNA modification GTPase TrmE  37.06 
 
 
454 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357729  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4070  tRNA modification GTPase TrmE  37.06 
 
 
467 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125734  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4234  tRNA modification GTPase TrmE  37.06 
 
 
467 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0027  tRNA modification GTPase TrmE  37.01 
 
 
454 aa  236  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3624  tRNA modification GTPase TrmE  40.92 
 
 
455 aa  236  6e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.473452  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0137  tRNA modification GTPase TrmE  37.75 
 
 
437 aa  235  9e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3315  tRNA modification GTPase TrmE  36.44 
 
 
458 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4310  tRNA modification GTPase TrmE  36.56 
 
 
460 aa  234  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.671502  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002017  GTPase and tRNA-U34 5-formylation enzyme TrmE  36.05 
 
 
453 aa  233  4.0000000000000004e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0189213  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4615  tRNA modification GTPase TrmE  36.29 
 
 
454 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4928  tRNA modification GTPase TrmE  35.73 
 
 
453 aa  233  6e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0035842  hitchhiker  0.00000248868 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  34.15 
 
 
475 aa  233  7.000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0060  tRNA modification GTPase TrmE  36.06 
 
 
439 aa  232  9e-60  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.646746  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4260  tRNA modification GTPase TrmE  35.67 
 
 
454 aa  231  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5049  tRNA modification GTPase TrmE  33.48 
 
 
471 aa  231  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0840037  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4073  tRNA modification GTPase TrmE  35.67 
 
 
454 aa  231  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.420944  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0526  tRNA modification GTPase TrmE  33.56 
 
 
446 aa  231  1e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4288  tRNA modification GTPase TrmE  35.67 
 
 
454 aa  231  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4219  tRNA modification GTPase TrmE  35.67 
 
 
454 aa  231  1e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.99545  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2515  tRNA modification GTPase TrmE  36.23 
 
 
464 aa  231  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310293  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5136  tRNA modification GTPase TrmE  35.45 
 
 
454 aa  230  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.041745  normal  0.0619684 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52440  tRNA modification GTPase TrmE  38.04 
 
 
455 aa  230  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03590  tRNA modification GTPase  35.45 
 
 
454 aa  230  4e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0032  tRNA modification GTPase TrmE  35.92 
 
 
441 aa  230  4e-59  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3920  tRNA modification GTPase TrmE  35.45 
 
 
454 aa  230  4e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189642  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03534  hypothetical protein  35.45 
 
 
454 aa  230  4e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2929  tRNA modification GTPase TrmE  35.25 
 
 
446 aa  230  5e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73400  tRNA modification GTPase TrmE  37.22 
 
 
455 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000503354  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4034  tRNA modification GTPase TrmE  36.24 
 
 
453 aa  228  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.461545  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5611  tRNA modification GTPase TrmE  37.06 
 
 
456 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4263  tRNA modification GTPase TrmE  35.82 
 
 
454 aa  228  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226045  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3073  tRNA modification GTPase TrmE  35.04 
 
 
446 aa  227  3e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4216  tRNA modification GTPase TrmE  35.23 
 
 
454 aa  227  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.021791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>