More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2638 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_2638  small GTP-binding protein  100 
 
 		 394 aa  798    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3103  small GTP-binding protein  53.83 
 
 		 396 aa  434  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0318  small GTP-binding protein domain-containing protein  47.45 
 
 		 402 aa  358  6e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0683  small GTP-binding protein  48.23 
 
 		 408 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00203334  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0146  small GTP-binding protein  46.17 
 
 		 398 aa  355  8.999999999999999e-97  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0325934  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0473  small GTP-binding protein  46.72 
 
 		 403 aa  350  2e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0038153  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2152  small GTP-binding protein  46.94 
 
 		 409 aa  350  4e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19310  small GTP-binding protein  45.2 
 
 		 411 aa  347  2e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00194835  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1277  small GTP-binding protein domain-containing protein  45.15 
 
 		 405 aa  342  7e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.038791  hitchhiker  0.00000385407 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0165  small GTP-binding protein  44.08 
 
 		 427 aa  334  2e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1843  small GTP-binding protein  44.05 
 
 		 422 aa  333  3e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1629  GTPases  43.51 
 
 		 416 aa  333  4e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000232915  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16490  iron-only hydrogenase maturation protein HydF  43.43 
 
 		 416 aa  333  4e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.520712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1243  small GTP-binding protein  45.09 
 
 		 425 aa  332  9e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0183  small GTP-binding protein  44.64 
 
 		 408 aa  330  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0106  GTP-binding protein  43.36 
 
 		 440 aa  329  4e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0103  GTP-binding protein  43.36 
 
 		 440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000228129  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1569  small GTP-binding protein  45.77 
 
 		 407 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.627873  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0042  small GTP-binding protein  44.75 
 
 		 400 aa  326  5e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0705  small GTP-binding protein  42.24 
 
 		 412 aa  318  1e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.131335  hitchhiker  0.000692522 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1494  small GTP-binding protein  42.53 
 
 		 412 aa  317  3e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1387  small GTP-binding protein  41.52 
 
 		 410 aa  312  7.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0637341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3256  small GTP-binding protein  41.84 
 
 		 412 aa  311  1e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00305193  hitchhiker  0.00001491 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  43.49 
 
 		 398 aa  308  9e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2276  small GTP-binding protein domain-containing protein  41.37 
 
 		 400 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2081  small GTP-binding protein  41.52 
 
 		 416 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000627073  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3926  GTP-binding protein  40.26 
 
 		 394 aa  297  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0245  small GTP-binding protein  40.92 
 
 		 403 aa  295  1e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31412  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0272  small GTP-binding protein  42.13 
 
 		 382 aa  286  5.999999999999999e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.934792  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0475  small GTP-binding protein  38.72 
 
 		 404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0490  small GTP-binding protein  38.72 
 
 		 404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1361  small GTP-binding protein  39.22 
 
 		 396 aa  279  5e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.311924  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1501  small GTP-binding protein  38.83 
 
 		 408 aa  276  4e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.206775  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0266  small GTP-binding protein  41.51 
 
 		 377 aa  245  9.999999999999999e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.410874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1098  small GTP-binding protein domain-containing protein  46.43 
 
 		 262 aa  187  3e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0392  GTP-binding protein EngA  32.18 
 
 		 494 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0132  tRNA modification GTPase TrmE  36.36 
 
 		 452 aa  79  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.849325  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1753  ribosome-associated GTPase EngA  34.09 
 
 		 477 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0777  GTP-binding protein EngA  36.48 
 
 		 462 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2143  tRNA modification GTPase TrmE  30.85 
 
 		 478 aa  77.4  0.0000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0104732  hitchhiker  0.000152188 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0053  GTP-binding protein EngA  34.87 
 
 		 460 aa  77  0.0000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1339  GTP-binding protein EngA  41.73 
 
 		 463 aa  76.3  0.0000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12578  putative tRNA modification GTPase  35.37 
 
 		 469 aa  75.9  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2472  tRNA modification GTPase TrmE  30.69 
 
 		 487 aa  75.5  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000689916 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1572  GTP-binding protein EngA  33.33 
 
 		 460 aa  73.6  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1186  GTP-binding protein EngA  35.98 
 
 		 461 aa  73.9  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4263  tRNA modification GTPase TrmE  32.32 
 
 		 454 aa  72.8  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226045  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4034  tRNA modification GTPase TrmE  31.1 
 
