120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1210 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1260  hypothetical protein  75.8 
 
 		 529 aa  744    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1210  small GTP-binding protein domain-containing protein  100 
 
 		 529 aa  1045    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16501  GTPase SAR1 and related small G proteins  62.78 
 
 		 532 aa  681    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.569133 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10221  GTPase SAR1 and related small G protein  53.77 
 
 		 516 aa  508  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.524471  normal  0.183753 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0145  small GTP-binding protein domain-containing protein  49.49 
 
 		 517 aa  470  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07771  GTPase SAR1 and related small G proteins  49.18 
 
 		 517 aa  470  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0362439 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1544  small GTP-binding protein domain-containing protein  46.55 
 
 		 517 aa  423  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  49.54 
 
 		 506 aa  415  9.999999999999999e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  47.46 
 
 		 531 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  47.46 
 
 		 531 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  45.67 
 
 		 529 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1709  small GTP-binding protein domain-containing protein  45.91 
 
 		 513 aa  392  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000711006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1904  GTP-binding protein, HSR1-related  43.24 
 
 		 545 aa  380  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4459  small GTP-binding protein  43.85 
 
 		 520 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09451  GTPase SAR1  35.43 
 
 		 499 aa  320  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0884  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.45 
 
 		 499 aa  318  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102699  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09441  GTPase SAR1 and related small G protein  34.34 
 
 		 499 aa  318  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09991  GTPase SAR1 and related small G proteins  35.45 
 
 		 496 aa  311  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4193  hypothetical protein  28.22 
 
 		 471 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.296514 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3840  hypothetical protein  25.74 
 
 		 492 aa  153  5.9999999999999996e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.693476 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0732  hypothetical protein  26.03 
 
 		 481 aa  150  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00108673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0765  hypothetical protein  31.28 
 
 		 472 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1616  small GTP-binding protein  29.21 
 
 		 453 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206677 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2529  hypothetical protein  26.68 
 
 		 475 aa  134  5e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3709  small GTP-binding protein  29.97 
 
 		 462 aa  129  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0764  GTP-binding protein HSR1-related  29.43 
 
 		 469 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0499  small GTP-binding protein  31.02 
 
 		 475 aa  127  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362987  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.05 
 
 		 472 aa  127  6e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2342  small GTP-binding protein  27.95 
 
 		 448 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2527  hypothetical protein  23.77 
 
 		 463 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2393  small GTP-binding protein  27.95 
 
 		 448 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  27.76 
 
 		 566 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3579  hypothetical protein  22.89 
 
 		 463 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  25.85 
 
 		 489 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1407  small GTP-binding protein  29.07 
 
 		 479 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1436  small GTP-binding protein  27.4 
 
 		 479 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3839  small GTP-binding protein  28.15 
 
 		 481 aa  107  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.674432 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1080  small GTP-binding protein  27.32 
 
 		 484 aa  106  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4509  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.43 
 
 		 457 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.61 
 
 		 492 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2178  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.41 
 
 		 431 aa  103  8e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.995116  normal  0.41065 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.78 
 
 		 440 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  26.78 
 
 		 440 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0497  GTPase  30.89 
 
 		 420 aa  99  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  30.8 
 
 		 440 aa  98.2  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0993  hypothetical protein  28.87 
 
 		 459 aa  87.4  6e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.455493 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16461  GTPase SAR1  22.44 
 
 		 413 aa  76.6  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16341  GTPase SAR1 and related small G protein  23.1 
 
 		 413 aa  76.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04921  GTPase SAR1  30.09 
 
 		 441 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16231  GTPase SAR1 and related small G proteins  22.52 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.283634  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0036  hypothetical protein  31.14 
 
 		 451 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06561  hypothetical protein  31.14 
 
 		 451 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0586116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  28.77 
 
 		 398 aa  57  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1537  small GTP-binding protein domain-containing protein  23.1 
 
 		 413 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10501  hypothetical protein  32.37 
 
 		 452 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.546761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0942  hypothetical protein  31.13 
 
 		 409 aa  53.5  0.000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06561  hypothetical protein  18.98 
 
 		 444 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  32.43 
 
 		 461 aa  52  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1041  hypothetical protein  31.13 
 
 		 427 aa  51.2  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0600  hypothetical protein  26.92 
 
 		 444 aa  51.2  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  28.32 
 
 		 587 aa  51.2  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3202  putative GTPase  30.34 
 
 		 294 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06261  hypothetical protein  23.78 
 
 		 444 aa  50.4  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.307417  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2392  tRNA modification GTPase TrmE  35.71 
 
 		 468 aa  50.4  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0118764  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1715  hypothetical protein  31.58 
 
 		 192 aa  50.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691695  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06651  hypothetical protein  26.52 
 
 		 441 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.19344  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18671  hypothetical protein  33.96 
 
 		 454 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3192  hypothetical protein  29.61 
 
 		 465 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.279766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  31.25 
 
 		 291 aa  49.7  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0475  small GTP-binding protein  31.16 
 
 		 404 aa  48.9  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0490  small GTP-binding protein  31.16 
 
 		 404 aa  48.9  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4797  putative GTPase  28.65 
 
 		 294 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  23.56 
 
 		 461 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3402  putative GTPase  28.65 
 
 		 294 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1224  ribosome-associated GTPase EngA  36.22 
 
 		 447 aa  48.5  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0089  tRNA modification GTPase TrmE  29.03 
 
 		 455 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004103  ferrous iron transport protein B  33.09 
 
 		 758 aa  48.1  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  32.09 
 
 		 460 aa  48.1  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3926  GTP-binding protein  29.33 
 
 		 394 aa  47.8  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  26.77 
 
 		 455 aa  47.4  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16490  iron-only hydrogenase maturation protein HydF  34.45 
 
 		 416 aa  47.4  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.520712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2258  ferrous iron transport protein FeoB  34.68 
 
 		 758 aa  47.8  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.694686  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4685  putative GTPase  28.65 
 
 		 294 aa  47.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1729  ferrous iron transport protein B  32.26 
 
 		 717 aa  47  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0580785 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  33.86 
 
 		 456 aa  46.6  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2152  small GTP-binding protein  29.93 
 
 		 409 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01364  hypothetical protein  32.35 
 
 		 758 aa  46.6  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  29.08 
 
 		 546 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0683  small GTP-binding protein  30.53 
 
 		 408 aa  47  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00203334  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03489  tRNA modification GTPase TrmE  37.5 
 
 		 446 aa  46.6  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_2271  predicted protein  29.87 
 
 		 489 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  28.85 
 
 		 407 aa  45.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2472  tRNA modification GTPase TrmE  27.64 
 
 		 487 aa  45.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000689916 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3256  small GTP-binding protein  28.33 
 
 		 412 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00305193  hitchhiker  0.00001491 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0705  small GTP-binding protein  27.33 
 
 		 412 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.131335  hitchhiker  0.000692522 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56161  predicted protein  27.69 
 
 		 478 aa  46.2  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  31.68 
 
 		 583 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1999  GTP-binding protein Era  25.7 
 
 		 306 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00245097  normal  0.170992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2707  tRNA modification GTPase TrmE  26.95 
 
 		 466 aa  45.4  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622975  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4041  tRNA modification GTPase TrmE  36.51 
 
 		 449 aa  45.4  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.934487  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>