60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3840 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3840  hypothetical protein  100 
 
 
492 aa  981    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.693476 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0732  hypothetical protein  44.87 
 
 
481 aa  388  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00108673  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4193  hypothetical protein  42 
 
 
471 aa  359  6e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.296514 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2529  hypothetical protein  41.15 
 
 
475 aa  340  2.9999999999999998e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2527  hypothetical protein  40.33 
 
 
463 aa  336  7e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3579  hypothetical protein  40.33 
 
 
463 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0765  hypothetical protein  41.78 
 
 
472 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1904  GTP-binding protein, HSR1-related  31.54 
 
 
545 aa  184  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30473  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1544  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.73 
 
 
517 aa  177  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  28.09 
 
 
529 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  28.82 
 
 
531 aa  171  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  28.33 
 
 
531 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  26.9 
 
 
506 aa  167  4e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1709  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.88 
 
 
513 aa  162  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000711006  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4459  small GTP-binding protein  29.17 
 
 
520 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859915  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0993  hypothetical protein  30.17 
 
 
459 aa  157  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.455493 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1210  small GTP-binding protein domain-containing protein  25.97 
 
 
529 aa  154  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1260  hypothetical protein  26.04 
 
 
529 aa  152  8.999999999999999e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07771  GTPase SAR1 and related small G proteins  24.23 
 
 
517 aa  137  5e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0362439 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0145  small GTP-binding protein domain-containing protein  24.23 
 
 
517 aa  137  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16501  GTPase SAR1 and related small G proteins  22.91 
 
 
532 aa  136  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.569133 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10221  GTPase SAR1 and related small G protein  24.75 
 
 
516 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.524471  normal  0.183753 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09451  GTPase SAR1  24.71 
 
 
499 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09441  GTPase SAR1 and related small G protein  24.21 
 
 
499 aa  111  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09991  GTPase SAR1 and related small G proteins  22.48 
 
 
496 aa  109  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0884  small GTP-binding protein domain-containing protein  24.25 
 
 
499 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102699  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2393  small GTP-binding protein  35.23 
 
 
448 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1041  hypothetical protein  29.63 
 
 
427 aa  94  5e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2342  small GTP-binding protein  34.2 
 
 
448 aa  94.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18671  hypothetical protein  28.95 
 
 
454 aa  94  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0036  hypothetical protein  33.94 
 
 
451 aa  90.1  7e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0942  hypothetical protein  29.31 
 
 
409 aa  90.5  7e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06561  hypothetical protein  37.3 
 
 
451 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0586116  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  32.8 
 
 
489 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1616  small GTP-binding protein  25.64 
 
 
453 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206677 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3709  small GTP-binding protein  26.43 
 
 
462 aa  80.5  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10501  hypothetical protein  29.39 
 
 
452 aa  80.1  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.546761  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4509  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.83 
 
 
457 aa  78.2  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  23.72 
 
 
440 aa  75.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1407  small GTP-binding protein  28.57 
 
 
479 aa  73.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1436  small GTP-binding protein  28.57 
 
 
479 aa  73.9  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741449  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06261  hypothetical protein  27.33 
 
 
444 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.307417  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  23.4 
 
 
440 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3839  small GTP-binding protein  26.6 
 
 
481 aa  72.8  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.674432 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06561  hypothetical protein  26.95 
 
 
444 aa  72.4  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0764  GTP-binding protein HSR1-related  26.54 
 
 
469 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0600  hypothetical protein  30.83 
 
 
444 aa  70.9  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0499  small GTP-binding protein  26.1 
 
 
475 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362987  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04921  GTPase SAR1  23.1 
 
 
441 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06651  hypothetical protein  29.17 
 
 
441 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.19344  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.89 
 
 
492 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1080  small GTP-binding protein  27.19 
 
 
484 aa  67  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2178  small GTP-binding protein domain-containing protein  25.95 
 
 
431 aa  66.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.995116  normal  0.41065 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  24.48 
 
 
440 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  25.4 
 
 
566 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0497  GTPase  22.46 
 
 
420 aa  60.5  0.00000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  24.29 
 
 
472 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16461  GTPase SAR1  23.44 
 
 
413 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16341  GTPase SAR1 and related small G protein  24.11 
 
 
413 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1537  small GTP-binding protein domain-containing protein  23.85 
 
 
413 aa  44.3  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>