More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_04921 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_04921  GTPase SAR1  100 
 
 		 441 aa  860    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  60.69 
 
 		 440 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0497  GTPase  60.32 
 
 		 420 aa  409  1e-113  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2178  small GTP-binding protein domain-containing protein  60.54 
 
 		 431 aa  393  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.995116  normal  0.41065 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  43.16 
 
 		 440 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  42.33 
 
 		 440 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16231  GTPase SAR1 and related small G proteins  33.56 
 
 		 413 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.283634  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16461  GTPase SAR1  32.27 
 
 		 413 aa  273  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1537  small GTP-binding protein domain-containing protein  33.5 
 
 		 413 aa  273  6e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16341  GTPase SAR1 and related small G protein  32.28 
 
 		 413 aa  272  9e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  41.23 
 
 		 472 aa  240  2.9999999999999997e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1080  small GTP-binding protein  33.57 
 
 		 484 aa  211  3e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0499  small GTP-binding protein  33.97 
 
 		 475 aa  210  5e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362987  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.61 
 
 		 492 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  33.9 
 
 		 566 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1407  small GTP-binding protein  35.51 
 
 		 479 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1436  small GTP-binding protein  35.51 
 
 		 479 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  33.58 
 
 		 489 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2342  small GTP-binding protein  38.36 
 
 		 448 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2393  small GTP-binding protein  38.28 
 
 		 448 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1616  small GTP-binding protein  32.87 
 
 		 453 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206677 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0764  GTP-binding protein HSR1-related  39.18 
 
 		 469 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4509  small GTP-binding protein domain-containing protein  36.67 
 
 		 457 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3709  small GTP-binding protein  33.06 
 
 		 462 aa  163  6e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3839  small GTP-binding protein  30.98 
 
 		 481 aa  140  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.674432 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1544  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.45 
 
 		 517 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4459  small GTP-binding protein  30.79 
 
 		 520 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  30.58 
 
 		 529 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1709  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.52 
 
 		 513 aa  121  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000711006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1904  GTP-binding protein, HSR1-related  28.86 
 
 		 545 aa  117  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30473  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  29.8 
 
 		 506 aa  114  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  28.88 
 
 		 531 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  28.52 
 
 		 531 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09451  GTPase SAR1  28.25 
 
 		 499 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0884  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.86 
 
 		 499 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102699  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16501  GTPase SAR1 and related small G proteins  32.6 
 
 		 532 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.569133 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09441  GTPase SAR1 and related small G protein  27.27 
 
 		 499 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10221  GTPase SAR1 and related small G protein  28.34 
 
 		 516 aa  100  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.524471  normal  0.183753 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1260  hypothetical protein  30.41 
 
 		 529 aa  97.4  5e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09991  GTPase SAR1 and related small G proteins  24.61 
 
 		 496 aa  97.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1210  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.58 
 
 		 529 aa  94.7  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0145  small GTP-binding protein domain-containing protein  25.98 
 
 		 517 aa  92  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07771  GTPase SAR1 and related small G proteins  25.98 
 
 		 517 aa  91.3  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0362439 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3840  hypothetical protein  25 
 
 		 492 aa  81.3  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.693476 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2527  hypothetical protein  24.28 
 
 		 463 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4193  hypothetical protein  23.89 
 
 		 471 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.296514 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3579  hypothetical protein  24.92 
 
 		 463 aa  73.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0765  hypothetical protein  26.18 
 
 		 472 aa  73.2  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0475  small GTP-binding protein  36.43 
 
 		 404 aa  72  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0490  small GTP-binding protein  36.43 
 
 		 404 aa  72  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0732  hypothetical protein  26.5 
 
 		 481 aa  69.7  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00108673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  36.44 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1243  small GTP-binding protein  35.88 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1609  GTP-binding protein EngA  33.8 
 
 		 449 aa  63.9  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0528486 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1937  GTP-binding protein EngA  33.8 
 
 		 449 aa  63.9  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2981  ribosome-associated GTPase EngA  31.95 
 
 		 447 aa  63.5  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2373  GTP-binding protein EngA  30.82 
 
 		 466 aa  63.5  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.537703  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0076  GTP-binding protein EngA  34.55 
 
 		 468 aa  63.5  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1064  GTP-binding protein Era  27.59 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0212543  normal  0.0907756 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0692  GTP-binding protein EngA  33.6 
 
 		 470 aa  62.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  25.31 
 
 		 679 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1843  small GTP-binding protein  35.29 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1387  GTP-binding protein Era  33.77 
 
 		 308 aa  62  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.263237  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1277  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.3 
 
 		 405 aa  62  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.038791  hitchhiker  0.00000385407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2604  GTP-binding protein EngA  32.52 
 
 		 447 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156486  normal  0.601696 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0738  ribosome-associated GTPase EngA  34.03 
 
 		 484 aa  61.6  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.922813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0488  GTP-binding protein EngA  33.61 
 
 		 483 aa  61.2  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  36.64 
 
 		 460 aa  61.2  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2392  tRNA modification GTPase TrmE  34.64 
 
 		 468 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0118764  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0374  GTP-binding protein EngA  36.59 
 
 		 473 aa  60.8  0.00000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2303  GTP-binding protein EngA  30.77 
 
 		 447 aa  61.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0637103  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0683  small GTP-binding protein  34.35 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00203334  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1538  GTP-binding protein EngA  33.83 
 
 		 516 aa  60.5  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000734498 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1428  GTP-binding protein EngA  32.1 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0495777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2191  GTP-binding protein EngA  30.86 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1224  ribosome-associated GTPase EngA  33.59 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1538  GTP-binding protein EngA  33.83 
 
 		 516 aa  60.5  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0501467  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1098  GTP-binding protein EngA  30.3 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1992  GTP-binding protein EngA  32.7 
 
 		 446 aa  60.1  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.916192  normal  0.0223311 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3115  GTP-binding protein EngA  35.25 
 
 		 474 aa  60.1  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  32.65 
 
 		 546 aa  59.7  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1094  GTP-binding protein EngA  31.48 
 
 		 447 aa  60.1  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1360  small GTP-binding protein  28.48 
 
 		 445 aa  59.7  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.508315  hitchhiker  0.00000394324 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  34.62 
 
 		 296 aa  59.3  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0929  GTP-binding protein Era  27.09 
 
 		 312 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163867  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0994  GTP-binding protein Era  27.09 
 
 		 312 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.307835  normal  0.0847852 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3302  GTP-binding protein EngA  35.25 
 
 		 474 aa  59.7  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0165  small GTP-binding protein  32.14 
 
 		 427 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1186  GTP-binding protein EngA  30.57 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0375  GTP-binding protein EngA  32.56 
 
 		 483 aa  58.5  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40240  GTP-binding protein EngA  30.25 
 
 		 491 aa  58.9  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  31.08 
 
 		 583 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2846  GTP-binding protein EngA  34.43 
 
 		 473 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.64271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0118  GTP-binding protein EngA  35.88 
 
 		 452 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.132129 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5015  GTP-binding protein EngA  30.3 
 
 		 448 aa  58.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0390  GTP-binding protein EngA  32.56 
 
 		 483 aa  58.5  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.270758  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0121  GTP-binding protein EngA  35.88 
 
 		 452 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0183  small GTP-binding protein  29.91 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2251  GTP-binding protein Era  26.11 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.41102  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2152  small GTP-binding protein  34.71 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>