More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2138 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A2138  putative GTPase  100 
 
 		 290 aa  594  1e-169  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4891  putative GTPase  97.93 
 
 		 290 aa  585  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2251  putative GTPase  98.62 
 
 		 290 aa  584  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.796861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3346  putative GTPase  97.59 
 
 		 290 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1393  putative GTPase  97.59 
 
 		 290 aa  577  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1071  putative GTPase  96.9 
 
 		 290 aa  578  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0467468 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1658  GTPase-like protein  97.81 
 
 		 236 aa  368  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.374478  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  59.79 
 
 		 291 aa  362  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3433  GTP-binding protein HSR1-related  59.45 
 
 		 291 aa  349  3e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1043  GTP-binding protein HSR1-related protein  49.83 
 
 		 287 aa  277  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0930  GTP-binding protein HSR1-related  50.85 
 
 		 288 aa  278  1e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.518572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3353  GTP-binding protein HSR1-related protein  49.48 
 
 		 287 aa  277  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1388  GTP-binding protein HSR1-related protein  45.7 
 
 		 291 aa  266  4e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2882  GTP-binding protein HSR1-related  45.02 
 
 		 291 aa  262  6e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3137  GTP-binding protein HSR1-related  43.77 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3402  putative GTPase  37.1 
 
 		 294 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3202  putative GTPase  37.1 
 
 		 294 aa  199  6e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4685  putative GTPase  36.75 
 
 		 294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4797  putative GTPase  36.75 
 
 		 294 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2380  GTP-binding protein, HSR1-related  31.28 
 
 		 635 aa  66.2  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2089  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.37 
 
 		 637 aa  62.4  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000643797  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0848  GTP-binding protein Era  29.12 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319285  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4767  GTP-binding protein HSR1-related  28.93 
 
 		 629 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.049365  hitchhiker  0.000697216 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4307  GTP-binding protein HSR1-related  34.48 
 
 		 650 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  29.44 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3828  GTP-binding protein Era  27.75 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  24.18 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2710  GTP-binding protein Era  27.75 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.521075  normal  0.585399 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  32.28 
 
 		 531 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  32.28 
 
 		 531 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0656  GTP-binding protein HSR1-related protein  28.63 
 
 		 512 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.53051  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1153  hypothetical protein  29.26 
 
 		 614 aa  56.6  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.9167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3155  GTP-binding protein Era  24.88 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0422741  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1709  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.93 
 
 		 513 aa  55.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000711006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  29.93 
 
 		 529 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.12 
 
 		 472 aa  54.7  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  23.18 
 
 		 296 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  23.18 
 
 		 296 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2152  GTP-binding protein, HSR1-related  27.78 
 
 		 523 aa  53.9  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13500  GTP-binding protein Era  28.42 
 
 		 314 aa  53.5  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1403  hypothetical protein  25.34 
 
 		 328 aa  53.5  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  24.19 
 
 		 296 aa  52.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1544  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.3 
 
 		 517 aa  52.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1966  GTP-binding protein Era  25.41 
 
 		 319 aa  52.8  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000219392 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  27.4 
 
 		 451 aa  52.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1337  small GTP-binding protein  27.04 
 
 		 438 aa  52.4  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0503171  normal  0.51028 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  29.26 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  24.18 
 
 		 306 aa  52  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0320  small GTP-binding protein  26.88 
 
 		 197 aa  52  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10530  small GTP-binding protein  26.67 
 
 		 438 aa  52  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  21.58 
 
 		 299 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  21.58 
 
 		 299 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0793  GTP-binding protein Era  27.22 
 
 		 297 aa  52.4  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.998663  normal  0.0560127 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2632  small GTP-binding protein  26.58 
 
 		 434 aa  51.2  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.27 
 
 		 440 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  24.04 
 
 		 294 aa  50.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  26.49 
 
 		 298 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  26.54 
 
 		 460 aa  51.2  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2758  GTP-binding protein Era  25.84 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0588408  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  30.89 
 
 		 489 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1284  tRNA modification GTPase TrmE  33.61 
 
 		 451 aa  50.4  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  26.57 
 
 		 440 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0791  GTP-binding protein Era  29.84 
 
 		 312 aa  50.1  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000010193  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  29.32 
 
 		 506 aa  50.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2311  GTP-binding protein Era  26.64 
 
 		 309 aa  49.7  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.254696  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3496  GTP-binding protein EngA  26.67 
 
 		 492 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3778  small GTP-binding protein  26.75 
 
 		 433 aa  50.1  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2082  GTP-binding protein Era  31.68 
 
 		 313 aa  49.7  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.592415  normal  0.853182 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1260  tRNA modification GTPase TrmE  25.63 
 
 		 449 aa  49.7  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  29.53 
 
 		 566 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0251  GTP-binding protein Era  25.14 
 
 		 311 aa  49.3  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  21.43 
 
 		 301 aa  49.3  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2840  small GTP-binding protein  26.34 
 
 		 501 aa  49.3  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118235 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0825  tRNA modification GTPase TrmE  29.01 
 
 		 442 aa  49.3  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0857  GTP-binding protein EngA  24.19 
 
 		 487 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06890  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  26.92 
 
 		 444 aa  48.5  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.632761 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1298  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  28.34 
 
 		 205 aa  48.5  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.034569  normal  0.192806 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3243  GTP-binding protein Era  26.67 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0404456  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0519  GTP-binding protein EngA  22.34 
 
 		 433 aa  48.9  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1193  GTPase  33.33 
 
 		 428 aa  48.5  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.346231  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0717  tRNA modification GTPase TrmE  27.45 
 
 		 550 aa  48.9  0.0001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0711  GTP-binding protein Era  24.19 
 
 		 322 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0374  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  27.64 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0899895 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2229  GTP-binding protein Era  24.32 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00352178  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1042  GTP-binding protein Era  28.23 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0900  GTP-binding protein EngA  23.66 
 
 		 487 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000256408 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3205  tRNA modification GTPase TrmE  28.7 
 
 		 440 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0083  GTP-binding protein EngA  24.86 
 
 		 476 aa  48.1  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  19.47 
 
 		 299 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1407  small GTP-binding protein  26.34 
 
 		 479 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1262  GTP-binding protein EngA  28 
 
 		 495 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.763175  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1436  small GTP-binding protein  26.34 
 
 		 479 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  21.43 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  24.04 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0526  tRNA modification GTPase TrmE  28.65 
 
 		 446 aa  48.1  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1297  GTP-binding protein EngA  28.37 
 
 		 495 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2733  GTP-binding protein EngA  29.75 
 
 		 494 aa  47.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2497  small GTP-binding protein  29.83 
 
 		 198 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0979  tRNA modification GTPase TrmE  29.01 
 
 		 442 aa  47.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.523955  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3010  GTP-binding protein EngA  28 
 
 		 495 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>