More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0376 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0376  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 464 aa  915    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.831872  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  36.24 
 
 		 455 aa  281  1e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  36.5 
 
 		 460 aa  277  3e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  36.09 
 
 		 458 aa  271  1e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  37.15 
 
 		 458 aa  266  5e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  36.94 
 
 		 458 aa  265  2e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  34.05 
 
 		 458 aa  259  6e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  34.26 
 
 		 458 aa  259  8e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  34.26 
 
 		 458 aa  259  8e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  34.26 
 
 		 458 aa  259  8e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  34.26 
 
 		 458 aa  259  8e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  34.26 
 
 		 458 aa  259  8e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  34.55 
 
 		 458 aa  258  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  34.05 
 
 		 458 aa  258  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  35 
 
 		 456 aa  257  4e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  34.55 
 
 		 459 aa  256  5e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  34.05 
 
 		 458 aa  256  6e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  34.05 
 
 		 458 aa  256  6e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  33.41 
 
 		 459 aa  256  7e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  33.84 
 
 		 458 aa  256  7e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  33.19 
 
 		 461 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  33.62 
 
 		 458 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1733  tRNA modification GTPase TrmE  35.29 
 
 		 452 aa  254  3e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000059641  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  32.18 
 
 		 463 aa  252  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4619  tRNA modification GTPase TrmE  31.05 
 
 		 455 aa  251  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  33.47 
 
 		 460 aa  249  8e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  33.12 
 
 		 462 aa  246  4.9999999999999997e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1582  tRNA modification GTPase TrmE  31.76 
 
 		 462 aa  246  6e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  31.45 
 
 		 458 aa  243  6e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0555  tRNA modification GTPase TrmE  35.24 
 
 		 438 aa  243  6e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  34.82 
 
 		 458 aa  242  9e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0526  tRNA modification GTPase TrmE  33.9 
 
 		 446 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  32.54 
 
 		 461 aa  241  2.9999999999999997e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52440  tRNA modification GTPase TrmE  30.36 
 
 		 455 aa  240  4e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  32.1 
 
 		 455 aa  240  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  30.49 
 
 		 463 aa  239  5.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0002  tRNA modification GTPase TrmE  33.12 
 
 		 455 aa  239  5.999999999999999e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  33.05 
 
 		 459 aa  239  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  33.05 
 
 		 459 aa  239  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0179  tRNA modification GTPase TrmE  34.26 
 
 		 464 aa  238  2e-61  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2137  tRNA modification GTPase TrmE  28.42 
 
 		 461 aa  238  3e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.075642 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  30.8 
 
 		 455 aa  236  6e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  29.53 
 
 		 460 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  31.85 
 
 		 462 aa  236  6e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  35.62 
 
 		 447 aa  236  7e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4484  tRNA modification GTPase TrmE  32.4 
 
 		 459 aa  236  7e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000179125 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  29.53 
 
 		 460 aa  236  8e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3641  tRNA modification GTPase TrmE  30.24 
 
 		 460 aa  236  8e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0005  tRNA modification GTPase TrmE  30.34 
 
 		 456 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273487  hitchhiker  0.00022418 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4615  tRNA modification GTPase TrmE  31 
 
 		 454 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5308  tRNA modification GTPase TrmE  30.34 
 
 		 456 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.832252  normal  0.0803697 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  30.59 
 
 		 455 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2030  tRNA modification GTPase TrmE  33.26 
 
 		 460 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0132  tRNA modification GTPase TrmE  31.48 
 
 		 452 aa  234  3e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.849325  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4292  tRNA modification GTPase TrmE  30.36 
 
 		 454 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5443  tRNA modification GTPase TrmE  30.13 
 
 		 456 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5212  tRNA modification GTPase TrmE  30.13 
 
 		 456 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0979  tRNA modification GTPase TrmE  35.59 
 
 		 442 aa  233  8.000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.523955  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2373  tRNA modification GTPase TrmE  32.98 
 
