More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0392 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0392  GTP-binding protein EngA  100 
 
 
494 aa  1000    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1753  ribosome-associated GTPase EngA  56.65 
 
 
477 aa  551  1e-155  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0435  GTP-binding protein EngA  50.51 
 
 
460 aa  497  1e-139  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0409  GTP-binding protein EngA  50.1 
 
 
460 aa  497  1e-139  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1572  GTP-binding protein EngA  49.9 
 
 
460 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1339  GTP-binding protein EngA  51.82 
 
 
463 aa  488  1e-137  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0536  GTP-binding protein EngA  50.1 
 
 
461 aa  481  1e-134  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1186  GTP-binding protein EngA  48.69 
 
 
461 aa  481  1e-134  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0777  GTP-binding protein EngA  48.69 
 
 
462 aa  476  1e-133  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0053  GTP-binding protein EngA  48.58 
 
 
460 aa  453  1.0000000000000001e-126  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2159  GTP-binding protein EngA  35.83 
 
 
436 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000018961  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1667  GTP-binding protein EngA  36.38 
 
 
436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1414  GTP-binding protein EngA  36.38 
 
 
436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1386  GTP-binding protein EngA  36.38 
 
 
436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.844345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1386  GTP-binding protein EngA  36.38 
 
 
436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0845142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1525  GTP-binding protein EngA  36.38 
 
 
436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1559  GTP-binding protein EngA  36.38 
 
 
436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0922672  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1598  GTP-binding protein EngA  36.38 
 
 
436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000589883 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1631  GTP-binding protein EngA  36.38 
 
 
436 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1428  GTP-binding protein EngA  35.77 
 
 
436 aa  301  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3785  GTP-binding protein EngA  35.57 
 
 
436 aa  302  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0456792  normal  0.0699486 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1227  GTP-binding protein EngA  34.76 
 
 
436 aa  300  3e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.718862  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1177  GTP-binding protein  34.82 
 
 
441 aa  300  4e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1395  GTP-binding protein EngA  34.82 
 
 
441 aa  300  5e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1204  GTP-binding protein EngA  35.02 
 
 
442 aa  298  2e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.109244  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0764  GTP-binding protein EngA  35.43 
 
 
437 aa  295  1e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000517804  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  34.27 
 
 
439 aa  290  3e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1291  GTP-binding protein EngA  35.56 
 
 
436 aa  290  3e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0244351  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1043  GTP-binding protein EngA  33.74 
 
 
436 aa  282  9e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.617691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3568  GTP-binding protein EngA  34.39 
 
 
455 aa  281  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3751  GTP-binding protein EngA  35.5 
 
 
449 aa  280  5e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4633  GTP-binding protein EngA  36.4 
 
 
511 aa  278  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1630  small GTP-binding protein  34.82 
 
 
440 aa  274  2.0000000000000002e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.52918  hitchhiker  0.00197431 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2713  GTP-binding protein EngA  34.69 
 
 
490 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004345  GTP-binding protein EngA  36.21 
 
 
498 aa  271  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1325  GTP-binding protein EngA  34.77 
 
 
511 aa  271  2e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.359502  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01071  GTP-binding protein EngA  35.11 
 
 
498 aa  271  2.9999999999999997e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0893  GTP-binding protein EngA  35.12 
 
 
427 aa  269  7e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177025  hitchhiker  0.0000000000000146029 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  33.33 
 
 
441 aa  269  1e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1160  GTP-binding protein EngA  32.86 
 
 
439 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0769833  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  30.78 
 
 
441 aa  265  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1422  ribosome-associated GTPase EngA  33.27 
 
 
484 aa  265  2e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0733  GTP-binding protein EngA  35.11 
 
 
500 aa  264  3e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2886  GTP-binding protein EngA  34.14 
 
 
490 aa  261  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000684219  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0577  GTP-binding protein EngA  32.46 
 
 
435 aa  261  2e-68  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.416412  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1122  GTP-binding protein EngA  33.67 
 
 
497 aa  260  5.0000000000000005e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.827994  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1262  GTP-binding protein EngA  34.35 
 
 
495 aa  259  6e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.763175  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2663  GTP-binding protein EngA  33.94 
 
 
490 aa  259  7e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.194974 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02403  GTP-binding protein EngA  33.94 
 
 
490 aa  259  8e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000560332  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1157  small GTP-binding protein  33.94 
 
