More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2662 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2662  small GTP-binding protein  100 
 
 
453 aa  907    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.144738  hitchhiker  0.00576403 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0953  ribosome-associated GTPase EngA  73.79 
 
 
437 aa  667    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2103  GTP-binding protein EngA  55.5 
 
 
441 aa  498  1e-140  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2159  GTP-binding protein EngA  40.85 
 
 
436 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000018961  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2632  small GTP-binding protein  41.46 
 
 
434 aa  323  4e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0460  GTP-binding protein EngA  41.52 
 
 
436 aa  322  6e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1758  small GTP-binding protein  42.6 
 
 
448 aa  319  7e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1160  GTP-binding protein EngA  41.53 
 
 
439 aa  317  3e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0769833  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  39.51 
 
 
441 aa  315  9.999999999999999e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1458  GTP-binding protein EngA  38.86 
 
 
445 aa  310  4e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548717  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1227  GTP-binding protein EngA  37.92 
 
 
436 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.718862  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  39.15 
 
 
438 aa  306  4.0000000000000004e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1172  small GTP-binding protein  40.72 
 
 
438 aa  306  7e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2108  GTP-binding protein EngA  38.82 
 
 
443 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000750275  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1204  GTP-binding protein EngA  40.18 
 
 
442 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.109244  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3149  GTP-binding protein EngA  37.75 
 
 
441 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.421281  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1177  GTP-binding protein  39.96 
 
 
441 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  38.85 
 
 
441 aa  303  6.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1414  GTP-binding protein EngA  36.57 
 
 
436 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1386  GTP-binding protein EngA  36.57 
 
 
436 aa  301  2e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.844345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1386  GTP-binding protein EngA  36.57 
 
 
436 aa  301  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0845142  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1667  GTP-binding protein EngA  36.57 
 
 
436 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1525  GTP-binding protein EngA  36.57 
 
 
436 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1559  GTP-binding protein EngA  36.57 
 
 
436 aa  301  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0922672  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1598  GTP-binding protein EngA  36.57 
 
 
436 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000589883 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  39.51 
 
 
439 aa  301  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1159  GTP-binding protein EngA  41.07 
 
 
436 aa  300  3e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427593  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1631  GTP-binding protein EngA  36.57 
 
 
436 aa  300  4e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1024  GTP-binding protein EngA  38.58 
 
 
440 aa  300  4e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127427  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1395  GTP-binding protein EngA  38.62 
 
 
441 aa  298  9e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2204  GTP-binding protein EngA  39.44 
 
 
465 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199328  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2126  GTP-binding protein EngA  38.58 
 
 
449 aa  298  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.127058  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  39.69 
 
 
441 aa  298  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2292  GTP-binding protein EngA  39.44 
 
 
465 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0406895  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  39.24 
 
 
444 aa  298  2e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3526  GTP-binding protein EngA  40.34 
 
 
494 aa  296  4e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.928011 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0359  GTP-binding protein EngA  38.65 
 
 
436 aa  296  4e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1428  GTP-binding protein EngA  36.57 
 
 
436 aa  296  6e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0752  GTP-binding protein EngA  37.98 
 
 
440 aa  296  7e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00177757 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  37.61 
 
 
439 aa  295  8e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1620  GTP-binding protein EngA  37.98 
 
 
436 aa  295  1e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3751  GTP-binding protein EngA  39.56 
 
 
449 aa  295  1e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0751  GTP-binding protein EngA  37.14 
 
 
440 aa  295  1e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1654  GTP-binding protein EngA  39.01 
 
 
465 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3785  GTP-binding protein EngA  36.34 
 
 
436 aa  295  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0456792  normal  0.0699486 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  38.29 
 
 
438 aa  294  3e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0737  GTP-binding protein EngA  37.75 
 
 
440 aa  293  5e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0799  GTP-binding protein EngA  37.3 
 
 
436 aa  292  8e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.940642  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2146  GTP-binding protein EngA  40.39 
 
 
493 aa  291  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  37.03 
 
 
438 aa  290  3e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  37.03 
 
 
438 aa  290  3e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2155  GTP-binding protein EngA  39.65 
 
 
471 aa  289  8e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.616734  normal  0.133544 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3587  small GTP-binding protein  36.27 
 
 
495 aa  289  8e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.748458  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1291  GTP-binding protein EngA  37.81 
 
