More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1234 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1234  GTP-binding protein EngA  100 
 
 
444 aa  895    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1624  GTP-binding protein EngA  60.64 
 
 
437 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.565401  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1338  GTP-binding protein EngA  56.65 
 
 
439 aa  491  1e-137  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.53279  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1348  GTP-binding protein EngA  55.73 
 
 
439 aa  486  1e-136  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.124719  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1617  GTP-binding protein EngA  50.11 
 
 
460 aa  439  9.999999999999999e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  43.25 
 
 
439 aa  350  4e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10530  small GTP-binding protein  43.05 
 
 
438 aa  341  1e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1172  small GTP-binding protein  39.01 
 
 
438 aa  332  6e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  41.36 
 
 
441 aa  332  7.000000000000001e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2108  GTP-binding protein EngA  39.37 
 
 
443 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000750275  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  38.9 
 
 
438 aa  325  8.000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1227  GTP-binding protein EngA  38.64 
 
 
436 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.718862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3785  GTP-binding protein EngA  38.41 
 
 
436 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0456792  normal  0.0699486 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1428  GTP-binding protein EngA  37.95 
 
 
436 aa  318  1e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1631  GTP-binding protein EngA  37.95 
 
 
436 aa  317  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  36.88 
 
 
444 aa  317  2e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1559  GTP-binding protein EngA  37.73 
 
 
436 aa  315  7e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0922672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1414  GTP-binding protein EngA  37.73 
 
 
436 aa  315  7e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1386  GTP-binding protein EngA  37.73 
 
 
436 aa  315  7e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.844345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1386  GTP-binding protein EngA  37.73 
 
 
436 aa  315  7e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0845142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1525  GTP-binding protein EngA  37.73 
 
 
436 aa  315  7e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1598  GTP-binding protein EngA  37.73 
 
 
436 aa  315  7e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000589883 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1667  GTP-binding protein EngA  37.73 
 
 
436 aa  315  7e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3751  GTP-binding protein EngA  37.36 
 
 
449 aa  315  9e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1043  GTP-binding protein EngA  39.19 
 
 
436 aa  315  9.999999999999999e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.617691  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0460  GTP-binding protein EngA  38.19 
 
 
436 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0359  GTP-binding protein EngA  38.69 
 
 
436 aa  315  9.999999999999999e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2159  GTP-binding protein EngA  38.19 
 
 
436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000018961  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1160  GTP-binding protein EngA  39.23 
 
 
439 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0769833  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  37.87 
 
 
441 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  37.73 
 
 
438 aa  313  5.999999999999999e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  37.73 
 
 
438 aa  313  5.999999999999999e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0751  GTP-binding protein EngA  37.59 
 
 
440 aa  312  5.999999999999999e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0916  small GTP-binding protein  39.23 
 
 
439 aa  311  1e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.704291  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1758  small GTP-binding protein  38.17 
 
 
448 aa  311  1e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  36.96 
 
 
439 aa  309  5e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1224  ribosome-associated GTPase EngA  39.26 
 
 
447 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3526  GTP-binding protein EngA  37.05 
 
 
494 aa  309  5.9999999999999995e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.928011 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1159  GTP-binding protein EngA  40.27 
 
 
436 aa  309  5.9999999999999995e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427593  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1395  GTP-binding protein EngA  38.37 
 
 
441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2390  GTP-binding protein EngA  40.18 
 
 
441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000149599  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1620  GTP-binding protein EngA  38.29 
 
 
436 aa  308  2.0000000000000002e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1075  small GTP-binding protein  39.77 
 
 
438 aa  306  3e-82  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0333  GTP-binding protein EngA  38.32 
 
 
453 aa  306  4.0000000000000004e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0223  small GTP-binding protein  39.18 
 
 
440 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294804  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2146  GTP-binding protein EngA  37.05 
 
 
493 aa  306  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0885  GTP-binding protein EngA  38.69 
 
 
452 aa  306  6e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1532  GTP-binding protein EngA  37.84 
 
 
436 aa  306  7e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1562  GTP-binding protein EngA  37.84 
 
 
436 aa  306  7e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.496113  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1458  GTP-binding protein EngA  41.67 
 
 
445 aa  305  8.000000000000001e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548717  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  37.95 
 
 
441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2028  GTP-binding protein EngA  37.41 
 
 
455 aa  305  1.0000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.89204  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0644  GTP-binding protein EngA  37.19 
 
