247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1544 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  66.14 
 
 
531 aa  650    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1544  small GTP-binding protein domain-containing protein  100 
 
 
517 aa  1031    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  87.7 
 
 
506 aa  842    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1904  GTP-binding protein, HSR1-related  65.32 
 
 
545 aa  655    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30473  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  66.14 
 
 
531 aa  650    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  70.06 
 
 
529 aa  716    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4459  small GTP-binding protein  65.08 
 
 
520 aa  622  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859915  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1709  small GTP-binding protein domain-containing protein  62.96 
 
 
513 aa  600  1e-170  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000711006  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16501  GTPase SAR1 and related small G proteins  46.91 
 
 
532 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.569133 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1260  hypothetical protein  50.12 
 
 
529 aa  432  1e-120  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1210  small GTP-binding protein domain-containing protein  46.75 
 
 
529 aa  414  1e-114  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10221  GTPase SAR1 and related small G protein  48.15 
 
 
516 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.524471  normal  0.183753 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0145  small GTP-binding protein domain-containing protein  45.58 
 
 
517 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07771  GTPase SAR1 and related small G proteins  45.35 
 
 
517 aa  392  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0362439 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09441  GTPase SAR1 and related small G protein  32.16 
 
 
499 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09991  GTPase SAR1 and related small G proteins  35.52 
 
 
496 aa  289  7e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09451  GTPase SAR1  36.25 
 
 
499 aa  289  9e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0884  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.66 
 
 
499 aa  273  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102699  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0765  hypothetical protein  29.88 
 
 
472 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4193  hypothetical protein  28 
 
 
471 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.296514 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3840  hypothetical protein  27.73 
 
 
492 aa  168  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.693476 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0732  hypothetical protein  26.97 
 
 
481 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00108673  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2529  hypothetical protein  30.12 
 
 
475 aa  157  4e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.15 
 
 
472 aa  149  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2527  hypothetical protein  26.33 
 
 
463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3579  hypothetical protein  26.04 
 
 
463 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1616  small GTP-binding protein  29.26 
 
 
453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206677 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0499  small GTP-binding protein  28.74 
 
 
475 aa  130  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362987  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1407  small GTP-binding protein  29.51 
 
 
479 aa  130  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1436  small GTP-binding protein  31.63 
 
 
479 aa  130  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741449  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3709  small GTP-binding protein  28.6 
 
 
462 aa  130  8.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  29.08 
 
 
566 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2342  small GTP-binding protein  27.52 
 
 
448 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2393  small GTP-binding protein  27.52 
 
 
448 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4509  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.79 
 
 
457 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0993  hypothetical protein  28.54 
 
 
459 aa  122  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.455493 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0764  GTP-binding protein HSR1-related  27.6 
 
 
469 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  26.75 
 
 
489 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0497  GTPase  27.46 
 
 
420 aa  113  8.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  28.2 
 
 
440 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.18 
 
 
492 aa  110  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2178  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.56 
 
 
431 aa  109  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.995116  normal  0.41065 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  25.08 
 
 
440 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  24.68 
 
 
440 aa  107  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3839  small GTP-binding protein  25.7 
 
 
481 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.674432 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1080  small GTP-binding protein  28.27 
 
 
484 aa  105  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04921  GTPase SAR1  32.12 
 
 
441 aa  99.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16461  GTPase SAR1  21.26 
 
 
413 aa  84.7  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0942  hypothetical protein  34.75 
 
 
409 aa  82  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16341  GTPase SAR1 and related small G protein  23.31 
 
 
413 aa  82.4  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1041  hypothetical protein  33.61 
 
 
427 aa  80.1  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10501  hypothetical protein  31.3 
 
 
452 aa  76.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.546761  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0036  hypothetical protein  32.06 
 
 
451 aa  76.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06561  hypothetical protein  32.06 
 
 
451 aa  76.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0586116  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18671  hypothetical protein  33.9 
 
 
454 aa  75.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16231  GTPase SAR1 and related small G proteins  23.93 
 
 
413 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.283634  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1537  small GTP-binding protein domain-containing protein  23.65 
 
 
413 aa  71.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1806  GTP-binding protein Era  35.44 
 
 
297 aa  67  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0584484  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06261  hypothetical protein  28.1 
 
 
444 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.307417  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0600  hypothetical protein  28.1 
 
 
444 aa  65.1  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06561  hypothetical protein  28.1 
 
 
444 aa  65.1  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06651  hypothetical protein  26.67 
 
 
441 aa  64.7  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.19344  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1260  tRNA modification GTPase TrmE  35.77 
 
 
449 aa  63.9  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2392  tRNA modification GTPase TrmE  39.2 
 
 
468 aa  60.5  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0118764  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  30.87 
 
 
589 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0208  GTP-binding protein Era  31.79 
 
 
297 aa  59.3  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0372  GTP-binding protein Era  30.23 
 
 
297 aa  56.6  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0680727  normal  0.750756 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3472  tRNA modification GTPase TrmE  32.75 
 
 
442 aa  54.7  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1851  GTP-binding protein Era  34.11 
 
 
309 aa  54.3  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6543  GTP-binding protein Era  29.05 
 
 
289 aa  54.3  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4891  putative GTPase  30.3 
 
 
290 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3433  GTP-binding protein HSR1-related  32.03 
 
 
291 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0858  tRNA modification GTPase TrmE  29.79 
 
 
442 aa  53.5  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1915  tRNA modification GTPase TrmE  39.17 
 
 
457 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.410866  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3346  putative GTPase  30.3 
 
 
290 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1246  GTP-binding proten HflX  24.89 
 
 
356 aa  52  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0884  tRNA modification GTPase TrmE  33.7 
 
 
452 aa  52.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0886  tRNA modification GTPase TrmE  36.09 
 
 
478 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00940326 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0692  GTP-binding protein EngA  34.13 
 
 
470 aa  52.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1393  putative GTPase  30.3 
 
 
290 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3256  small GTP-binding protein  29.14 
 
 
412 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00305193  hitchhiker  0.00001491 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  30.63 
 
 
546 aa  52.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2251  putative GTPase  30.3 
 
 
290 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.796861  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2138  putative GTPase  30.3 
 
 
290 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1071  putative GTPase  29.38 
 
 
290 aa  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0467468 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1243  small GTP-binding protein  32.81 
 
 
425 aa  52  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1715  hypothetical protein  34.34 
 
 
192 aa  52  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691695  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0042  small GTP-binding protein  28.93 
 
 
400 aa  51.6  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1224  ribosome-associated GTPase EngA  33.86 
 
 
447 aa  52  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2387  tRNA modification GTPase TrmE  30.93 
 
 
465 aa  50.8  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.188748  hitchhiker  0.000106684 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03489  tRNA modification GTPase TrmE  34.59 
 
 
446 aa  50.8  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  31.68 
 
 
585 aa  50.8  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0683  small GTP-binding protein  29.2 
 
 
408 aa  50.8  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00203334  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1141  GTP-binding protein Era  29.5 
 
 
296 aa  50.4  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  31.06 
 
 
460 aa  50.4  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1159  GTP-binding protein EngA  32 
 
 
436 aa  50.4  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427593  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0562  GTP-binding protein Era  28.57 
 
 
300 aa  50.4  0.00008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.204296  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1982  tRNA modification GTPase TrmE  32.61 
 
 
442 aa  50.1  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.535641  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2062  tRNA modification GTPase TrmE  32.61 
 
 
442 aa  50.1  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00847213  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1683  labile enterotoxin output A  26.03 
 
 
568 aa  50.1  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>