58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4193 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4193  hypothetical protein  100 
 
 
471 aa  939    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.296514 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2527  hypothetical protein  55.11 
 
 
463 aa  497  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3579  hypothetical protein  54.26 
 
 
463 aa  485  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0732  hypothetical protein  49.37 
 
 
481 aa  418  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00108673  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2529  hypothetical protein  46.3 
 
 
475 aa  388  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3840  hypothetical protein  42 
 
 
492 aa  314  1.9999999999999998e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.693476 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0765  hypothetical protein  40.45 
 
 
472 aa  299  7e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  28.94 
 
 
529 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1544  small GTP-binding protein domain-containing protein  28 
 
 
517 aa  182  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  29.65 
 
 
531 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1904  GTP-binding protein, HSR1-related  27.66 
 
 
545 aa  181  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30473  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  28.47 
 
 
506 aa  181  2.9999999999999997e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  29.41 
 
 
531 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1260  hypothetical protein  27.93 
 
 
529 aa  179  1e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4459  small GTP-binding protein  29.44 
 
 
520 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859915  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1709  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.41 
 
 
513 aa  175  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000711006  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0993  hypothetical protein  31.85 
 
 
459 aa  172  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.455493 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16501  GTPase SAR1 and related small G proteins  26.48 
 
 
532 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.569133 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1210  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.22 
 
 
529 aa  158  3e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07771  GTPase SAR1 and related small G proteins  24.88 
 
 
517 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0362439 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0145  small GTP-binding protein domain-containing protein  24.48 
 
 
517 aa  140  6e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10221  GTPase SAR1 and related small G protein  25.25 
 
 
516 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.524471  normal  0.183753 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09991  GTPase SAR1 and related small G proteins  22.5 
 
 
496 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09441  GTPase SAR1 and related small G protein  24.15 
 
 
499 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09451  GTPase SAR1  23.21 
 
 
499 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2342  small GTP-binding protein  27.94 
 
 
448 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0884  small GTP-binding protein domain-containing protein  23.16 
 
 
499 aa  94.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102699  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2393  small GTP-binding protein  27.57 
 
 
448 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1616  small GTP-binding protein  26.88 
 
 
453 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206677 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  25.48 
 
 
489 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  24.88 
 
 
472 aa  90.5  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0036  hypothetical protein  40.16 
 
 
451 aa  87  7e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06561  hypothetical protein  40.16 
 
 
451 aa  86.7  8e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0586116  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3709  small GTP-binding protein  24.72 
 
 
462 aa  85.1  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0499  small GTP-binding protein  24.87 
 
 
475 aa  82.4  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362987  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  26.97 
 
 
566 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1436  small GTP-binding protein  25.11 
 
 
479 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741449  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1407  small GTP-binding protein  25.11 
 
 
479 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4509  small GTP-binding protein domain-containing protein  24.34 
 
 
457 aa  77.8  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  24.82 
 
 
492 aa  77.8  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0764  GTP-binding protein HSR1-related  24.36 
 
 
469 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3839  small GTP-binding protein  24.31 
 
 
481 aa  75.5  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.674432 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1080  small GTP-binding protein  24.69 
 
 
484 aa  75.1  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0942  hypothetical protein  29.63 
 
 
409 aa  73.6  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1041  hypothetical protein  30.92 
 
 
427 aa  73.2  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18671  hypothetical protein  32.62 
 
 
454 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10501  hypothetical protein  35.25 
 
 
452 aa  72.4  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.546761  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  24.25 
 
 
440 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  24.23 
 
 
440 aa  72.4  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  23.66 
 
 
440 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2178  small GTP-binding protein domain-containing protein  25.12 
 
 
431 aa  68.2  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.995116  normal  0.41065 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06261  hypothetical protein  28.38 
 
 
444 aa  67  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.307417  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06561  hypothetical protein  28.38 
 
 
444 aa  66.6  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0497  GTPase  24.82 
 
 
420 aa  66.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06651  hypothetical protein  28.38 
 
 
441 aa  64.7  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.19344  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0600  hypothetical protein  27.7 
 
 
444 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16461  GTPase SAR1  21.41 
 
 
413 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04921  GTPase SAR1  23.89 
 
 
441 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>