 
436 aa  289  9e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0244351  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3568  GTP-binding protein EngA  39.61 
 
 
455 aa  287  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10530  small GTP-binding protein  38.43 
 
 
438 aa  287  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6542  small GTP-binding protein  37.47 
 
 
441 aa  286  5.999999999999999e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2143  GTP-binding protein EngA  37.84 
 
 
437 aa  286  7e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0764  GTP-binding protein EngA  37.19 
 
 
437 aa  285  1.0000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000517804  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5226  ribosome-associated GTPase EngA  35.36 
 
 
435 aa  284  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.814163 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1406  GTP-binding protein EngA  38.36 
 
 
439 aa  283  5.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0340673  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0223  small GTP-binding protein  38.62 
 
 
440 aa  282  9e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294804  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3776  GTP-binding protein EngA  36.73 
 
 
456 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350234  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2013  GTP-binding protein EngA  36.88 
 
 
437 aa  280  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00580637  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1009  GTPase  35.4 
 
 
442 aa  280  4e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.369054  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1169  GTP-binding protein EngA  37.16 
 
 
433 aa  280  5e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.306254 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1075  small GTP-binding protein  37.14 
 
 
438 aa  280  6e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0789  small GTP-binding protein  37.25 
 
 
443 aa  279  8e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000826073  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1043  GTP-binding protein EngA  35.14 
 
 
436 aa  277  3e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.617691  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1562  GTP-binding protein EngA  35.44 
 
 
436 aa  277  3e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.496113  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1532  GTP-binding protein EngA  35.44 
 
 
436 aa  277  3e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2390  GTP-binding protein EngA  38.05 
 
 
441 aa  276  4e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000149599  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0750  GTP-binding protein EngA  38.57 
 
 
451 aa  276  8e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524371  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2134  GTP-binding protein EngA  36.87 
 
 
458 aa  275  9e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0583205  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1630  small GTP-binding protein  36.43 
 
 
440 aa  275  2.0000000000000002e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.52918  hitchhiker  0.00197431 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1224  ribosome-associated GTPase EngA  39.16 
 
 
447 aa  274  3e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1727  GTP-binding protein EngA  37.05 
 
 
448 aa  274  3e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1809  small GTP-binding protein  35.31 
 
 
446 aa  273  4.0000000000000004e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000018958  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04795  GTP-binding protein EngA  35.59 
 
 
434 aa  272  8.000000000000001e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1651  GTP-binding protein EngA  37.25 
 
 
443 aa  271  1e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2045  GTP-binding protein EngA  37.1 
 
 
464 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09700  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  35.36 
 
 
438 aa  271  2e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.253075  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3778  small GTP-binding protein  34.9 
 
 
433 aa  271  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2279  GTP-binding protein EngA  35.5 
 
 
460 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0830899  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2356  GTP-binding protein EngA  36.2 
 
 
437 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0728  small GTP-binding protein  38.31 
 
 
441 aa  270  2.9999999999999997e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.390352 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0400  GTP-binding protein EngA  37.08 
 
 
436 aa  270  5e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.758155  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3106  GTP-binding protein EngA  37.32 
 
 
479 aa  269  7e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.564911 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0121  GTP-binding protein EngA  37.81 
 
 
452 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0893  GTP-binding protein EngA  36.05 
 
 
427 aa  268  1e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177025  hitchhiker  0.0000000000000146029 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0118  GTP-binding protein EngA  37.81 
 
 
452 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.132129 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0421  GTP-binding protein EngA  35.97 
 
 
437 aa  268  2e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0613118  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3505  GTP-binding protein EngA  36.26 
 
 
459 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0442058  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3005  GTP-binding protein EngA  35.06 
 
 
460 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.325  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44322  predicted protein  35.64 
 
 
555 aa  264  2e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00480829  normal  0.0297324 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1759  GTP-binding protein EngA  35.14 
 
 
473 aa  264  3e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739039 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2169  GTP-binding protein EngA  33.7 
 
 
479 aa  263  4e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414386  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0916  small GTP-binding protein  34.15 
 
 
439 aa  263  6e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.704291  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1337  small GTP-binding protein  36.69 
 
 
438 aa  263  6e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0503171  normal  0.51028 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0192  GTP-binding protein EngA  36.53 
 
 
445 aa  263  6e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>