29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_06561 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0600  hypothetical protein  75.68 
 
 
444 aa  708    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06261  hypothetical protein  96.85 
 
 
444 aa  849    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.307417  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06561  hypothetical protein  100 
 
 
444 aa  890    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06651  hypothetical protein  74.15 
 
 
441 aa  679    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.19344  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18671  hypothetical protein  35.55 
 
 
454 aa  300  5e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10501  hypothetical protein  35 
 
 
452 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.546761  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06561  hypothetical protein  34.49 
 
 
451 aa  290  4e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0586116  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0036  hypothetical protein  34.72 
 
 
451 aa  289  9e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0942  hypothetical protein  32.13 
 
 
409 aa  267  4e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1041  hypothetical protein  33.25 
 
 
427 aa  254  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0993  hypothetical protein  26.17 
 
 
459 aa  88.2  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.455493 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4193  hypothetical protein  28.38 
 
 
471 aa  66.6  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.296514 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0732  hypothetical protein  22.2 
 
 
481 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00108673  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  26.57 
 
 
531 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  24.53 
 
 
529 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  26.57 
 
 
531 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1544  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.1 
 
 
517 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  27.27 
 
 
506 aa  65.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2527  hypothetical protein  26.12 
 
 
463 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3579  hypothetical protein  26.12 
 
 
463 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3840  hypothetical protein  27.33 
 
 
492 aa  63.2  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.693476 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1260  hypothetical protein  29.46 
 
 
529 aa  62  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4459  small GTP-binding protein  25.81 
 
 
520 aa  60.1  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859915  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1904  GTP-binding protein, HSR1-related  26.61 
 
 
545 aa  60.1  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30473  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0765  hypothetical protein  28.21 
 
 
472 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1709  small GTP-binding protein domain-containing protein  22.77 
 
 
513 aa  52.8  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000711006  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16501  GTPase SAR1 and related small G proteins  21.09 
 
 
532 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.569133 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1210  small GTP-binding protein domain-containing protein  19.22 
 
 
529 aa  49.7  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2529  hypothetical protein  27.78 
 
 
475 aa  48.9  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>