More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0947 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0947  small GTP-binding protein  100 
 
 		 184 aa  367  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.445595  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1766  small GTP-binding protein  84.78 
 
 		 184 aa  317  7e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0915  small GTP-binding protein  84.24 
 
 		 184 aa  315  2e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.793666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1029  small GTP-binding protein  84.24 
 
 		 184 aa  315  3e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0351  small GTP-binding protein  66.67 
 
 		 189 aa  251  6e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0271058  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1458  GTP-binding protein EngA  33.7 
 
 		 445 aa  79  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548717  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3103  small GTP-binding protein  35.67 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1243  small GTP-binding protein  33.33 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  31.79 
 
 		 459 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1277  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.11 
 
 		 405 aa  65.1  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.038791  hitchhiker  0.00000385407 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0137  tRNA modification GTPase TrmE  28.73 
 
 		 457 aa  65.1  0.0000000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1758  small GTP-binding protein  31.52 
 
 		 448 aa  62.8  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16490  iron-only hydrogenase maturation protein HydF  33.83 
 
 		 416 aa  62.4  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.520712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  29.05 
 
 		 458 aa  62  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0743  GTP-binding protein Era  29.41 
 
 		 294 aa  62  0.000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1159  GTP-binding protein EngA  30.91 
 
 		 436 aa  62  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427593  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0208  GTP-binding protein Era  27.07 
 
 		 297 aa  62  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3096  tRNA modification GTPase TrmE  28.81 
 
 		 466 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000134747 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0392  GTP-binding protein EngA  30.69 
 
 		 494 aa  61.2  0.000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0475  small GTP-binding protein  31.82 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3233  tRNA modification GTPase TrmE  27.68 
 
 		 467 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0490  small GTP-binding protein  31.82 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3610  tRNA modification GTPase TrmE  28.37 
 
 		 475 aa  59.7  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56161  predicted protein  31.21 
 
 		 478 aa  59.7  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1617  GTP-binding protein EngA  31.55 
 
 		 460 aa  59.3  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0103  GTP-binding protein  32.09 
 
 		 440 aa  59.3  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000228129  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  28.49 
 
 		 458 aa  59.7  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0106  GTP-binding protein  32.28 
 
 		 440 aa  59.7  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0027  tRNA modification GTPase TrmE  27.46 
 
 		 454 aa  59.3  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0146  small GTP-binding protein  30.98 
 
 		 398 aa  59.3  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0325934  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11728  GTP-binding protein EngA  30.26 
 
 		 463 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000105319  normal  0.501933 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  26.52 
 
 		 464 aa  58.9  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1851  GTP-binding protein Era  26.86 
 
 		 309 aa  58.5  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3865  tRNA modification GTPase TrmE  29.44 
 
 		 453 aa  58.9  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000363316 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2942  GTP-binding protein EngA  26.78 
 
 		 471 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2927  GTP-binding protein EngA  26.78 
 
 		 471 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2971  GTP-binding protein EngA  26.78 
 
 		 471 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3179  tRNA modification GTPase TrmE  28.26 
 
 		 464 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0373252  hitchhiker  0.000409063 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2547  tRNA modification GTPase TrmE  28.26 
 
 		 464 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0461446  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3778  small GTP-binding protein  29.38 
 
 		 433 aa  58.2  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3161  tRNA modification GTPase TrmE  28.26 
 
 		 464 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.399046  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  29.24 
 
 		 294 aa  58.2  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  26.78 
 
 		 436 aa  58.2  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4051  small GTP-binding protein  25.41 
 
 		 483 aa  58.2  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0567196  normal  0.594075 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3568  GTP-binding protein EngA  27.97 
 
 		 455 aa  58.2  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1075  small GTP-binding protein  33.33 
 
 		 438 aa  57.8  0.00000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4469  tRNA modification GTPase TrmE  29.63 
 
 		 464 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0533201 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4292  tRNA modification GTPase TrmE  28.68 
 
 		 454 aa  57.8  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0104  tRNA modification GTPase TrmE  31.82 
 
 		 462 aa  57.4  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0111  tRNA modification GTPase TrmE  29.63 
 
