248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0975 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  100 
 
 		 440 aa  890    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  97.95 
 
 		 440 aa  837    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  46.14 
 
 		 440 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04921  GTPase SAR1  43.16 
 
 		 441 aa  352  8.999999999999999e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0497  GTPase  40.51 
 
 		 420 aa  311  1e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16231  GTPase SAR1 and related small G proteins  39.47 
 
 		 413 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.283634  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16461  GTPase SAR1  37.47 
 
 		 413 aa  265  2e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2178  small GTP-binding protein domain-containing protein  40 
 
 		 431 aa  263  3e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.995116  normal  0.41065 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1537  small GTP-binding protein domain-containing protein  35.84 
 
 		 413 aa  257  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16341  GTPase SAR1 and related small G protein  34.34 
 
 		 413 aa  245  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  34.03 
 
 		 472 aa  205  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0499  small GTP-binding protein  30.64 
 
 		 475 aa  198  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362987  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1407  small GTP-binding protein  30 
 
 		 479 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1436  small GTP-binding protein  30 
 
 		 479 aa  192  8e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  29.88 
 
 		 566 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.78 
 
 		 492 aa  186  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1080  small GTP-binding protein  27.91 
 
 		 484 aa  183  6e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  29.09 
 
 		 489 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3709  small GTP-binding protein  31.4 
 
 		 462 aa  155  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1616  small GTP-binding protein  28.13 
 
 		 453 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206677 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2342  small GTP-binding protein  31.89 
 
 		 448 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2393  small GTP-binding protein  31.89 
 
 		 448 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4509  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.16 
 
 		 457 aa  147  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0764  GTP-binding protein HSR1-related  29.24 
 
 		 469 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3839  small GTP-binding protein  29.24 
 
 		 481 aa  138  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.674432 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  23.91 
 
 		 506 aa  107  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1544  small GTP-binding protein domain-containing protein  24.68 
 
 		 517 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1709  small GTP-binding protein domain-containing protein  24.18 
 
 		 513 aa  105  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000711006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09451  GTPase SAR1  28.36 
 
 		 499 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  23.93 
 
 		 531 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10221  GTPase SAR1 and related small G protein  26.37 
 
 		 516 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.524471  normal  0.183753 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  23.57 
 
 		 531 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1260  hypothetical protein  26.03 
 
 		 529 aa  102  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1210  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.78 
 
 		 529 aa  101  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09441  GTPase SAR1 and related small G protein  26.99 
 
 		 499 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  22.96 
 
 		 529 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0884  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.11 
 
 		 499 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102699  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4459  small GTP-binding protein  23.05 
 
 		 520 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16501  GTPase SAR1 and related small G proteins  25.16 
 
 		 532 aa  96.3  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.569133 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1904  GTP-binding protein, HSR1-related  23.79 
 
 		 545 aa  85.9  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09991  GTPase SAR1 and related small G proteins  25.57 
 
 		 496 aa  84  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0145  small GTP-binding protein domain-containing protein  25 
 
 		 517 aa  83.2  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07771  GTPase SAR1 and related small G proteins  24.3 
 
 		 517 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0362439 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0765  hypothetical protein  22.61 
 
 		 472 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3840  hypothetical protein  23.4 
 
 		 492 aa  73.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.693476 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2527  hypothetical protein  23.08 
 
 		 463 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4193  hypothetical protein  23.48 
 
 		 471 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.296514 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3579  hypothetical protein  23.24 
 
 		 463 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  33.73 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0732  hypothetical protein  22.03 
 
 		 481 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00108673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  29.58 
 
 		 291 aa  57  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2529  hypothetical protein  19.25 
 
 		 475 aa  55.8  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3137  GTP-binding protein HSR1-related  28.48 
 
 		 295 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2380  GTP-binding protein, HSR1-related  28.12 
 
 		 635 aa  53.9  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2246  small GTP-binding protein  33.07 
 
 		 496 aa  53.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2882  GTP-binding protein HSR1-related  25.15 
 
 		 291 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1393  putative GTPase  27.27 
 
 		 290 aa  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3346  putative GTPase  27.27 
 
 		 290 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2138  putative GTPase  27.27 
 
 		 290 aa  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2251  putative GTPase  27.27 
 
 		 290 aa  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.796861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1744  GTP-binding protein Era  29.84 
 
 		 314 aa  52.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000728906  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0374  GTP-binding protein EngA  33.33 
 
 		 473 aa  52  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4891  putative GTPase  27.27 
 
 		 290 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04795  GTP-binding protein EngA  31.75 
 
 		 434 aa  51.2  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1388  GTP-binding protein HSR1-related protein  25.15 
 
 		 291 aa  51.6  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3926  GTP-binding protein  25.12 
 
 		 394 aa  51.2  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3433  GTP-binding protein HSR1-related  27.81 
 
 		 291 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  21.86 
 
 		 1219 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4307  GTP-binding protein HSR1-related  28.29 
 
 		 650 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0916  small GTP-binding protein  29.69 
 
 		 439 aa  50.8  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.704291  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1231  GTP-binding proten HflX  31.11 
 
 		 370 aa  50.4  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1043  GTP-binding protein HSR1-related protein  31.37 
 
 		 287 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3353  GTP-binding protein HSR1-related protein  28.68 
 
 		 287 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2169  GTP-binding protein Era  26.11 
 
 		 299 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0368513  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  20.96 
 
 		 1219 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1369  GTP-binding protein EngA  30.16 
 
 		 434 aa  49.3  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.911808  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3202  putative GTPase  30 
 
 		 294 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  24.46 
 
 		 300 aa  49.7  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  21 
 
 		 1219 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  21 
 
 		 1219 aa  48.9  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  21 
 
 		 1219 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  21.46 
 
 		 1219 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  30.58 
 
 		 302 aa  48.9  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  22.41 
 
 		 1219 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0655  GTP-binding protein Era  27.27 
 
 		 299 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  21 
 
 		 1219 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1172  small GTP-binding protein  28.35 
 
 		 438 aa  48.5  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1135  GTP-binding protein Era  27.27 
 
 		 299 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0705  small GTP-binding protein  24.27 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.131335  hitchhiker  0.000692522 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0536  GTP-binding protein EngA  31.11 
 
 		 461 aa  49.3  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0651  putative GTP-binding protein  25.95 
 
 		 312 aa  48.9  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.181354  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  22.41 
 
 		 1219 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0544  GTP-binding protein Era  25.48 
 
 		 299 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.439886  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2894  GTP-binding protein Era  25.48 
 
 		 299 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1093  GTP-binding protein Era  27.27 
 
 		 287 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0165  small GTP-binding protein  27.81 
 
 		 427 aa  48.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2465  GTP-binding protein Era  25.48 
 
 		 311 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2816  GTP-binding protein Era  25.48 
 
 		 299 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.989072  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2778  GTP-binding protein Era  25.48 
 
 		 299 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2839  GTP-binding protein Era  25.48 
 
 		 299 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>