118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_16501 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1260  hypothetical protein  66 
 
 		 529 aa  660    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1210  small GTP-binding protein domain-containing protein  62.78 
 
 		 529 aa  651    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16501  GTPase SAR1 and related small G proteins  100 
 
 		 532 aa  1058    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.569133 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10221  GTPase SAR1 and related small G protein  59.39 
 
 		 516 aa  606  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.524471  normal  0.183753 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07771  GTPase SAR1 and related small G proteins  50 
 
 		 517 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0362439 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0145  small GTP-binding protein domain-containing protein  50.21 
 
 		 517 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1544  small GTP-binding protein domain-containing protein  50.84 
 
 		 517 aa  437  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  48.99 
 
 		 506 aa  436  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  45.61 
 
 		 529 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1709  small GTP-binding protein domain-containing protein  52.86 
 
 		 513 aa  426  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000711006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  47.03 
 
 		 531 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  47.03 
 
 		 531 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4459  small GTP-binding protein  46.24 
 
 		 520 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1904  GTP-binding protein, HSR1-related  44.24 
 
 		 545 aa  387  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09991  GTPase SAR1 and related small G proteins  36.26 
 
 		 496 aa  342  7e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09441  GTPase SAR1 and related small G protein  35.56 
 
 		 499 aa  342  1e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09451  GTPase SAR1  36.47 
 
 		 499 aa  336  7e-91  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0884  small GTP-binding protein domain-containing protein  34.17 
 
 		 499 aa  320  3e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102699  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4193  hypothetical protein  26.48 
 
 		 471 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.296514 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.65 
 
 		 472 aa  137  5e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0765  hypothetical protein  26.56 
 
 		 472 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3840  hypothetical protein  22.91 
 
 		 492 aa  131  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.693476 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1616  small GTP-binding protein  27.93 
 
 		 453 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206677 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2529  hypothetical protein  27.43 
 
 		 475 aa  127  5e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0732  hypothetical protein  23.87 
 
 		 481 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00108673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  26.67 
 
 		 489 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2342  small GTP-binding protein  25.11 
 
 		 448 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2393  small GTP-binding protein  25.11 
 
 		 448 aa  120  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2527  hypothetical protein  24.12 
 
 		 463 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3579  hypothetical protein  23.9 
 
 		 463 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  26.94 
 
 		 566 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0499  small GTP-binding protein  28.5 
 
 		 475 aa  114  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362987  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3709  small GTP-binding protein  26.84 
 
 		 462 aa  114  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0764  GTP-binding protein HSR1-related  27.03 
 
 		 469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.13 
 
 		 492 aa  111  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1080  small GTP-binding protein  27.04 
 
 		 484 aa  111  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1407  small GTP-binding protein  26.29 
 
 		 479 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1436  small GTP-binding protein  26.29 
 
 		 479 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0497  GTPase  31.31 
 
 		 420 aa  107  4e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3839  small GTP-binding protein  25.47 
 
 		 481 aa  103  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.674432 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2178  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.23 
 
 		 431 aa  103  9e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.995116  normal  0.41065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4509  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.47 
 
 		 457 aa  97.1  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  25.16 
 
 		 440 aa  97.1  8e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  30.33 
 
 		 440 aa  97.1  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  24.17 
 
 		 440 aa  93.2  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16461  GTPase SAR1  21.25 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0993  hypothetical protein  28.68 
 
 		 459 aa  80.9  0.00000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.455493 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04921  GTPase SAR1  32.19 
 
 		 441 aa  78.2  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16341  GTPase SAR1 and related small G protein  21.33 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16231  GTPase SAR1 and related small G proteins  24.91 
 
 		 413 aa  72  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.283634  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06561  hypothetical protein  24.47 
 
 		 451 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0586116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0036  hypothetical protein  24.11 
 
 		 451 aa  65.1  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1537  small GTP-binding protein domain-containing protein  23.18 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  30.04 
 
 		 585 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1041  hypothetical protein  29.27 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0475  small GTP-binding protein  31.65 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0490  small GTP-binding protein  31.65 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0942  hypothetical protein  27.87 
 
 		 409 aa  57.8  0.0000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10501  hypothetical protein  24.9 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.546761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18671  hypothetical protein  34.82 
 
 		 454 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  28.24 
 
 		 398 aa  55.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1277  small GTP-binding protein domain-containing protein  34.59 
 
 		 405 aa  55.1  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.038791  hitchhiker  0.00000385407 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0042  small GTP-binding protein  30.16 
 
 		 400 aa  55.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0600  hypothetical protein  26 
 
 		 444 aa  52.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0683  small GTP-binding protein  29.93 
 
 		 408 aa  52.4  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00203334  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0318  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.34 
 
 		 402 aa  51.6  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  28.98 
 
 		 460 aa  52  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1851  GTP-binding protein Era  30.92 
 
 		 309 aa  50.8  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06561  hypothetical protein  21.09 
 
 		 444 aa  50.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06261  hypothetical protein  21.09 
 
 		 444 aa  50.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.307417  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1361  small GTP-binding protein  28.1 
 
 		 396 aa  50.8  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.311924  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16490  iron-only hydrogenase maturation protein HydF  33.88 
 
 		 416 aa  50.4  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.520712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  37.7 
 
 		 449 aa  50.4  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1715  hypothetical protein  34.86 
 
 		 192 aa  50.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691695  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0799  GTP-binding protein EngA  24.44 
 
 		 436 aa  50.1  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.940642  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06651  hypothetical protein  19.9 
 
 		 441 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.19344  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  30.77 
 
 		 546 aa  49.7  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  29.36 
 
 		 583 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14190  uncharacterized protein associated with GTPases  28 
 
 		 401 aa  49.3  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03489  tRNA modification GTPase TrmE  31.14 
 
 		 446 aa  49.3  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6543  GTP-binding protein Era  29.68 
 
 		 289 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  30.29 
 
 		 548 aa  48.5  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1806  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 		 297 aa  48.5  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0584484  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  37.19 
 
 		 451 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0165  small GTP-binding protein  31.82 
 
 		 427 aa  48.5  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0089  tRNA modification GTPase TrmE  29.68 
 
 		 455 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2081  small GTP-binding protein  30.16 
 
 		 416 aa  48.1  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000627073  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  29.3 
 
 		 458 aa  47.4  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0371  GTP-binding protein Era  29.3 
 
 		 307 aa  47.4  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3856  GTP-binding protein Era  27.34 
 
 		 308 aa  47.4  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00601446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  29.3 
 
 		 458 aa  47.4  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1243  small GTP-binding protein  30.65 
 
 		 425 aa  47  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  30.34 
 
 		 461 aa  47  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0392  GTP-binding protein EngA  28.33 
 
 		 494 aa  47  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3256  small GTP-binding protein  26.52 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00305193  hitchhiker  0.00001491 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0705  small GTP-binding protein  26.52 
 
 		 412 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.131335  hitchhiker  0.000692522 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1186  GTP-binding protein EngA  29.84 
 
 		 461 aa  46.6  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0245  small GTP-binding protein  27.27 
 
 		 403 aa  46.6  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31412  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19310  small GTP-binding protein  30.51 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00194835  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0183  small GTP-binding protein  31.85 
 
 		 408 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>