288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1407 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1407  small GTP-binding protein  100 
 
 		 479 aa  966    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  73.4 
 
 		 489 aa  689    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1436  small GTP-binding protein  99.79 
 
 		 479 aa  964    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741449  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1080  small GTP-binding protein  64.1 
 
 		 484 aa  598  1e-170  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  63.95 
 
 		 492 aa  588  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  65.1 
 
 		 566 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0499  small GTP-binding protein  62.34 
 
 		 475 aa  572  1.0000000000000001e-162  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362987  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  48.37 
 
 		 472 aa  426  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1616  small GTP-binding protein  40 
 
 		 453 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206677 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3709  small GTP-binding protein  42.66 
 
 		 462 aa  321  1.9999999999999998e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4509  small GTP-binding protein domain-containing protein  42.86 
 
 		 457 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2342  small GTP-binding protein  38.04 
 
 		 448 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2393  small GTP-binding protein  38.04 
 
 		 448 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3839  small GTP-binding protein  38.88 
 
 		 481 aa  286  8e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.674432 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0764  GTP-binding protein HSR1-related  33.69 
 
 		 469 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  30 
 
 		 440 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0497  GTPase  35.44 
 
 		 420 aa  187  3e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  29.76 
 
 		 440 aa  187  4e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  33.24 
 
 		 440 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04921  GTPase SAR1  35.33 
 
 		 441 aa  162  9e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2178  small GTP-binding protein domain-containing protein  34.54 
 
 		 431 aa  161  2e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.995116  normal  0.41065 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16231  GTPase SAR1 and related small G proteins  28.54 
 
 		 413 aa  146  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.283634  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16461  GTPase SAR1  26.65 
 
 		 413 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16341  GTPase SAR1 and related small G protein  28.75 
 
 		 413 aa  141  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  30.21 
 
 		 531 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1537  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.08 
 
 		 413 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  29.95 
 
 		 531 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  30.28 
 
 		 506 aa  132  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1544  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.87 
 
 		 517 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07771  GTPase SAR1 and related small G proteins  27.72 
 
 		 517 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0362439 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0145  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.04 
 
 		 517 aa  131  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1709  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.74 
 
 		 513 aa  131  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000711006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4459  small GTP-binding protein  30.79 
 
 		 520 aa  130  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  29.78 
 
 		 529 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1904  GTP-binding protein, HSR1-related  29.12 
 
 		 545 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09991  GTPase SAR1 and related small G proteins  26.11 
 
 		 496 aa  114  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10221  GTPase SAR1 and related small G protein  25.33 
 
 		 516 aa  113  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.524471  normal  0.183753 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16501  GTPase SAR1 and related small G proteins  26.29 
 
 		 532 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.569133 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1260  hypothetical protein  26.04 
 
 		 529 aa  107  4e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1210  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.07 
 
 		 529 aa  107  7e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09441  GTPase SAR1 and related small G protein  25.85 
 
 		 499 aa  95.1  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09451  GTPase SAR1  25.36 
 
 		 499 aa  93.6  7e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0884  small GTP-binding protein domain-containing protein  25.82 
 
 		 499 aa  92.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102699  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0732  hypothetical protein  29.09 
 
 		 481 aa  87  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00108673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4193  hypothetical protein  23.69 
 
 		 471 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.296514 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0765  hypothetical protein  24.73 
 
 		 472 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2529  hypothetical protein  24.69 
 
 		 475 aa  77.8  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3840  hypothetical protein  28.57 
 
 		 492 aa  73.6  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.693476 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2527  hypothetical protein  26.47 
 
 		 463 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3579  hypothetical protein  26.58 
 
 		 463 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  31.58 
 
 		 583 aa  63.2  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  24.65 
 
 		 605 aa  60.1  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  30.29 
 
 		 585 aa  56.2  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  30.47 
 
 		 632 aa  55.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1620  GTP-binding protein EngA  30.61 
 
 		 436 aa  55.5  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  27.5 
 
 		 588 aa  55.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  32.82 
 
 		 548 aa  54.7  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4121  GTP-binding protein Era  32.41 
 
 		 305 aa  55.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.383616  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2316  translation initiation factor IF-2  30.82 
 
 		 1116 aa  54.3  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.100815  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  33.09 
 
 		 302 aa  53.9  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  30.43 
 
 		 438 aa  53.9  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  30.43 
 
 		 438 aa  53.9  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0359  GTP-binding protein EngA  30.14 
 
 		 436 aa  53.1  0.000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3816  translation initiation factor IF-2  31.06 
 
 		 856 aa  52.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134229  normal  0.0174936 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1243  small GTP-binding protein  30.99 
 
 		 425 aa  52.4  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0165  small GTP-binding protein  28.78 
 
 		 427 aa  51.2  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0160  GTP-binding protein Era  31.61 
 
 		 311 aa  51.2  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.709103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  29.59 
 
 		 587 aa  50.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2152  small GTP-binding protein  29.93 
 
 		 409 aa  50.8  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4797  putative GTPase  28.24 
 
 		 294 aa  50.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3402  putative GTPase  28.24 
 
 		 294 aa  50.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3043  translation initiation factor IF-2  30.08 
 
 		 861 aa  50.4  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  27.56 
 
 		 546 aa  50.4  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  30.43 
 
 		 407 aa  50.4  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3852  GTP-binding protein HSR1-related  36.76 
 
 		 1415 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3902  GTP-binding protein HSR1-related  36.76 
 
 		 829 aa  50.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12168  normal  0.150325 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1247  GTP-binding protein Era  31.97 
 
 		 300 aa  50.1  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.734456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2081  small GTP-binding protein  31.85 
 
 		 416 aa  49.7  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000627073  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  31.16 
 
 		 306 aa  50.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  23.19 
 
 		 444 aa  49.7  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0103  GTP-binding protein  28.76 
 
 		 440 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000228129  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0106  GTP-binding protein  29.41 
 
 		 440 aa  50.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  29.58 
 
 		 303 aa  50.1  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1387  GTP-binding protein Era  26.58 
 
 		 308 aa  49.7  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.263237  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4307  GTP-binding protein HSR1-related  27.11 
 
 		 650 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  28.48 
 
 		 441 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13281  GTP-binding protein Era-like protein  29.71 
 
 		 314 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.593826 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0146  small GTP-binding protein  32.35 
 
 		 398 aa  48.9  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0325934  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  31.06 
 
 		 589 aa  48.9  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1277  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.41 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.038791  hitchhiker  0.00000385407 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3202  putative GTPase  28.79 
 
 		 294 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0916  small GTP-binding protein  28.38 
 
 		 439 aa  49.3  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.704291  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0683  small GTP-binding protein  27.27 
 
 		 408 aa  49.3  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00203334  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0231  translation initiation factor IF-2  28.68 
 
 		 883 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0340219  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1536  GTP-binding protein TypA  26.11 
 
 		 608 aa  48.9  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00994584  normal  0.0110769 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  28.26 
 
 		 302 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1426  translation initiation factor IF-2  25.65 
 
 		 954 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000203462 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1806  GTP-binding protein Era  29.05 
 
 		 297 aa  48.5  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0584484  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3331  translation initiation factor IF-2  26.97 
 
 		 992 aa  48.5  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.285011  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  29.2 
 
 		 887 aa  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206324 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>