 		 473 aa  232  1e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3159  tRNA modification GTPase TrmE  29.16 
 
 		 457 aa  232  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0217  tRNA modification GTPase TrmE  32.77 
 
 		 476 aa  231  2e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0500389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4183  tRNA modification GTPase TrmE  31.9 
 
 		 454 aa  230  3e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000380111  normal  0.0649437 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3894  tRNA modification GTPase TrmE  30.64 
 
 		 456 aa  230  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  30.45 
 
 		 458 aa  230  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  31 
 
 		 462 aa  230  4e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4245  tRNA modification GTPase TrmE  31.21 
 
 		 454 aa  230  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00411948  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  31.25 
 
 		 461 aa  230  4e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5611  tRNA modification GTPase TrmE  30.56 
 
 		 456 aa  230  5e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5133  tRNA modification GTPase TrmE  30.13 
 
 		 456 aa  229  6e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002017  GTPase and tRNA-U34 5-formylation enzyme TrmE  32.04 
 
 		 453 aa  229  6e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0189213  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  30.3 
 
 		 457 aa  229  6e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4013  tRNA modification GTPase TrmE  31.62 
 
 		 456 aa  229  6e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.205295  normal  0.289015 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  30.15 
 
 		 464 aa  229  7e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1036  tRNA modification GTPase TrmE  35.38 
 
 		 442 aa  229  8e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.788526  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4148  tRNA modification GTPase TrmE  31.4 
 
 		 454 aa  229  9e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.421634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5742  tRNA modification GTPase TrmE  30.98 
 
 		 456 aa  229  9e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2515  tRNA modification GTPase TrmE  31.18 
 
 		 464 aa  229  9e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310293  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  30.77 
 
 		 456 aa  229  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00435  tRNA modification GTPase TrmE  31.61 
 
 		 453 aa  228  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4774  tRNA modification GTPase TrmE  30.53 
 
 		 467 aa  229  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0027  tRNA modification GTPase TrmE  30.36 
 
 		 454 aa  228  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4158  tRNA modification GTPase TrmE  31.68 
 
 		 454 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000196641  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5136  tRNA modification GTPase TrmE  31.36 
 
 		 454 aa  228  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.041745  normal  0.0619684 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4263  tRNA modification GTPase TrmE  30.93 
 
 		 454 aa  228  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226045  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0248  tRNA modification GTPase TrmE  31.5 
 
 		 473 aa  227  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2410  tRNA modification GTPase TrmE  32.98 
 
 		 448 aa  227  3e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.749558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4260  tRNA modification GTPase TrmE  31.14 
 
 		 454 aa  227  4e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4073  tRNA modification GTPase TrmE  31.14 
 
 		 454 aa  227  4e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.420944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4288  tRNA modification GTPase TrmE  31.14 
 
 		 454 aa  227  4e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4219  tRNA modification GTPase TrmE  31.14 
 
 		 454 aa  227  4e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.99545  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73400  tRNA modification GTPase TrmE  29.83 
 
 		 455 aa  227  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000503354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0825  tRNA modification GTPase TrmE  35.32 
 
 		 442 aa  226  8e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2025  tRNA modification GTPase TrmE  31.45 
 
 		 473 aa  226  8e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2392  tRNA modification GTPase TrmE  28.51 
 
 		 468 aa  226  8e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0118764  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03590  tRNA modification GTPase  30.93 
 
 		 454 aa  225  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03534  hypothetical protein  30.93 
 
 		 454 aa  225  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3315  tRNA modification GTPase TrmE  29.81 
 
 		 458 aa  225  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04098  tRNA modification GTPase  30.59 
 
 		 462 aa  225  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3920  tRNA modification GTPase TrmE  30.93 
 
 		 454 aa  225  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189642  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4127  tRNA modification GTPase TrmE  30.51 
 
 		 454 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357729  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>