135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4307 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2089  small GTP-binding protein domain-containing protein  68.27 
 
 		 637 aa  880    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000643797  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2380  GTP-binding protein, HSR1-related  64.34 
 
 		 635 aa  827    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4307  GTP-binding protein HSR1-related  100 
 
 		 650 aa  1306    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4767  GTP-binding protein HSR1-related  55.2 
 
 		 629 aa  690    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.049365  hitchhiker  0.000697216 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1153  hypothetical protein  42.06 
 
 		 614 aa  447  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.9167  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4133  GTP-binding protein HSR1-related protein  27.33 
 
 		 840 aa  105  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0656  GTP-binding protein HSR1-related protein  28.4 
 
 		 512 aa  103  7e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.53051  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2152  GTP-binding protein, HSR1-related  26.17 
 
 		 523 aa  85.9  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1599  GTP-binding protein, HSR1-related  24.94 
 
 		 500 aa  80.5  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1388  GTP-binding protein HSR1-related protein  27.69 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  29.07 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2138  putative GTPase  34.48 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2251  putative GTPase  34.48 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.796861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2882  GTP-binding protein HSR1-related  29.88 
 
 		 291 aa  60.5  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3346  putative GTPase  34.48 
 
 		 290 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4891  putative GTPase  34.48 
 
 		 290 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1393  putative GTPase  34.48 
 
 		 290 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1077  Miro domain protein  28.81 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3433  GTP-binding protein HSR1-related  29.56 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0670  GTP-binding protein  36.05 
 
 		 355 aa  57  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.417298  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1003  translation initiation factor IF-2  27.31 
 
 		 853 aa  57  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1043  GTP-binding protein HSR1-related protein  34.09 
 
 		 287 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2482  hypothetical protein  30.92 
 
 		 409 aa  55.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0321451  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2490  translation initiation factor IF-2  22.96 
 
 		 875 aa  55.5  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.547741  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1071  putative GTPase  32.84 
 
 		 290 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0467468 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3137  GTP-binding protein HSR1-related  31.62 
 
 		 295 aa  54.3  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0930  GTP-binding protein HSR1-related  34.09 
 
 		 288 aa  53.5  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.518572  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1403  hypothetical protein  43.75 
 
 		 328 aa  53.1  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3353  GTP-binding protein HSR1-related protein  35.16 
 
 		 287 aa  52  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16461  GTPase SAR1  24.57 
 
 		 413 aa  52.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  28.29 
 
 		 440 aa  51.2  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1537  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.21 
 
 		 413 aa  51.2  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.04 
 
 		 440 aa  50.8  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  28.57 
 
 		 440 aa  50.8  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3506  TPR repeat-containing protein  24.38 
 
 		 927 aa  50.4  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0255227  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3805  hypothetical protein  24.38 
 
 		 927 aa  50.4  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.206657  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3609  hypothetical protein  24.38 
 
 		 927 aa  50.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3518  TPR repeat-containing protein  24.38 
 
 		 927 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04860  septin ring protein, putative  40.74 
 
 		 322 aa  50.1  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3896  hypothetical protein  24.38 
 
 		 927 aa  50.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16341  GTPase SAR1 and related small G protein  24.82 
 
 		 413 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0657  hypothetical protein  27.16 
 
 		 411 aa  50.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3777  hypothetical protein  24.38 
 
 		 927 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148359 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3865  hypothetical protein  23.12 
 
 		 927 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1433  hypothetical protein  23.12 
 
 		 927 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.219985 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1436  small GTP-binding protein  27.11 
 
 		 479 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  25.62 
 
 		 922 aa  48.5  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0497  GTPase  31.85 
 
 		 420 aa  48.9  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1407  small GTP-binding protein  27.11 
 
 		 479 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  26.22 
 
 		 907 aa  48.5  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  27.87 
 
 		 679 aa  48.5  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  27.87 
 
 		 679 aa  48.5  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2751  GTP-binding protein, HSR1-related  48.28 
 
 		 549 aa  48.5  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.859645  normal  0.205011 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2283  GTP-binding proten HflX  31.2 
 
 		 549 aa  48.1  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3952  GTP-binding protein HSR1-related  27.45 
 
 		 202 aa  48.5  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  26.8 
 
 		 964 aa  48.1  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  26.8 
 
 		 964 aa  48.1  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2758  GTP-binding protein Era  28.93 
 
 		 318 aa  47.8  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0588408  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3816  translation initiation factor IF-2  23.97 
 
 		 856 aa  47.4  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134229  normal  0.0174936 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5592  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  31.37 
 
 		 198 aa  47.4  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.352235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1193  GTPase  29.63 
 
 		 428 aa  47  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.346231  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0821  translation initiation factor IF-2  24.44 
 
 		 831 aa  47  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.175155  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1948  translation initiation factor IF-2  26.52 
 
 		 883 aa  47  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0536071 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  24.19 
 
 		 949 aa  46.6  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04921  GTPase SAR1  34.21 
 
 		 441 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3727  translation initiation factor IF-2  22.97 
 
 		 971 aa  47  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.057525 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  32.03 
 
 		 546 aa  46.6  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  25.49 
 
 		 964 aa  46.2  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0376  GTP-binding protein HflX  33.61 
 
 		 490 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  27.34 
 
 		 442 aa  46.2  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  25.16 
 
 		 943 aa  45.8  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  28.41 
 
 		 437 aa  46.2  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  25.62 
 
 		 887 aa  46.2  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1298  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  25 
 
 		 205 aa  46.2  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.034569  normal  0.192806 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3641  tRNA modification GTPase TrmE  34.11 
 
 		 460 aa  46.2  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0555  translation initiation factor IF-2  24.59 
 
 		 875 aa  46.6  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.218131  normal  0.382755 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2923  translation initiation factor IF-2  23.97 
 
 		 989 aa  45.8  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.707465  normal  0.0820286 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0391  translation initiation factor IF-2  24.59 
 
 		 875 aa  46.6  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1247  translation initiation factor IF-2  25.16 
 
 		 943 aa  45.8  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0182707  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  23.97 
 
 		 984 aa  45.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.73 
 
 		 472 aa  45.8  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  26.98 
 
 		 876 aa  45.8  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0631  translation initiation factor IF2-2  24.81 
 
 		 880 aa  45.4  0.003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  26.9 
 
 		 948 aa  45.8  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39888  predicted protein  31.97 
 
 		 374 aa  45.4  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.564657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1027  translation initiation factor IF-2  25.16 
 
 		 854 aa  45.8  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  24.26 
 
 		 895 aa  45.4  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2697  translation initiation factor IF-2  23.97 
 
 		 989 aa  45.8  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.769823 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0033  translation initiation factor IF-2  26.4 
 
 		 1045 aa  45.8  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1227  GTP-binding protein HSR1-related  38.98 
 
 		 279 aa  45.4  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.240539  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2414  translation initiation factor IF-2  23.57 
 
 		 940 aa  45.8  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3241  GTP-binding proten HflX  28.06 
 
 		 447 aa  45.8  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  24.79 
 
 		 997 aa  45.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01394  Putative uncharacterized proteinSeptin ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C1M1]  38.55 
 
 		 342 aa  45.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  26.15 
 
 		 979 aa  45.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1160  GTP-binding protein EngA  27.32 
 
 		 439 aa  45.4  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0769833  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  24.79 
 
 		 887 aa  45.4  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2393  small GTP-binding protein  24.32 
 
 		 448 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5015  GTP-binding protein EngA  33.33 
 
 		 448 aa  45.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  29.03 
 
 		 441 aa  45.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>