 
455 aa  303  3.0000000000000004e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0121  GTP-binding protein EngA  38.46 
 
 
452 aa  302  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0118  GTP-binding protein EngA  38.46 
 
 
452 aa  302  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.132129 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1177  GTP-binding protein  37.92 
 
 
441 aa  301  1e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1024  GTP-binding protein EngA  38.64 
 
 
440 aa  301  1e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127427  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2896  GTP-binding protein EngA  37.33 
 
 
453 aa  300  3e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0739755  hitchhiker  0.000158888 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1630  small GTP-binding protein  38.07 
 
 
440 aa  300  3e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.52918  hitchhiker  0.00197431 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1291  GTP-binding protein EngA  36.51 
 
 
436 aa  298  1e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0244351  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3568  GTP-binding protein EngA  37.36 
 
 
455 aa  298  1e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1337  small GTP-binding protein  35.83 
 
 
438 aa  298  2e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0503171  normal  0.51028 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06890  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  36.05 
 
 
444 aa  297  2e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.632761 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3566  ribosome-associated GTPase EngA  36.65 
 
 
454 aa  298  2e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.173152  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1406  GTP-binding protein EngA  36.36 
 
 
439 aa  297  3e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0340673  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2340  GTP-binding protein EngA  38.27 
 
 
453 aa  296  3e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.160254  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2103  GTP-binding protein EngA  38.48 
 
 
441 aa  297  3e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1561  GTP-binding protein EngA  37.87 
 
 
453 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.53751  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1204  GTP-binding protein EngA  37.5 
 
 
442 aa  295  1e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.109244  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1009  GTPase  36.73 
 
 
442 aa  295  1e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.369054  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04431  GTP-binding protein EngA  36.88 
 
 
456 aa  295  2e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0422674  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0789  small GTP-binding protein  36.65 
 
 
443 aa  294  2e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000826073  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1726  GTP-binding protein EngA  36.88 
 
 
456 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  35.83 
 
 
438 aa  293  4e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03881  GTP-binding protein EngA  37.19 
 
 
456 aa  293  4e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0799  GTP-binding protein EngA  37.1 
 
 
436 aa  293  4e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.940642  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1809  small GTP-binding protein  34.16 
 
 
446 aa  289  6e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000018958  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21511  GTP-binding protein EngA  36.05 
 
 
461 aa  288  9e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04421  GTP-binding protein EngA  36.75 
 
 
457 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0387  GTP-binding protein EngA  36.85 
 
 
457 aa  288  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1727  GTP-binding protein EngA  35.91 
 
 
448 aa  288  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04111  GTP-binding protein EngA  36.75 
 
 
457 aa  287  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3149  GTP-binding protein EngA  34.55 
 
 
441 aa  286  5e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.421281  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04531  GTP-binding protein EngA  36.85 
 
 
458 aa  286  5.999999999999999e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.491515  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0893  GTP-binding protein EngA  35.21 
 
 
427 aa  284  2.0000000000000002e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177025  hitchhiker  0.0000000000000146029 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0764  GTP-binding protein EngA  35.52 
 
 
437 aa  283  3.0000000000000004e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000517804  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1497  small GTP-binding protein  37.02 
 
 
476 aa  283  6.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.642777  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0752  GTP-binding protein EngA  34.77 
 
 
440 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00177757 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0737  GTP-binding protein EngA  34.55 
 
 
440 aa  282  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5226  ribosome-associated GTPase EngA  35.47 
 
 
435 aa  280  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.814163 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3073  GTP-binding protein EngA  37.53 
 
 
435 aa  280  3e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.348074  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3106  GTP-binding protein EngA  34.98 
 
 
479 aa  278  1e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.564911 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09700  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  35.6 
 
 
438 aa  278  2e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.253075  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2126  GTP-binding protein EngA  34.69 
 
 
449 aa  276  7e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.127058  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0750  GTP-binding protein EngA  38.2 
 
 
451 aa  275  9e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524371  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3778  small GTP-binding protein  37.3 
 
 
433 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15330  cytidylate kinase  33.86 
 
 
755 aa  273  3e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.201651  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2292  GTP-binding protein EngA  34.88 
 
 
465 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0406895  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2503  GTP-binding protein EngA  35.6 
 
 
461 aa  273  5.000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.512604  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2204  GTP-binding protein EngA  34.66 
 
 
465 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>