95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1904 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1544  small GTP-binding protein domain-containing protein  65.13 
 
 		 517 aa  662    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1904  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 		 545 aa  1092    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30473  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  63.04 
 
 		 506 aa  615  1e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  61.33 
 
 		 529 aa  612  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  60.26 
 
 		 531 aa  594  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  60.45 
 
 		 531 aa  594  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4459  small GTP-binding protein  57.98 
 
 		 520 aa  549  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1709  small GTP-binding protein domain-containing protein  58.92 
 
 		 513 aa  541  1e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000711006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16501  GTPase SAR1 and related small G proteins  40.7 
 
 		 532 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.569133 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1260  hypothetical protein  45.43 
 
 		 529 aa  394  1e-108  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1210  small GTP-binding protein domain-containing protein  44.84 
 
 		 529 aa  369  1e-101  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10221  GTPase SAR1 and related small G protein  42.19 
 
 		 516 aa  362  8e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.524471  normal  0.183753 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0145  small GTP-binding protein domain-containing protein  41.79 
 
 		 517 aa  353  4e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07771  GTPase SAR1 and related small G proteins  41.58 
 
 		 517 aa  352  1e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0362439 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09441  GTPase SAR1 and related small G protein  34.1 
 
 		 499 aa  274  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09451  GTPase SAR1  36.21 
 
 		 499 aa  273  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0884  small GTP-binding protein domain-containing protein  33.89 
 
 		 499 aa  259  7e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102699  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09991  GTPase SAR1 and related small G proteins  34.31 
 
 		 496 aa  258  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4193  hypothetical protein  27.66 
 
 		 471 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.296514 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3840  hypothetical protein  31.54 
 
 		 492 aa  179  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.693476 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0765  hypothetical protein  28.38 
 
 		 472 aa  174  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0732  hypothetical protein  31.09 
 
 		 481 aa  169  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00108673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2529  hypothetical protein  31.13 
 
 		 475 aa  150  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2527  hypothetical protein  27.32 
 
 		 463 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3579  hypothetical protein  27.44 
 
 		 463 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.53 
 
 		 472 aa  127  6e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1616  small GTP-binding protein  27.96 
 
 		 453 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206677 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0993  hypothetical protein  28.68 
 
 		 459 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.455493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0499  small GTP-binding protein  29.44 
 
 		 475 aa  117  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362987  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  31.38 
 
 		 566 aa  116  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1436  small GTP-binding protein  27.4 
 
 		 479 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1407  small GTP-binding protein  28.87 
 
 		 479 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0764  GTP-binding protein HSR1-related  26.34 
 
 		 469 aa  114  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3709  small GTP-binding protein  27.59 
 
 		 462 aa  112  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  26.44 
 
 		 489 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2342  small GTP-binding protein  25.2 
 
 		 448 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2393  small GTP-binding protein  25.2 
 
 		 448 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.32 
 
 		 492 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0497  GTPase  26.53 
 
 		 420 aa  105  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1080  small GTP-binding protein  26.25 
 
 		 484 aa  105  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  27.27 
 
 		 440 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3839  small GTP-binding protein  26.45 
 
 		 481 aa  101  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.674432 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2178  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.47 
 
 		 431 aa  98.6  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.995116  normal  0.41065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4509  small GTP-binding protein domain-containing protein  24.53 
 
 		 457 aa  97.8  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  24.74 
 
 		 440 aa  87.4  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  23.79 
 
 		 440 aa  86.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04921  GTPase SAR1  28.19 
 
 		 441 aa  85.5  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1041  hypothetical protein  29.93 
 
 		 427 aa  78.6  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0942  hypothetical protein  29.77 
 
 		 409 aa  77.8  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0036  hypothetical protein  23.32 
 
 		 451 aa  76.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10501  hypothetical protein  31.97 
 
 		 452 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.546761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06561  hypothetical protein  23.32 
 
 		 451 aa  76.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0586116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18671  hypothetical protein  31.2 
 
 		 454 aa  74.7  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16461  GTPase SAR1  23.42 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16341  GTPase SAR1 and related small G protein  21.84 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16231  GTPase SAR1 and related small G proteins  26.81 
 
 		 413 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.283634  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1537  small GTP-binding protein domain-containing protein  23.62 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0600  hypothetical protein  26.36 
 
 		 444 aa  60.1  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06561  hypothetical protein  26.61 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06261  hypothetical protein  26.61 
 
 		 444 aa  60.1  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.307417  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06651  hypothetical protein  26.28 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.19344  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0208  GTP-binding protein Era  35.42 
 
 		 297 aa  55.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  34.34 
 
 		 422 aa  56.2  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1915  tRNA modification GTPase TrmE  33.33 
 
 		 457 aa  55.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.410866  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  30.87 
 
 		 589 aa  54.3  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1715  hypothetical protein  34.69 
 
 		 192 aa  53.5  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691695  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1806  GTP-binding protein Era  35.88 
 
 		 297 aa  52.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0584484  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6543  GTP-binding protein Era  25.15 
 
 		 289 aa  50.4  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2392  tRNA modification GTPase TrmE  33.85 
 
 		 468 aa  50.4  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0118764  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2081  small GTP-binding protein  30.33 
 
 		 416 aa  48.5  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000627073  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0692  GTP-binding protein EngA  29.69 
 
 		 470 aa  48.5  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1260  tRNA modification GTPase TrmE  30.47 
 
 		 449 aa  48.1  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  32.89 
 
 		 585 aa  48.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1683  labile enterotoxin output A  26.6 
 
 		 568 aa  47.4  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1224  ribosome-associated GTPase EngA  33.07 
 
 		 447 aa  47.4  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  25.79 
 
 		 548 aa  47  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0227  GTP-binding proten HflX  32.9 
 
 		 607 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.160426  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1851  GTP-binding protein Era  30.66 
 
 		 309 aa  46.6  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0203  GTP-binding protein, HSR1-related  31.82 
 
 		 608 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0216  GTP-binding proten HflX  32.9 
 
 		 607 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0372  GTP-binding protein Era  28.11 
 
 		 297 aa  47  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0680727  normal  0.750756 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0042  small GTP-binding protein  31.45 
 
 		 400 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0165  small GTP-binding protein  30.08 
 
 		 427 aa  46.2  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0358  GTP-binding protein Era  31.47 
 
 		 300 aa  46.2  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.954921  normal  0.603117 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3074  GTP-binding protein Era  25.49 
 
 		 298 aa  45.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1159  GTP-binding protein EngA  29.37 
 
 		 436 aa  45.1  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427593  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1174  hypothetical protein  32.29 
 
 		 322 aa  44.7  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1541  small GTP-binding protein  22.22 
 
 		 363 aa  44.7  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  25.31 
 
 		 587 aa  44.3  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2276  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.2 
 
 		 400 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3777  GTP-binding protein Era  28.1 
 
 		 295 aa  44.3  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  32.03 
 
 		 458 aa  43.9  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2373  tRNA modification GTPase TrmE  26.5 
 
 		 473 aa  43.5  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0474  GTP-binding protein Era  30.56 
 
 		 301 aa  43.5  0.01  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01918  hypothetical protein  28.32 
 
 		 346 aa  43.5  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>