More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3291 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  100 
 
 		 492 aa  979    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1080  small GTP-binding protein  80.82 
 
 		 484 aa  791    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  65.82 
 
 		 566 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0499  small GTP-binding protein  63.81 
 
 		 475 aa  598  1e-170  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362987  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  62.89 
 
 		 489 aa  593  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1407  small GTP-binding protein  63.95 
 
 		 479 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1436  small GTP-binding protein  63.44 
 
 		 479 aa  567  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  45.65 
 
 		 472 aa  409  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1616  small GTP-binding protein  39.71 
 
 		 453 aa  344  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206677 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3709  small GTP-binding protein  41.16 
 
 		 462 aa  330  5.0000000000000004e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4509  small GTP-binding protein domain-containing protein  42.73 
 
 		 457 aa  315  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2342  small GTP-binding protein  39.21 
 
 		 448 aa  299  6e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2393  small GTP-binding protein  39.21 
 
 		 448 aa  299  6e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3839  small GTP-binding protein  38.41 
 
 		 481 aa  293  4e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.674432 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0764  GTP-binding protein HSR1-related  34.99 
 
 		 469 aa  229  9e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0497  GTPase  35.41 
 
 		 420 aa  196  7e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  27.54 
 
 		 440 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  32.35 
 
 		 440 aa  177  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.78 
 
 		 440 aa  176  7e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2178  small GTP-binding protein domain-containing protein  35.74 
 
 		 431 aa  176  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.995116  normal  0.41065 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04921  GTPase SAR1  33.33 
 
 		 441 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16461  GTPase SAR1  27.08 
 
 		 413 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16341  GTPase SAR1 and related small G protein  26.65 
 
 		 413 aa  150  7e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16231  GTPase SAR1 and related small G proteins  27.91 
 
 		 413 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.283634  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1537  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.9 
 
 		 413 aa  143  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4459  small GTP-binding protein  28.53 
 
 		 520 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  28.64 
 
 		 531 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1709  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.8 
 
 		 513 aa  122  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000711006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  27.91 
 
 		 529 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  28.13 
 
 		 531 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  27.59 
 
 		 506 aa  119  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16501  GTPase SAR1 and related small G proteins  26.13 
 
 		 532 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.569133 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1544  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.18 
 
 		 517 aa  110  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09991  GTPase SAR1 and related small G proteins  25.93 
 
 		 496 aa  109  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07771  GTPase SAR1 and related small G proteins  25.55 
 
 		 517 aa  106  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0362439 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1904  GTP-binding protein, HSR1-related  27.32 
 
 		 545 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0145  small GTP-binding protein domain-containing protein  25.55 
 
 		 517 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1210  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.8 
 
 		 529 aa  102  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09451  GTPase SAR1  24.26 
 
 		 499 aa  96.7  8e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1260  hypothetical protein  27.03 
 
 		 529 aa  96.3  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09441  GTPase SAR1 and related small G protein  25.48 
 
 		 499 aa  94.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10221  GTPase SAR1 and related small G protein  23.22 
 
 		 516 aa  92.8  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.524471  normal  0.183753 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0884  small GTP-binding protein domain-containing protein  24.58 
 
 		 499 aa  90.1  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102699  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4193  hypothetical protein  24.82 
 
 		 471 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.296514 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  30.62 
 
 		 548 aa  73.6  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0765  hypothetical protein  25.67 
 
 		 472 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0732  hypothetical protein  26.72 
 
 		 481 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00108673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2529  hypothetical protein  28.99 
 
 		 475 aa  67.8  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3579  hypothetical protein  28.19 
 
 		 463 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3840  hypothetical protein  26.12 
 
 		 492 aa  65.1  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.693476 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2527  hypothetical protein  28.19 
 
 		 463 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  31.95 
 
 		 583 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  33.33 
 
 		 546 aa  62  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  34.35 
 
 		 632 aa  60.1  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  30.96 
 
 		 585 aa  59.7  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1387  GTP-binding protein Era  33.57 
 
 		 308 aa  56.2  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.263237  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4121  GTP-binding protein Era  31.25 
 
 		 305 aa  55.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.383616  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  35.37 
 
 		 551 aa  54.7  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  28.19 
 
 		 605 aa  54.3  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  31.03 
 
 		 302 aa  54.3  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1572  GTP-binding protein EngA  29.32 
 
 		 460 aa  53.9  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0165  small GTP-binding protein  30.28 
 
 		 427 aa  53.5  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0828  ribosome-associated GTPase EngA  29.17 
 
 		 734 aa  53.5  0.000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  33.57 
 
 		 564 aa  53.5  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  31.1 
 
 		 407 aa  52.8  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3402  putative GTPase  30.99 
 
 		 294 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  30.15 
 
 		 324 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4797  putative GTPase  30.99 
 
 		 294 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1243  small GTP-binding protein  29.86 
 
 		 425 aa  53.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02997  GTP-binding protein Era  26.42 
 
 		 314 aa  52.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249422  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1160  GTP-binding protein EngA  33.33 
 
 		 439 aa  53.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0769833  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1924  ribosome-associated GTPase EngA  34.12 
 
 		 515 aa  52.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00693706  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0435  GTP-binding protein EngA  28.57 
 
 		 460 aa  52.4  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0231  translation initiation factor IF-2  32.48 
 
 		 883 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0340219  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0409  GTP-binding protein EngA  28.57 
 
 		 460 aa  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0683  small GTP-binding protein  30.77 
 
 		 408 aa  52  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00203334  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1064  GTP-binding protein Era  32.03 
 
 		 303 aa  51.6  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1239  GTP-binding protein Era  31.25 
 
 		 300 aa  51.6  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.680465  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  29.61 
 
 		 605 aa  51.2  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4685  putative GTPase  30.28 
 
 		 294 aa  51.2  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0359  GTP-binding protein EngA  35.57 
 
 		 436 aa  51.2  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19830  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  30.27 
 
 		 531 aa  50.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3787  GTP-binding protein Era  30.72 
 
 		 468 aa  50.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.0434052 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  30.71 
 
 		 438 aa  51.2  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  30.71 
 
 		 438 aa  51.2  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1010  GTP-binding protein TypA  28.75 
 
 		 613 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0475  small GTP-binding protein  29.03 
 
 		 404 aa  50.8  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  30.3 
 
 		 587 aa  50.8  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0490  small GTP-binding protein  29.03 
 
 		 404 aa  50.8  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2081  small GTP-binding protein  29.93 
 
 		 416 aa  50.4  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000627073  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0440  translation initiation factor IF-2  31.88 
 
 		 883 aa  50.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  27.43 
 
 		 398 aa  50.4  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3137  GTP-binding protein HSR1-related  27.39 
 
 		 295 aa  50.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3190  translation initiation factor IF-2  28.48 
 
 		 938 aa  50.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0916  small GTP-binding protein  30.67 
 
 		 439 aa  50.4  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.704291  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1093  GTP-binding protein Era  34.11 
 
 		 281 aa  50.4  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.605646  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1825  GTP-binding protein Era  29.19 
 
 		 309 aa  50.4  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0596  hypothetical protein  27.61 
 
 		 357 aa  50.1  0.00009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1266  elongation factor G  29.63 
 
 		 684 aa  50.1  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.782059  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0463  bifunctional cytidylate kinase/GTP-binding protein  29.77 
 
 		 709 aa  49.7  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.816012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>