107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0145 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0145  small GTP-binding protein domain-containing protein  100 
 
 		 517 aa  1022    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07771  GTPase SAR1 and related small G proteins  98.84 
 
 		 517 aa  1010    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0362439 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10221  GTPase SAR1 and related small G protein  56.04 
 
 		 516 aa  554  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.524471  normal  0.183753 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16501  GTPase SAR1 and related small G proteins  47.22 
 
 		 532 aa  515  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.569133 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1260  hypothetical protein  51.38 
 
 		 529 aa  490  1e-137  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1210  small GTP-binding protein domain-containing protein  53.21 
 
 		 529 aa  479  1e-134  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  47.21 
 
 		 531 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1544  small GTP-binding protein domain-containing protein  45.58 
 
 		 517 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  46.98 
 
 		 531 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  46.99 
 
 		 529 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  44.36 
 
 		 506 aa  387  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1709  small GTP-binding protein domain-containing protein  44.63 
 
 		 513 aa  379  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000711006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4459  small GTP-binding protein  43.22 
 
 		 520 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1904  GTP-binding protein, HSR1-related  43.32 
 
 		 545 aa  367  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09441  GTPase SAR1 and related small G protein  37.45 
 
 		 499 aa  334  3e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09451  GTPase SAR1  39.53 
 
 		 499 aa  325  1e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09991  GTPase SAR1 and related small G proteins  37.35 
 
 		 496 aa  325  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0884  small GTP-binding protein domain-containing protein  36.49 
 
 		 499 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102699  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0732  hypothetical protein  26.93 
 
 		 481 aa  160  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00108673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4193  hypothetical protein  24.49 
 
 		 471 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.296514 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0765  hypothetical protein  25.44 
 
 		 472 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3840  hypothetical protein  24.23 
 
 		 492 aa  138  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.693476 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0764  GTP-binding protein HSR1-related  27.64 
 
 		 469 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2529  hypothetical protein  25.36 
 
 		 475 aa  134  5e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  28.97 
 
 		 566 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1407  small GTP-binding protein  28.02 
 
 		 479 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1436  small GTP-binding protein  28.83 
 
 		 479 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741449  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3709  small GTP-binding protein  28.16 
 
 		 462 aa  130  7.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  26.27 
 
 		 489 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1080  small GTP-binding protein  25.94 
 
 		 484 aa  125  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1616  small GTP-binding protein  27.23 
 
 		 453 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206677 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0499  small GTP-binding protein  27.62 
 
 		 475 aa  122  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362987  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2342  small GTP-binding protein  27.3 
 
 		 448 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2393  small GTP-binding protein  27.55 
 
 		 448 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4509  small GTP-binding protein domain-containing protein  25.46 
 
 		 457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  25.26 
 
 		 472 aa  108  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2178  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.55 
 
 		 431 aa  108  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.995116  normal  0.41065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  25.05 
 
 		 492 aa  107  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2527  hypothetical protein  24.93 
 
 		 463 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0993  hypothetical protein  28.11 
 
 		 459 aa  99  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.455493 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3579  hypothetical protein  24.09 
 
 		 463 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  29.3 
 
 		 440 aa  97.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0497  GTPase  28.21 
 
 		 420 aa  96.3  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16461  GTPase SAR1  26.13 
 
 		 413 aa  95.1  3e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3839  small GTP-binding protein  25.81 
 
 		 481 aa  90.5  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.674432 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16341  GTPase SAR1 and related small G protein  26.92 
 
 		 413 aa  89  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  24.91 
 
 		 440 aa  82.8  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  24.91 
 
 		 440 aa  81.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1537  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.33 
 
 		 413 aa  71.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16231  GTPase SAR1 and related small G proteins  27.65 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.283634  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04921  GTPase SAR1  25.16 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0942  hypothetical protein  23.97 
 
 		 409 aa  53.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2081  small GTP-binding protein  34.31 
 
 		 416 aa  52.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000627073  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0435  GTP-binding protein EngA  28.57 
 
 		 460 aa  52.4  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0409  GTP-binding protein EngA  28.57 
 
 		 460 aa  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  29.65 
 
 		 296 aa  52.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1041  hypothetical protein  24.8 
 
 		 427 aa  51.6  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4059  GTP-binding protein HSR1-related  31.29 
 
 		 454 aa  51.6  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  28.17 
 
 		 548 aa  51.2  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1572  GTP-binding protein EngA  27.82 
 
 		 460 aa  50.4  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0036  hypothetical protein  32.73 
 
 		 451 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06561  hypothetical protein  32.73 
 
 		 451 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0586116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06261  hypothetical protein  26.92 
 
 		 444 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.307417  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0600  hypothetical protein  27.88 
 
 		 444 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06561  hypothetical protein  27 
 
 		 444 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  28.22 
 
 		 291 aa  48.9  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1186  GTP-binding protein EngA  27.92 
 
 		 461 aa  48.9  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2889  tRNA modification GTPase TrmE  36.44 
 
 		 464 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6543  GTP-binding protein Era  27.52 
 
 		 289 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18671  hypothetical protein  25.62 
 
 		 454 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1851  GTP-binding protein Era  29.93 
 
 		 309 aa  48.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3776  GTP-binding protein EngA  29.5 
 
 		 456 aa  48.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350234  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0777  GTP-binding protein EngA  28.57 
 
 		 462 aa  47.8  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10501  hypothetical protein  24.77 
 
 		 452 aa  47.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.546761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16490  iron-only hydrogenase maturation protein HydF  31.67 
 
 		 416 aa  47.4  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.520712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1715  hypothetical protein  33.01 
 
 		 192 aa  46.6  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691695  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0053  GTP-binding protein EngA  26.09 
 
 		 460 aa  46.2  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1409  tRNA modification GTPase TrmE  32.88 
 
 		 452 aa  46.6  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  30.93 
 
 		 460 aa  46.2  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0536  GTP-binding protein EngA  26.32 
 
 		 461 aa  46.6  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0555  tRNA modification GTPase TrmE  29.14 
 
 		 438 aa  45.8  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06651  hypothetical protein  20.79 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.19344  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  29.91 
 
 		 398 aa  45.8  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0179  tRNA modification GTPase TrmE  32.89 
 
 		 464 aa  46.2  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0548  tRNA modification GTPase TrmE  30.77 
 
 		 442 aa  45.4  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  28.05 
 
 		 546 aa  45.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0474  GTP-binding protein Era  29.45 
 
 		 301 aa  45.1  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1833  tRNA modification GTPase TrmE  30.33 
 
 		 444 aa  45.1  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0526  tRNA modification GTPase TrmE  38.1 
 
 		 446 aa  44.7  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1686  GTP-binding protein EngA  30.71 
 
 		 460 aa  44.7  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0325003  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0042  small GTP-binding protein  29.75 
 
 		 400 aa  44.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2152  small GTP-binding protein  29.92 
 
 		 409 aa  44.7  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2472  tRNA modification GTPase TrmE  28.44 
 
 		 487 aa  44.3  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000689916 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2148  small GTP-binding protein  30.53 
 
 		 495 aa  44.7  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0089  tRNA modification GTPase TrmE  31.4 
 
 		 455 aa  44.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0475  small GTP-binding protein  27.42 
 
 		 404 aa  44.3  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0490  small GTP-binding protein  27.42 
 
 		 404 aa  44.3  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1159  GTP-binding protein EngA  30.15 
 
 		 436 aa  44.3  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427593  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1753  ribosome-associated GTPase EngA  26.61 
 
 		 477 aa  44.3  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1569  small GTP-binding protein  32.8 
 
 		 407 aa  44.3  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.627873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>