37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_10501 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_10501  hypothetical protein  100 
 
 
452 aa  912    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.546761  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0036  hypothetical protein  52.41 
 
 
451 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06561  hypothetical protein  51.58 
 
 
451 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0586116  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18671  hypothetical protein  53.65 
 
 
454 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0942  hypothetical protein  45.65 
 
 
409 aa  363  2e-99  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1041  hypothetical protein  46.1 
 
 
427 aa  353  2.9999999999999997e-96  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06651  hypothetical protein  36.34 
 
 
441 aa  306  6e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.19344  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06261  hypothetical protein  35.96 
 
 
444 aa  305  8.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.307417  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06561  hypothetical protein  35.47 
 
 
444 aa  303  6.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0600  hypothetical protein  34.21 
 
 
444 aa  298  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0993  hypothetical protein  36.84 
 
 
459 aa  100  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.455493 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0765  hypothetical protein  32.95 
 
 
472 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  30.53 
 
 
529 aa  83.2  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1904  GTP-binding protein, HSR1-related  32.8 
 
 
545 aa  81.6  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30473  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  31.3 
 
 
506 aa  80.5  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4459  small GTP-binding protein  30.06 
 
 
520 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859915  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1544  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.3 
 
 
517 aa  80.5  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  28.99 
 
 
531 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  28.99 
 
 
531 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3840  hypothetical protein  29.39 
 
 
492 aa  79.7  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.693476 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1709  small GTP-binding protein domain-containing protein  33.91 
 
 
513 aa  79.7  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000711006  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4193  hypothetical protein  35.25 
 
 
471 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.296514 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2527  hypothetical protein  27.85 
 
 
463 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3579  hypothetical protein  27.22 
 
 
463 aa  73.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0732  hypothetical protein  24.09 
 
 
481 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00108673  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2529  hypothetical protein  33.72 
 
 
475 aa  63.9  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1260  hypothetical protein  31.95 
 
 
529 aa  61.2  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16501  GTPase SAR1 and related small G proteins  24.9 
 
 
532 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.569133 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09451  GTPase SAR1  30 
 
 
499 aa  57  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1210  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.16 
 
 
529 aa  55.5  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09441  GTPase SAR1 and related small G protein  28.95 
 
 
499 aa  53.9  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10221  GTPase SAR1 and related small G protein  24.86 
 
 
516 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.524471  normal  0.183753 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09991  GTPase SAR1 and related small G proteins  24.35 
 
 
496 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07771  GTPase SAR1 and related small G proteins  24.77 
 
 
517 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0362439 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0145  small GTP-binding protein domain-containing protein  24.77 
 
 
517 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0884  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.27 
 
 
499 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102699  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1715  hypothetical protein  31.17 
 
 
192 aa  43.9  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691695  normal  0.639266 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>