More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0562 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0562  GTP-binding protein Era  100 
 
 
300 aa  600  1e-170  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.204296  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0332  GTP-binding protein Era  43.85 
 
 
293 aa  223  3e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  40.91 
 
 
300 aa  217  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  41.04 
 
 
302 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  39.09 
 
 
296 aa  210  3e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  38.96 
 
 
298 aa  209  4e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl266  GTP-binding protein Era  40.07 
 
 
301 aa  208  8e-53  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  6.59888e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  38.76 
 
 
296 aa  208  8e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  37.29 
 
 
299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  37.76 
 
 
301 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  37.41 
 
 
301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  36.39 
 
 
301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  38.05 
 
 
303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  37.41 
 
 
301 aa  196  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  37.41 
 
 
301 aa  196  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  37.41 
 
 
301 aa  196  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  37.41 
 
 
301 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  37.41 
 
 
301 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  38.82 
 
 
303 aa  196  5.000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  37.41 
 
 
301 aa  195  9e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  37.41 
 
 
301 aa  195  9e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  36.15 
 
 
301 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  36 
 
 
303 aa  194  2e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  32.89 
 
 
299 aa  192  6e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  37.5 
 
 
305 aa  192  7e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0507  GTP-binding protein Era  39.34 
 
 
301 aa  191  1e-47  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.000333853  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  35.22 
 
 
302 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  35.97 
 
 
299 aa  191  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  38.16 
 
 
294 aa  190  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  36.05 
 
 
302 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  35.22 
 
 
303 aa  188  8e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  33.9 
 
 
298 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0791  GTP-binding protein Era  33.9 
 
 
312 aa  187  3e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000010193  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  34.01 
 
 
299 aa  186  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  34.01 
 
 
299 aa  186  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2311  GTP-binding protein Era  34.34 
 
 
309 aa  185  7e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.254696  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  32.76 
 
 
299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  37.7 
 
 
297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0544  GTP-binding protein Era  34.24 
 
 
299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.439886  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2839  GTP-binding protein Era  34.24 
 
 
299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2894  GTP-binding protein Era  34.24 
 
 
299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2465  GTP-binding protein Era  34.24 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2816  GTP-binding protein Era  34.24 
 
 
299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.989072  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1788  GTP-binding protein Era  34.24 
 
 
299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2778  GTP-binding protein Era  34.24 
 
 
299 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  39.74 
 
 
301 aa  183  4.0000000000000006e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1731  GTP-binding protein Era  33.9 
 
 
299 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.379458  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  38.64 
 
 
307 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  37.01 
 
 
306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  33.77 
 
 
297 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0864  GTP-binding protein Era  34.35 
 
 
296 aa  180  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1008  GTP-binding protein Era  34.35 
 
 
296 aa  180  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.028746 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  35.88 
 
 
305 aa  181  2e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1323  GTP-binding protein Era  34.22 
 
 
298 aa  179  4e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0411499  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf635  GTP-binding protein Era  35.45 
 
 
294 aa  179  7e-44  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.308582  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  33.45 
 
 
449 aa  179  7e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2898  GTP-binding protein Era  33.56 
 
 
299 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22233  normal  0.295103 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0842  GTP-binding protein Era  34.11 
 
 
287 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0615921  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  33.77 
 
 
293 aa  178  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  32.23 
 
 
303 aa  178  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  33.77 
 
 
302 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3235  GTP-binding protein Era  35.35 
 
 
489 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00276402  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1086  GTP-binding protein Era  33.22 
 
 
299 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  32.76 
 
 
451 aa  176  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002498  GTP-binding protein Era  33.67 
 
 
320 aa  176  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4483  GTP-binding protein Era  35.08 
 
 
318 aa  175  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  37.16 
 
 
301 aa  175  9e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  32.56 
 
 
296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4247  GTP-binding protein Era  33.22 
 
 
299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0597  GTP-binding protein Era  33.22 
 
 
348 aa  173  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117321 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3787  GTP-binding protein Era  33.78 
 
 
468 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.0434052 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2038  GTP-binding protein Era  34.01 
 
 
324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.655908  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  32.77 
 
 
300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2169  GTP-binding protein Era  33.77 
 
 
299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0368513  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1011  GTP-binding protein Era  33.22 
 
 
299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262432  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3777  GTP-binding protein Era  33.89 
 
 
295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1506  GTP-binding protein Era  33.77 
 
 
301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.094805  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  34.1 
 
 
307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1064  GTP-binding protein Era  32.32 
 
 
303 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03535  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 
320 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0735  GTP-binding protein Era  32.77 
 
 
314 aa  172  5e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.222854  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1632  GTP-binding protein Era  32.89 
 
 
299 aa  172  5e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0334  GTP-binding protein Era  33.44 
 
 
330 aa  172  5.999999999999999e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.94828  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  35.22 
 
 
300 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0368  GTP-binding protein Era  33.44 
 
 
338 aa  172  7.999999999999999e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0276101 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  32.12 
 
 
308 aa  172  9e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  32.01 
 
 
298 aa  171  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1247  GTP-binding protein Era  33.44 
 
 
300 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.734456  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1543  GTP-binding protein Era  30.1 
 
 
314 aa  171  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  37.87 
 
 
300 aa  171  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1015  GTP-binding protein Era  33.22 
 
 
287 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07630  GTP-binding protein Era  34.47 
 
 
315 aa  171  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.718236 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0655  GTP-binding protein Era  32.88 
 
 
299 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1038  GTP-binding protein Era  32.78 
 
 
330 aa  170  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00137835  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1135  GTP-binding protein Era  32.88 
 
 
299 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  31.53 
 
 
307 aa  170  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  35.2 
 
 
314 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1149  GTP-binding protein Era  32.11 
 
 
335 aa  169  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.28675  normal  0.946741 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12970  GTP-binding protein Era  31.86 
 
 
301 aa  169  4e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.141984 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0881  GTP-binding protein Era  31.19 
 
 
332 aa  169  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.427391  normal  0.11596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>