More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0820 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0684  GTP-binding proten HflX  78.71 
 
 		 512 aa  679    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  100 
 
 		 493 aa  983    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  75.94 
 
 		 501 aa  643    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  72.13 
 
 		 485 aa  620  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  68.79 
 
 		 494 aa  615  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  69.51 
 
 		 503 aa  597  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  65.31 
 
 		 502 aa  593  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  66.88 
 
 		 482 aa  587  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  67.83 
 
 		 512 aa  579  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  69.51 
 
 		 486 aa  576  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  66.16 
 
 		 487 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  63.66 
 
 		 509 aa  574  1.0000000000000001e-162  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3837  GTP-binding protein, HSR1-related  63.99 
 
 		 493 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  67.03 
 
 		 479 aa  563  1.0000000000000001e-159  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  63.03 
 
 		 522 aa  562  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  63.38 
 
 		 553 aa  560  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  64.9 
 
 		 484 aa  555  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  66 
 
 		 521 aa  556  1e-157  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  65.23 
 
 		 493 aa  555  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  64.43 
 
 		 517 aa  553  1e-156  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1482  small GTP-binding protein  67.03 
 
 		 524 aa  545  1e-154  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.578947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1436  GTP-binding proten HflX  68.79 
 
 		 480 aa  542  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1407  small GTP-binding protein  65.52 
 
 		 515 aa  542  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155427 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1503  small GTP-binding protein  66.59 
 
 		 530 aa  541  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0726763  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07300  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein TIGR00650  65.85 
 
 		 546 aa  538  9.999999999999999e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1562  GTP-binding proten HflX  64.84 
 
 		 505 aa  540  9.999999999999999e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410019  hitchhiker  0.00407104 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1449  GTP-binding protein, HSR1-related  64.06 
 
 		 494 aa  540  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.062201  normal  0.276789 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  65.68 
 
 		 515 aa  534  1e-150  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  64.52 
 
 		 515 aa  526  1e-148  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3960  GTP-binding protein, HSR1-related  65.73 
 
 		 482 aa  518  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.342247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12738  GTP-binding protein hflX  64.22 
 
 		 495 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.324868 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2151  GTP-binding protein, HSR1-related  63.45 
 
 		 483 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.0136453 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2164  GTP-binding protein, HSR1-related  63.24 
 
 		 483 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.951338  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2210  GTP-binding protein, HSR1-related  63.24 
 
 		 483 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60775  normal  0.0439435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2436  GTP-binding protein, HSR1-related  64.86 
 
 		 482 aa  504  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445847  normal  0.220236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4564  GTP-binding proten HflX  64.11 
 
 		 466 aa  497  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.631716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0583  GTP-binding protein HflX  55.78 
 
 		 512 aa  489  1e-137  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.622699 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  59.06 
 
 		 501 aa  473  1e-132  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  49.17 
 
 		 436 aa  372  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0528  GTP-binding proten HflX  61.28 
 
 		 384 aa  362  1e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270654  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  46.57 
 
 		 441 aa  358  9e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  48.74 
 
 		 395 aa  355  7.999999999999999e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  47.63 
 
 		 433 aa  352  1e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  48.22 
 
 		 421 aa  349  8e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  47.8 
 
 		 582 aa  340  4e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  50.63 
 
 		 422 aa  336  7e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  46.59 
 
 		 444 aa  336  7e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  43.13 
 
 		 437 aa  334  2e-90  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  44.21 
 
 		 413 aa  333  4e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  45.45 
 
 		 420 aa  332  8e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  46.77 
 
 		 414 aa  332  8e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  46.31 
 
 		 461 aa  329  6e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0658  GTP-binding proten HflX  50.12 
 
 		 425 aa  324  2e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  47.29 
 
 		 596 aa  324  2e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  47.32 
 
 		 454 aa  323  5e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  48.3 
 
 		 417 aa  322  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  45.77 
 
 		 454 aa  321  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  46.02 
 
 		 440 aa  315  1.9999999999999998e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2776  putative GTPase HflX  46.78 
 
 		 439 aa  313  3.9999999999999997e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  47.77 
 
 		 428 aa  313  6.999999999999999e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  47.29 
 
 		 426 aa  310  5e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  46.02 
 
 		 426 aa  309  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  46.48 
 
 		 442 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  47.29 
 
 		 426 aa  309  8e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  46.42 
 
 		 429 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  46.02 
 
 		 426 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  46.17 
 
 		 429 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  46.02 
 
 		 426 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  46.02 
 
 		 426 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  46.02 
 
 		 426 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  46.02 
 
 		 426 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  46.02 
 
 		 426 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  46.02 
 
 		 426 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  46.02 
 
 		 426 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  46.27 
 
 		 426 aa  307  3e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  47.55 
 
 		 421 aa  307  3e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  45.64 
 
 		 432 aa  307  3e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  45.77 
 
 		 426 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  41.18 
 
 		 419 aa  306  7e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  45.77 
 
 		 426 aa  306  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  41.59 
 
 		 415 aa  306  7e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  45.77 
 
 		 426 aa  306  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  45.77 
 
 		 426 aa  306  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  45.77 
 
 		 426 aa  306  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0432  putative GTPase HflX  46.02 
 
 		 426 aa  305  9.000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000150209  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  40.09 
 
 		 419 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  44.31 
 
 		 433 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  44.55 
 
 		 433 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  41.59 
 
 		 435 aa  303  3.0000000000000004e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3797  putative GTPase HflX  45.52 
 
 		 428 aa  303  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0756965  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  45.36 
 
 		 489 aa  304  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  41.13 
 
 		 419 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0698  putative GTPase HflX  45.52 
 
 		 428 aa  303  3.0000000000000004e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  45.36 
 
 		 489 aa  304  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  41.18 
 
 		 419 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3259  GTP-binding proten HflX  45.28 
 
 		 450 aa  303  5.000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  43.94 
 
 		 430 aa  303  5.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  40.93 
 
 		 419 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  47.46 
 
 		 436 aa  303  6.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3652  putative GTPase HflX  45.52 
 
 		 428 aa  303  7.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>