More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1494 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1629  GTPases  72.79 
 
 		 416 aa  634    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000232915  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1494  small GTP-binding protein  100 
 
 		 412 aa  823    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1843  small GTP-binding protein  70.2 
 
 		 422 aa  583  1.0000000000000001e-165  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1387  small GTP-binding protein  56.93 
 
 		 410 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0637341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0183  small GTP-binding protein  55.61 
 
 		 408 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2152  small GTP-binding protein  56.61 
 
 		 409 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0683  small GTP-binding protein  53.41 
 
 		 408 aa  435  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00203334  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2276  small GTP-binding protein domain-containing protein  55.73 
 
 		 400 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1277  small GTP-binding protein domain-containing protein  56.16 
 
 		 405 aa  437  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.038791  hitchhiker  0.00000385407 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0318  small GTP-binding protein domain-containing protein  56.64 
 
 		 402 aa  436  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1243  small GTP-binding protein  55.83 
 
 		 425 aa  432  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0165  small GTP-binding protein  56.3 
 
 		 427 aa  429  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0473  small GTP-binding protein  50.37 
 
 		 403 aa  403  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0038153  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0042  small GTP-binding protein  51.11 
 
 		 400 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19310  small GTP-binding protein  48.92 
 
 		 411 aa  393  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00194835  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0146  small GTP-binding protein  55.39 
 
 		 398 aa  386  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0325934  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3256  small GTP-binding protein  49.75 
 
 		 412 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00305193  hitchhiker  0.00001491 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0705  small GTP-binding protein  49.38 
 
 		 412 aa  386  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.131335  hitchhiker  0.000692522 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3926  GTP-binding protein  50.39 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3103  small GTP-binding protein  49.49 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1569  small GTP-binding protein  46.06 
 
 		 407 aa  377  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.627873  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2081  small GTP-binding protein  47.28 
 
 		 416 aa  375  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000627073  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1501  small GTP-binding protein  50.25 
 
 		 408 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.206775  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0490  small GTP-binding protein  43.64 
 
 		 404 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0475  small GTP-binding protein  43.64 
 
 		 404 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0103  GTP-binding protein  43.22 
 
 		 440 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000228129  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0245  small GTP-binding protein  43.89 
 
 		 403 aa  335  7e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31412  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0106  GTP-binding protein  43.22 
 
 		 440 aa  333  3e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16490  iron-only hydrogenase maturation protein HydF  45.16 
 
 		 416 aa  329  5.0000000000000004e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.520712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1361  small GTP-binding protein  41.88 
 
 		 396 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.311924  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2638  small GTP-binding protein  42.53 
 
 		 394 aa  317  4e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  42 
 
 		 398 aa  308  1.0000000000000001e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0272  small GTP-binding protein  41.88 
 
 		 382 aa  269  5.9999999999999995e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.934792  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0266  small GTP-binding protein  38.5 
 
 		 377 aa  266  4e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.410874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1098  small GTP-binding protein domain-containing protein  47.47 
 
 		 262 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0435  GTP-binding protein EngA  37.31 
 
 		 460 aa  81.3  0.00000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0409  GTP-binding protein EngA  37.31 
 
 		 460 aa  81.3  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  33.14 
 
 		 458 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1753  ribosome-associated GTPase EngA  36.05 
 
 		 477 aa  80.1  0.00000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0536  GTP-binding protein EngA  37.59 
 
 		 461 aa  79.7  0.00000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1556  tRNA modification GTPase TrmE  40.98 
 
 		 464 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0053  GTP-binding protein EngA  37.8 
 
 		 460 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  30.74 
 
 		 463 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1572  GTP-binding protein EngA  36.57 
 
 		 460 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02641  tRNA modification GTPase TrmE  41.67 
 
 		 464 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  29.63 
 
 		 464 aa  78.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  36.36 
 
 		 458 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  36.36 
 
 		 458 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  36.36 
 
 		 458 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  36.36 
 
 		 458 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  36.36 
 
 		 458 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0777  GTP-binding protein EngA  40 
 
 		 462 aa  77.4  0.0000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0392  GTP-binding protein EngA  33.33 
 
 		 494 aa  77.4  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  31.76 
 
 		 447 aa  77  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1582  tRNA modification GTPase TrmE  33.73 
 
 		 462 aa  76.3  0.0000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  35.76 
 
 		 458 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04098  tRNA modification GTPase  34.09 
 
 		 462 aa  75.1  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  35.76 
 
 		 458 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  35.76 
 
 		 458 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  35.22 
 
 		 460 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  35.76 
 
 		 458 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  32.73 
 
 		 459 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1339  GTP-binding protein EngA  41.13 
 
 		 463 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  36.26 
 
 		 461 aa  74.3  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  34.76 
 
 		 458 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  40 
 
 		 458 aa  73.6  0.000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1186  GTP-binding protein EngA  37.59 
 
 		 461 aa  73.2  0.000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2453  tRNA modification GTPase TrmE  43.55 
 
 		 450 aa  73.2  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  37.91 
 
 		 462 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  34.55 
 
 		 458 aa  72  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3233  tRNA modification GTPase TrmE  36.59 
 
 		 467 aa  72  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  35.12 
 
 		 460 aa  71.6  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2146  GTP-binding protein EngA  37.66 
 
 		 493 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  34.59 
 
 		 460 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  33.99 
 
 		 463 aa  71.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0886  tRNA modification GTPase TrmE  39.38 
 
 		 478 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00940326 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2103  GTP-binding protein EngA  39.19 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  36.47 
 
 		 462 aa  70.5  0.00000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  42.15 
 
 		 461 aa  70.9  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3213  tRNA modification GTPase TrmE  35.88 
 
 		 489 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  36.02 
 
 		 455 aa  70.1  0.00000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3097  tRNA modification GTPase TrmE  35.88 
 
 		 464 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151562  normal  0.0117151 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4774  tRNA modification GTPase TrmE  31.58 
 
 		 467 aa  70.1  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  32.02 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6518  tRNA modification GTPase TrmE  35.29 
 
 		 464 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  32.02 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2824  tRNA modification GTPase TrmE  36.65 
 
 		 446 aa  69.3  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2136  tRNA modification GTPase TrmE  40.83 
 
 		 451 aa  69.3  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4089  tRNA modification GTPase TrmE  36.25 
 
 		 448 aa  69.7  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0132  tRNA modification GTPase TrmE  31.43 
 
 		 452 aa  69.3  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.849325  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3984  tRNA modification GTPase TrmE  33.75 
 
 		 464 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  38.33 
 
 		 456 aa  69.7  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1430  tRNA modification GTPase TrmE  32.42 
 
 		 461 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299442  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3073  tRNA modification GTPase TrmE  36.02 
 
 		 446 aa  68.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2775  tRNA modification GTPase TrmE  36.02 
 
 		 452 aa  68.6  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4469  tRNA modification GTPase TrmE  33.75 
 
 		 464 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0533201 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4200  tRNA modification GTPase TrmE  35.19 
 
 		 448 aa  68.2  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0153583 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2472  tRNA modification GTPase TrmE  33.33 
 
 		 487 aa  67.8  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000689916 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4263  tRNA modification GTPase TrmE  33.14 
 
 		 454 aa  67.8  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226045  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  31.98 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>