 		 467 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3395  tRNA modification GTPase TrmE  29.63 
 
 		 467 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.408647  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0645  tRNA modification GTPase TrmE  27.41 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2929  tRNA modification GTPase TrmE  25.14 
 
 		 446 aa  57  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3097  tRNA modification GTPase TrmE  27.33 
 
 		 464 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151562  normal  0.0117151 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0548  tRNA modification GTPase TrmE  33.58 
 
 		 442 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3456  tRNA modification GTPase TrmE  27.66 
 
 		 475 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0307  tRNA modification GTPase TrmE  29.63 
 
 		 467 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1806  GTP-binding protein Era  26.34 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0584484  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7362  GTP-binding protein Era  27.38 
 
 		 320 aa  57  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448501  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0096  tRNA modification GTPase TrmE  29.63 
 
 		 467 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0683  small GTP-binding protein  28.57 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00203334  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3984  tRNA modification GTPase TrmE  28.89 
 
 		 464 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3213  tRNA modification GTPase TrmE  27.33 
 
 		 489 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3152  tRNA modification GTPase TrmE  27.54 
 
 		 464 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000246642 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3274  GTP-binding protein EngA  28.42 
 
 		 470 aa  57  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333638  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03590  tRNA modification GTPase  26.76 
 
 		 454 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4260  tRNA modification GTPase TrmE  26.76 
 
 		 454 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4216  tRNA modification GTPase TrmE  26.76 
 
 		 454 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.021791  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0165  small GTP-binding protein  30.66 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0750  GTP-binding protein EngA  28.49 
 
 		 451 aa  56.6  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524371  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5136  tRNA modification GTPase TrmE  26.76 
 
 		 454 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.041745  normal  0.0619684 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03534  hypothetical protein  26.76 
 
 		 454 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1234  GTP-binding protein EngA  27.13 
 
 		 444 aa  56.6  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3920  tRNA modification GTPase TrmE  26.76 
 
 		 454 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189642  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1616  GTP-binding protein EngA  31.58 
 
 		 471 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207628  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3547  tRNA modification GTPase TrmE  29.63 
 
 		 488 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4219  tRNA modification GTPase TrmE  26.76 
 
 		 454 aa  56.6  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.99545  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0916  small GTP-binding protein  25.9 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.704291  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4615  tRNA modification GTPase TrmE  28.68 
 
 		 454 aa  57  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2842  tRNA modification GTPase TrmE  29.63 
 
 		 488 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00155334  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4288  tRNA modification GTPase TrmE  26.76 
 
 		 454 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2243  tRNA modification GTPase TrmE  29.63 
 
 		 488 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4073  tRNA modification GTPase TrmE  26.76 
 
 		 454 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.420944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4263  tRNA modification GTPase TrmE  26.76 
 
 		 454 aa  56.2  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226045  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6518  tRNA modification GTPase TrmE  27.14 
 
 		 464 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1458  GTP-binding protein EngA  30.53 
 
 		 487 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.961762  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2815  ribosome-associated GTPase EngA  27.57 
 
 		 478 aa  56.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.560303  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3493  GTP-binding protein EngA  29.73 
 
 		 479 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.948039  normal  0.275089 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4148  tRNA modification GTPase TrmE  26.24 
 
 		 454 aa  55.8  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.421634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2390  GTP-binding protein EngA  32.59 
 
 		 441 aa  55.8  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000149599  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  29.07 
 
 		 441 aa  55.5  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  33.59 
 
 		 439 aa  55.5  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0169  ferrous iron transport protein B  30 
 
 		 778 aa  55.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0577  GTP-binding protein EngA  28.12 
 
 		 435 aa  55.8  0.0000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.416412  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  29.21 
 
 		 301 aa  55.5  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  27.22 
 
 		 450 aa  55.5  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1395  GTP-binding protein EngA  28.33 
 
 		 441 aa  55.1  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0053  GTP-binding protein EngA  30.98 
 
 		 460 aa  55.5  0.0000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3591  GTP-binding protein Era  25.14 
 
 		 308 aa  55.1  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14421  GTP-binding protein Era  29.38 
 
 		 303 aa  55.5  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>