253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4685 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4685  putative GTPase  100 
 
 
294 aa  608  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3402  putative GTPase  96.6 
 
 
294 aa  590  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4797  putative GTPase  96.26 
 
 
294 aa  588  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3202  putative GTPase  95.24 
 
 
294 aa  580  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  40.28 
 
 
291 aa  237  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3433  GTP-binding protein HSR1-related  38.71 
 
 
291 aa  230  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2882  GTP-binding protein HSR1-related  36.01 
 
 
291 aa  208  9e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0930  GTP-binding protein HSR1-related  40.43 
 
 
288 aa  207  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.518572  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1388  GTP-binding protein HSR1-related protein  34.15 
 
 
291 aa  204  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3137  GTP-binding protein HSR1-related  36.36 
 
 
295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2138  putative GTPase  36.75 
 
 
290 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3346  putative GTPase  36.75 
 
 
290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4891  putative GTPase  36.75 
 
 
290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2251  putative GTPase  36.4 
 
 
290 aa  193  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.796861  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1043  GTP-binding protein HSR1-related protein  36.4 
 
 
287 aa  193  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1071  putative GTPase  36.75 
 
 
290 aa  192  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0467468 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1393  putative GTPase  35.69 
 
 
290 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.139964 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3353  GTP-binding protein HSR1-related protein  35.29 
 
 
287 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1658  GTPase-like protein  32.43 
 
 
236 aa  106  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.374478  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  33.33 
 
 
566 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  31 
 
 
302 aa  55.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl266  GTP-binding protein Era  29.58 
 
 
301 aa  54.7  0.000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  6.59888e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2103  GTP-binding protein EngA  30 
 
 
441 aa  53.9  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0134  GTP-binding protein Era  28.26 
 
 
299 aa  53.1  0.000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0499  small GTP-binding protein  26.73 
 
 
475 aa  52.4  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362987  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2152  GTP-binding protein, HSR1-related  23.33 
 
 
523 aa  52.4  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1617  GTP-binding protein EngA  27.2 
 
 
460 aa  52  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.28 
 
 
492 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1992  GTP-binding protein EngA  28.18 
 
 
446 aa  51.2  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.916192  normal  0.0223311 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  28.36 
 
 
489 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1403  hypothetical protein  25.57 
 
 
328 aa  50.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0596  GTP-binding protein EngA  30.97 
 
 
467 aa  50.4  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115321  hitchhiker  0.00000000000000451977 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2246  small GTP-binding protein  30.48 
 
 
496 aa  50.1  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1080  small GTP-binding protein  32.04 
 
 
484 aa  49.7  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  31.91 
 
 
529 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1153  hypothetical protein  26.6 
 
 
614 aa  49.3  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.9167  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1572  GTP-binding protein EngA  27.38 
 
 
460 aa  49.3  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0686  GTP-binding protein EngA  23.72 
 
 
473 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2089  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.15 
 
 
637 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000643797  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0887  GTP-binding protein Era  31.43 
 
 
311 aa  48.9  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1436  small GTP-binding protein  27.48 
 
 
479 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741449  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0121  GTP-binding protein EngA  25.74 
 
 
452 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1407  small GTP-binding protein  27.48 
 
 
479 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0656  GTP-binding protein EngA  23.72 
 
 
480 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0668  GTP-binding protein EngA  29.09 
 
 
454 aa  48.1  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0118  GTP-binding protein EngA  25.74 
 
 
452 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.132129 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2082  GTP-binding protein Era  30.77 
 
 
313 aa  48.5  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.592415  normal  0.853182 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05518  GTP binding protein (EngB), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13010)  35.94 
 
 
332 aa  47.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.115998 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5109  GTP-binding protein EngA  28.57 
 
 
445 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314704  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1390  GTP-binding protein EngA  27.42 
 
 
443 aa  47.8  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6271  GTP-binding protein EngA  28.57 
 
 
445 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2191  GTP-binding protein EngA  29 
 
 
447 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1808  GTP-binding protein EngA  28.57 
 
 
445 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0793  GTP-binding protein Era  30.77 
 
 
297 aa  48.1  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.998663  normal  0.0560127 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3622  tRNA modification GTPase TrmE  30.63 
 
 
456 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3828  GTP-binding protein Era  24.18 
 
 
305 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1832  GTP-binding protein EngA  28.57 
 
 
445 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1329  GTP-binding protein EngA  27.42 
 
 
443 aa  47.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  26.09 
 
 
440 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1224  ribosome-associated GTPase EngA  25.4 
 
 
447 aa  47.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  23.3 
 
 
438 aa  47.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0435  GTP-binding protein EngA  26.19 
 
 
460 aa  47.4  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1064  GTP-binding protein Era  38.1 
 
 
303 aa  47.4  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2178  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.17 
 
 
431 aa  47.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.995116  normal  0.41065 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0409  GTP-binding protein EngA  26.19 
 
 
460 aa  47.4  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30716  nuclear/nucleolar GTP-binding protein 2  32.43 
 
 
534 aa  47.4  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0409155  normal  0.593065 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1348  GTP-binding protein EngA  24.3 
 
 
439 aa  47  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.124719  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.09 
 
 
440 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1042  GTP-binding protein Era  26.97 
 
 
297 aa  47  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1210  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.65 
 
 
529 aa  47  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0191  tRNA modification GTPase TrmE  23.93 
 
 
460 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.377202  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0536  GTP-binding protein EngA  32.79 
 
 
461 aa  47  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1350  putative ABC transporter  27.56 
 
 
524 aa  46.6  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.43815  hitchhiker  0.000106139 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2380  GTP-binding protein, HSR1-related  25.4 
 
 
635 aa  47  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1746  GTP-binding protein EngA  28.57 
 
 
445 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0929  hypothetical protein  26.7 
 
 
518 aa  47  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1234  GTP-binding protein EngA  27.03 
 
 
444 aa  47  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05640  conserved hypothetical protein  30.59 
 
 
717 aa  46.6  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02977  GTP-binding protein EngA  27.03 
 
 
481 aa  46.6  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4509  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.68 
 
 
457 aa  46.6  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1719  GTP-binding protein EngA  28.57 
 
 
445 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.576586 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0885  GTP-binding protein EngA  25 
 
 
452 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1268  GTP-binding protein Era  35 
 
 
287 aa  46.6  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17220  GTP-binding protein Era  28.71 
 
 
313 aa  46.6  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00402768  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0292  GTP-binding protein EngA  26.13 
 
 
494 aa  46.2  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  27.27 
 
 
506 aa  46.2  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1598  GTP-binding protein EngA  28.57 
 
 
445 aa  46.2  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111864  normal  0.122269 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1758  small GTP-binding protein  28.44 
 
 
448 aa  46.2  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2522  putative ABC transporter  25 
 
 
539 aa  46.2  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.504723  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1428  GTP-binding protein EngA  28.04 
 
 
447 aa  46.2  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0495777  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0320  small GTP-binding protein  30.91 
 
 
197 aa  46.2  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  27.45 
 
 
298 aa  45.8  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3005  GTP-binding protein EngA  23.85 
 
 
490 aa  45.8  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.198767  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  28.3 
 
 
314 aa  45.8  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  28.3 
 
 
314 aa  45.8  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0656  GTP-binding protein HSR1-related protein  32.12 
 
 
512 aa  45.8  0.0009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.53051  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  27.88 
 
 
531 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1349  GTP-binding protein Era  22.39 
 
 
339 aa  45.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2350  GTP-binding protein EngA  27.68 
 
 
445 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2604  GTP-binding protein EngA  27.03 
 
 
447 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156486  normal  0.601696 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>