 
490 aa  259  8e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000141762  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02365  hypothetical protein  33.94 
 
 
490 aa  259  8e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00134909  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2795  GTP-binding protein EngA  33.94 
 
 
490 aa  259  8e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000215643  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1166  GTP-binding protein EngA  33.94 
 
 
490 aa  259  8e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000585661  normal  0.0127623 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3735  GTP-binding protein EngA  33.94 
 
 
490 aa  259  8e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0134821  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2662  GTP-binding protein EngA  33.94 
 
 
490 aa  259  8e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000307508  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2134  GTP-binding protein EngA  33.33 
 
 
458 aa  258  1e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0583205  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3005  GTP-binding protein EngA  33.4 
 
 
490 aa  256  5e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.198767  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3010  GTP-binding protein EngA  34.21 
 
 
495 aa  256  5e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10530  small GTP-binding protein  31.58 
 
 
438 aa  256  8e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0728  small GTP-binding protein  33.27 
 
 
441 aa  251  2e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.390352 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1224  ribosome-associated GTPase EngA  33.53 
 
 
447 aa  250  4e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0752  GTP-binding protein EngA  31.05 
 
 
440 aa  249  7e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00177757 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2204  GTP-binding protein EngA  32.3 
 
 
465 aa  249  8e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199328  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2292  GTP-binding protein EngA  32.3 
 
 
465 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0406895  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4247  GTP-binding protein EngA  33.4 
 
 
498 aa  248  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0737  GTP-binding protein EngA  31.05 
 
 
440 aa  248  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1232  GTP-binding protein EngA  31.76 
 
 
488 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1233  GTP-binding protein EngA  31.76 
 
 
488 aa  248  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3308  GTP-binding protein EngA  31.76 
 
 
487 aa  247  3e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1303  GTP-binding protein EngA  31.76 
 
 
488 aa  247  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3605  GTP-binding protein EngA  33.6 
 
 
494 aa  247  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2648  GTP-binding protein EngA  31.76 
 
 
488 aa  247  4e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0292  GTP-binding protein EngA  32.99 
 
 
494 aa  247  4e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1190  GTP-binding protein EngA  33.67 
 
 
495 aa  246  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000499446  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2028  GTP-binding protein EngA  31.76 
 
 
455 aa  245  9.999999999999999e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.89204  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4321  GTP-binding protein EngA  33.95 
 
 
487 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000597657 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0414  GTP-binding protein EngA  33.67 
 
 
495 aa  246  9.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0317617  hitchhiker  0.000999032 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1297  GTP-binding protein EngA  33.67 
 
 
495 aa  246  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3587  small GTP-binding protein  30.95 
 
 
495 aa  246  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.748458  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0900  GTP-binding protein EngA  34.76 
 
 
487 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000256408 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0387  GTP-binding protein EngA  31.6 
 
 
457 aa  244  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0644  GTP-binding protein EngA  31.97 
 
 
455 aa  243  5e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1131  GTP-binding protein EngA  30.94 
 
 
473 aa  243  5e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2361  GTP-binding protein EngA  32.38 
 
 
488 aa  243  5e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.596104  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2858  small GTP-binding protein protein  32.92 
 
 
467 aa  243  6e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21511  GTP-binding protein EngA  31.97 
 
 
461 aa  242  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0857  GTP-binding protein EngA  34.36 
 
 
487 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1614  GTP-binding protein EngA  31.63 
 
 
499 aa  241  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106208 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04111  GTP-binding protein EngA  31.4 
 
 
457 aa  241  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04421  GTP-binding protein EngA  31.4 
 
 
457 aa  240  4e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02977  GTP-binding protein EngA  32.92 
 
 
481 aa  240  5e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1315  GTP-binding protein EngA  32.99 
 
 
493 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0887  GTP-binding protein EngA  33.88 
 
 
487 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.283319 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0980  ribosome-associated GTPase EngA  31.85 
 
 
478 aa  239  8e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14930  GTP-binding protein EngA  32.99 
 
 
493 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3492  small GTP-binding protein  31.64 
 
 
473 aa  239  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.166224 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0625  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.38 
 
 
480 aa  238  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3122  GTP-binding protein EngA  32.58 
 
 
482 aa  237  4e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04531  GTP-binding protein EngA  31 
 
 
458 aa  237  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.491515  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2263  GTP-binding protein EngA  32.23 
 
 
506 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>