More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3839 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3839  small GTP-binding protein  100 
 
 		 481 aa  978    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.674432 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1616  small GTP-binding protein  56.8 
 
 		 453 aa  522  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206677 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3709  small GTP-binding protein  55.8 
 
 		 462 aa  515  1.0000000000000001e-145  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4509  small GTP-binding protein domain-containing protein  58.67 
 
 		 457 aa  510  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2342  small GTP-binding protein  53.36 
 
 		 448 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2393  small GTP-binding protein  53.14 
 
 		 448 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0764  GTP-binding protein HSR1-related  42.01 
 
 		 469 aa  315  9e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  39.27 
 
 		 492 aa  315  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1080  small GTP-binding protein  39.05 
 
 		 484 aa  311  1e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  37.15 
 
 		 489 aa  306  7e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1407  small GTP-binding protein  38.88 
 
 		 479 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0499  small GTP-binding protein  38.53 
 
 		 475 aa  300  4e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362987  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1436  small GTP-binding protein  38.44 
 
 		 479 aa  299  7e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  37.58 
 
 		 566 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  36.44 
 
 		 472 aa  276  6e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0497  GTPase  35.38 
 
 		 420 aa  160  6e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2178  small GTP-binding protein domain-containing protein  33.44 
 
 		 431 aa  149  9e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.995116  normal  0.41065 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  30.43 
 
 		 440 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  30.69 
 
 		 440 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.12 
 
 		 440 aa  144  4e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  30.05 
 
 		 531 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  30.05 
 
 		 531 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04921  GTPase SAR1  31.76 
 
 		 441 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1537  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.94 
 
 		 413 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16461  GTPase SAR1  29.68 
 
 		 413 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1709  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.81 
 
 		 513 aa  127  5e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000711006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  26.33 
 
 		 529 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1544  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.88 
 
 		 517 aa  120  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1210  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.76 
 
 		 529 aa  119  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4459  small GTP-binding protein  28.19 
 
 		 520 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16341  GTPase SAR1 and related small G protein  26.77 
 
 		 413 aa  118  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16501  GTPase SAR1 and related small G proteins  25.47 
 
 		 532 aa  118  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.569133 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09991  GTPase SAR1 and related small G proteins  25.87 
 
 		 496 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1904  GTP-binding protein, HSR1-related  28.07 
 
 		 545 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1260  hypothetical protein  26.82 
 
 		 529 aa  111  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  24.94 
 
 		 506 aa  110  7.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16231  GTPase SAR1 and related small G proteins  28.77 
 
 		 413 aa  109  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.283634  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0145  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.14 
 
 		 517 aa  105  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0765  hypothetical protein  28.36 
 
 		 472 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07771  GTPase SAR1 and related small G proteins  26.14 
 
 		 517 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0362439 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10221  GTPase SAR1 and related small G protein  25.24 
 
 		 516 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.524471  normal  0.183753 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09451  GTPase SAR1  26.92 
 
 		 499 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09441  GTPase SAR1 and related small G protein  26.67 
 
 		 499 aa  94.4  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0884  small GTP-binding protein domain-containing protein  25.93 
 
 		 499 aa  92  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102699  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4193  hypothetical protein  24.31 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.296514 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0732  hypothetical protein  24.23 
 
 		 481 aa  84  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00108673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3840  hypothetical protein  26.77 
 
 		 492 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.693476 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2529  hypothetical protein  23.73 
 
 		 475 aa  76.3  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  29.41 
 
 		 548 aa  71.2  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3579  hypothetical protein  26.3 
 
 		 463 aa  70.1  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2527  hypothetical protein  26.64 
 
 		 463 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl014  tRNA modification GTPase TrmE  31.36 
 
 		 452 aa  62.8  0.00000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2152  small GTP-binding protein  29.63 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0165  small GTP-binding protein  32.33 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0475  small GTP-binding protein  28.32 
 
 		 404 aa  59.7  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1243  small GTP-binding protein  32.03 
 
 		 425 aa  59.7  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0490  small GTP-binding protein  28.32 
 
 		 404 aa  59.7  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  30.43 
 
 		 585 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0103  GTP-binding protein  29.57 
 
 		 440 aa  58.9  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000228129  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0409  GTP-binding protein EngA  30.29 
 
 		 460 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0435  GTP-binding protein EngA  29.22 
 
 		 460 aa  58.2  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0106  GTP-binding protein  30.11 
 
 		 440 aa  58.5  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  29.01 
 
 		 546 aa  57.4  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0819  tRNA modification GTPase TrmE  33.77 
 
 		 452 aa  56.6  0.000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1753  ribosome-associated GTPase EngA  32.35 
 
 		 477 aa  56.2  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  29.93 
 
 		 398 aa  55.5  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  29.59 
 
 		 464 aa  55.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  34.06 
 
 		 460 aa  55.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  28.92 
 
 		 632 aa  55.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  28.41 
 
 		 298 aa  55.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  28.57 
 
 		 664 aa  55.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  32.61 
 
 		 302 aa  54.7  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  29.58 
 
 		 583 aa  55.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1572  GTP-binding protein EngA  29.88 
 
 		 460 aa  54.7  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0371  GTP-binding protein Era  30.77 
 
 		 307 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1422  ribosome-associated GTPase EngA  27.44 
 
 		 484 aa  54.7  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16490  iron-only hydrogenase maturation protein HydF  27.82 
 
 		 416 aa  54.3  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.520712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  31.64 
 
 		 447 aa  54.3  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1387  GTP-binding protein Era  29.66 
 
 		 308 aa  54.3  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.263237  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3103  small GTP-binding protein  27.48 
 
 		 396 aa  54.3  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1291  GTP-binding protein EngA  34.4 
 
 		 436 aa  54.3  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0244351  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0053  GTP-binding protein EngA  28.27 
 
 		 460 aa  53.9  0.000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  31.58 
 
 		 303 aa  53.9  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1972  GTP-binding protein Era  30.14 
 
 		 289 aa  53.5  0.000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0536  GTP-binding protein EngA  32.03 
 
 		 461 aa  53.5  0.000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  25.4 
 
 		 589 aa  53.5  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4121  GTP-binding protein Era  30.13 
 
 		 305 aa  53.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.383616  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1620  GTP-binding protein EngA  33.12 
 
 		 436 aa  53.1  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4517  GTP-binding protein Era  33.59 
 
 		 337 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3235  GTP-binding protein Era  31.94 
 
 		 489 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00276402  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1239  GTP-binding protein Era  30.95 
 
 		 300 aa  52.8  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.680465  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1766  small GTP-binding protein  28.05 
 
 		 184 aa  53.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0359  GTP-binding protein EngA  31.55 
 
 		 436 aa  52.8  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0374  GTP-binding protein EngA  34.65 
 
 		 473 aa  52.8  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2392  tRNA modification GTPase TrmE  30.07 
 
 		 468 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0118764  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2081  small GTP-binding protein  29.41 
 
 		 416 aa  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000627073  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  28.57 
 
 		 324 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1825  GTP-binding protein Era  34.92 
 
 		 309 aa  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1029  small GTP-binding protein  28.05 
 
 		 184 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  30.95 
 
 		 303 aa  52  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>