 		 453 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.461545  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0435  GTP-binding protein EngA  32.18 
 
 		 460 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04098  tRNA modification GTPase  33.93 
 
 		 462 aa  72  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6518  tRNA modification GTPase TrmE  34.62 
 
 		 464 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0409  GTP-binding protein EngA  32.18 
 
 		 460 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0953  ribosome-associated GTPase EngA  35.58 
 
 		 437 aa  70.5  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0828  ribosome-associated GTPase EngA  30.25 
 
 		 734 aa  70.9  0.00000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2547  tRNA modification GTPase TrmE  34.62 
 
 		 464 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0461446  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3213  tRNA modification GTPase TrmE  33.97 
 
 		 489 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3161  tRNA modification GTPase TrmE  34.62 
 
 		 464 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.399046  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2316  tRNA modification GTPase TrmE  33.55 
 
 		 456 aa  70.1  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.64098  normal  0.135497 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3179  tRNA modification GTPase TrmE  34.62 
 
 		 464 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0373252  hitchhiker  0.000409063 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4292  tRNA modification GTPase TrmE  31.1 
 
 		 454 aa  70.1  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3315  tRNA modification GTPase TrmE  33.73 
 
 		 458 aa  69.7  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3456  tRNA modification GTPase TrmE  36.43 
 
 		 481 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl014  tRNA modification GTPase TrmE  33.33 
 
 		 452 aa  68.9  0.0000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3755  tRNA modification GTPase TrmE  36.43 
 
 		 481 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3096  tRNA modification GTPase TrmE  35.14 
 
 		 466 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000134747 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0376  tRNA modification GTPase TrmE  35.23 
 
 		 464 aa  68.9  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.831872  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2387  tRNA modification GTPase TrmE  30.37 
 
 		 465 aa  69.3  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.188748  hitchhiker  0.000106684 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3097  tRNA modification GTPase TrmE  33.97 
 
 		 464 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151562  normal  0.0117151 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  32.69 
 
 		 452 aa  68.9  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4310  tRNA modification GTPase TrmE  32.93 
 
 		 460 aa  69.3  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.671502  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  34.21 
 
 		 473 aa  69.3  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0314  tRNA modification GTPase TrmE  33.14 
 
 		 450 aa  68.9  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00576337  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0929  GTP-binding protein Era  31.64 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163867  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1336  tRNA modification GTPase TrmE  32.97 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13281  GTP-binding protein Era-like protein  31.76 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.593826 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  32.48 
 
 		 461 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2392  tRNA modification GTPase TrmE  29.27 
 
 		 468 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0118764  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0463  bifunctional cytidylate kinase/GTP-binding protein  30.86 
 
 		 709 aa  68.6  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.816012  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0536  GTP-binding protein EngA  36.92 
 
 		 461 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0994  GTP-binding protein Era  31.64 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.307835  normal  0.0847852 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1904  tRNA modification GTPase TrmE  42.53 
 
 		 472 aa  68.9  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6368  tRNA modification GTPase TrmE  31.71 
 
 		 455 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0005  tRNA modification GTPase TrmE  36.72 
 
 		 481 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75194  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1272  GTP-binding protein EngA  27.89 
 
 		 490 aa  68.2  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4234  tRNA modification GTPase TrmE  31.71 
 
 		 467 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03489  tRNA modification GTPase TrmE  43.96 
 
 		 446 aa  67.8  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4070  tRNA modification GTPase TrmE  31.71 
 
 		 467 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125734  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  31.95 
 
 		 475 aa  68.2  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4055  tRNA modification GTPase TrmE  31.71 
 
 		 454 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.765231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4127  tRNA modification GTPase TrmE  31.71 
 
 		 454 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4177  tRNA modification GTPase TrmE  31.71 
 
 		 467 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3152  tRNA modification GTPase TrmE  33.97 
 
 		 464 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000246642 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3038  tRNA modification GTPase TrmE  32.05 
 
 		 448 aa  67.4  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.38062  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3233  tRNA modification GTPase TrmE  33.54 
 
 		 467 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4158  tRNA modification GTPase TrmE  31.1 
 
 		 454 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000196641  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0027  tRNA modification GTPase TrmE  31.1 
 
 		 454 aa  67.8  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1323  GTP-binding protein Era  32.37 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0411499  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73400  tRNA modification GTPase TrmE  31.71 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000503354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  30.36 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0825  tRNA modification GTPase TrmE  35.38 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>