275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5212 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1407  small GTP-binding protein  73.4 
 
 
479 aa  688    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1436  small GTP-binding protein  73.4 
 
 
479 aa  688    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741449  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  100 
 
 
489 aa  994    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  62.89 
 
 
492 aa  613  9.999999999999999e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1080  small GTP-binding protein  64.23 
 
 
484 aa  613  9.999999999999999e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0499  small GTP-binding protein  62.58 
 
 
475 aa  588  1e-167  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362987  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  64.3 
 
 
566 aa  580  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  49.15 
 
 
472 aa  441  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1616  small GTP-binding protein  40.22 
 
 
453 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206677 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3709  small GTP-binding protein  41.48 
 
 
462 aa  322  7e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4509  small GTP-binding protein domain-containing protein  42.82 
 
 
457 aa  313  5.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2342  small GTP-binding protein  37.39 
 
 
448 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2393  small GTP-binding protein  37.39 
 
 
448 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3839  small GTP-binding protein  37.15 
 
 
481 aa  290  5.0000000000000004e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.674432 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0764  GTP-binding protein HSR1-related  32.69 
 
 
469 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0497  GTPase  35.1 
 
 
420 aa  193  7e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  33.42 
 
 
440 aa  186  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.12 
 
 
440 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  29.12 
 
 
440 aa  179  9e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2178  small GTP-binding protein domain-containing protein  34.32 
 
 
431 aa  171  3e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.995116  normal  0.41065 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16231  GTPase SAR1 and related small G proteins  28.19 
 
 
413 aa  156  9e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.283634  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04921  GTPase SAR1  33.6 
 
 
441 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1537  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.89 
 
 
413 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  28.15 
 
 
531 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  27.7 
 
 
531 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16341  GTPase SAR1 and related small G protein  27.79 
 
 
413 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16461  GTPase SAR1  25.65 
 
 
413 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1709  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.93 
 
 
513 aa  141  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000711006  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4459  small GTP-binding protein  29.19 
 
 
520 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859915  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  27.44 
 
 
529 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0145  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.64 
 
 
517 aa  127  5e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16501  GTPase SAR1 and related small G proteins  26.76 
 
 
532 aa  127  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.569133 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07771  GTPase SAR1 and related small G proteins  26.64 
 
 
517 aa  126  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0362439 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  27.42 
 
 
506 aa  125  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1544  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.39 
 
 
517 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10221  GTPase SAR1 and related small G protein  24.06 
 
 
516 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.524471  normal  0.183753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1904  GTP-binding protein, HSR1-related  27.75 
 
 
545 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30473  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1210  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.47 
 
 
529 aa  114  3e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1260  hypothetical protein  25.21 
 
 
529 aa  114  5e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09991  GTPase SAR1 and related small G proteins  26.89 
 
 
496 aa  111  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09441  GTPase SAR1 and related small G protein  27.4 
 
 
499 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0884  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.67 
 
 
499 aa  107  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102699  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09451  GTPase SAR1  26.97 
 
 
499 aa  106  1e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4193  hypothetical protein  25.48 
 
 
471 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.296514 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0732  hypothetical protein  30.52 
 
 
481 aa  91.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00108673  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0765  hypothetical protein  27.96 
 
 
472 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3840  hypothetical protein  32.8 
 
 
492 aa  84.3  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.693476 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2529  hypothetical protein  25.07 
 
 
475 aa  77.8  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2527  hypothetical protein  27.62 
 
 
463 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3579  hypothetical protein  26.36 
 
 
463 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  30.72 
 
 
548 aa  63.5  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  26.85 
 
 
583 aa  60.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  30.26 
 
 
546 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4121  GTP-binding protein Era  33.11 
 
 
305 aa  58.9  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.383616  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  31.69 
 
 
302 aa  58.9  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0146  small GTP-binding protein  32.64 
 
 
398 aa  57  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0325934  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1387  GTP-binding protein Era  33.8 
 
 
308 aa  56.6  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.263237  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3902  GTP-binding protein HSR1-related  41.27 
 
 
829 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12168  normal  0.150325 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3852  GTP-binding protein HSR1-related  41.27 
 
 
1415 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0683  small GTP-binding protein  29.56 
 
 
408 aa  54.3  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00203334  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4797  putative GTPase  29.21 
 
 
294 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3402  putative GTPase  29.21 
 
 
294 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2152  small GTP-binding protein  30.66 
 
 
409 aa  54.3  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  31.41 
 
 
298 aa  53.9  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0359  GTP-binding protein EngA  33.56 
 
 
436 aa  53.5  0.000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1064  GTP-binding protein Era  30.97 
 
 
303 aa  53.1  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  27.57 
 
 
614 aa  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3202  putative GTPase  32.38 
 
 
294 aa  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  29.87 
 
 
301 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  30.71 
 
 
301 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  29.87 
 
 
301 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  29.87 
 
 
301 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  29.87 
 
 
301 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  29.87 
 
 
301 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  29.07 
 
 
587 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  26.32 
 
 
551 aa  52.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  27.32 
 
 
398 aa  52.8  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1243  small GTP-binding protein  30.99 
 
 
425 aa  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  29.87 
 
 
301 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3103  small GTP-binding protein  30.08 
 
 
396 aa  52.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  24.89 
 
 
605 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  29.87 
 
 
301 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0876  tRNA modification GTPase TrmE  24.14 
 
 
518 aa  51.6  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  30.71 
 
 
301 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02997  GTP-binding protein Era  28.82 
 
 
314 aa  51.6  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249422  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2524  GTP-binding protein Era  32.77 
 
 
321 aa  51.6  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00258575  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  30.71 
 
 
301 aa  51.2  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1201  hypothetical protein  27.4 
 
 
455 aa  51.2  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128445 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  30 
 
 
301 aa  51.2  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3346  putative GTPase  27.64 
 
 
290 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2138  putative GTPase  30.89 
 
 
290 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  34.29 
 
 
306 aa  50.8  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0475  small GTP-binding protein  29.51 
 
 
404 aa  50.4  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0490  small GTP-binding protein  29.51 
 
 
404 aa  50.4  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  29.07 
 
 
407 aa  50.4  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  28.65 
 
 
302 aa  50.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  31.06 
 
 
589 aa  50.4  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4685  putative GTPase  28.36 
 
 
294 aa  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1653  small GTP-binding protein Era  28.75 
 
 
310 aa  50.4  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1825  GTP-binding protein Era  27.81 
 
 
309 aa  50.1  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.258712 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>