30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0600 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_06261  hypothetical protein  75.68 
 
 
444 aa  692    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.307417  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06651  hypothetical protein  76.59 
 
 
441 aa  696    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.19344  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06561  hypothetical protein  75.68 
 
 
444 aa  694    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0600  hypothetical protein  100 
 
 
444 aa  892    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06561  hypothetical protein  36.34 
 
 
451 aa  299  5e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0586116  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18671  hypothetical protein  35.61 
 
 
454 aa  299  6e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0036  hypothetical protein  36.95 
 
 
451 aa  298  9e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10501  hypothetical protein  34.21 
 
 
452 aa  282  7.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.546761  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0942  hypothetical protein  32.75 
 
 
409 aa  273  4.0000000000000004e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1041  hypothetical protein  33.98 
 
 
427 aa  262  1e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0993  hypothetical protein  25.86 
 
 
459 aa  87.8  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.455493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1544  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.1 
 
 
517 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  27.27 
 
 
506 aa  64.7  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2527  hypothetical protein  28.57 
 
 
463 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  29.7 
 
 
531 aa  63.9  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  29.7 
 
 
531 aa  63.9  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3579  hypothetical protein  27.89 
 
 
463 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4193  hypothetical protein  27.7 
 
 
471 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.296514 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  24.79 
 
 
529 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3840  hypothetical protein  30.83 
 
 
492 aa  60.8  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.693476 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1260  hypothetical protein  29.46 
 
 
529 aa  60.5  0.00000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4459  small GTP-binding protein  25.95 
 
 
520 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859915  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1904  GTP-binding protein, HSR1-related  26.36 
 
 
545 aa  60.1  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30473  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0765  hypothetical protein  26.19 
 
 
472 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1709  small GTP-binding protein domain-containing protein  24.75 
 
 
513 aa  55.1  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000711006  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0732  hypothetical protein  29.79 
 
 
481 aa  54.3  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00108673  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16501  GTPase SAR1 and related small G proteins  26 
 
 
532 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.569133 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1210  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.36 
 
 
529 aa  50.1  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2529  hypothetical protein  26.67 
 
 
475 aa  47.8  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10221  GTPase SAR1 and related small G protein  23.23 
 
 
516 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.524471  normal  0.183753 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>