21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_14190 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_14190  uncharacterized protein associated with GTPases  100 
 
 		 401 aa  806    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1262  hypothetical protein  54.65 
 
 		 378 aa  326  4.0000000000000003e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0244924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06120  hypothetical protein  37.9 
 
 		 471 aa  211  2e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000493325 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0675  hypothetical protein  39.55 
 
 		 324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0364288  normal  0.525863 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0880  GTPase domain-containing protein  52.42 
 
 		 284 aa  98.6  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0213  hypothetical protein  29.86 
 
 		 384 aa  77  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0836  hypothetical protein  34.06 
 
 		 386 aa  73.6  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00104213  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2557  hypothetical protein  33.58 
 
 		 353 aa  73.2  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4329  hypothetical protein  34.07 
 
 		 388 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.461549 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3187  hypothetical protein  35.71 
 
 		 432 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0947704 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1715  hypothetical protein  39.52 
 
 		 192 aa  58.9  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691695  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2372  hypothetical protein  35.71 
 
 		 444 aa  56.6  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4488  hypothetical protein  33.7 
 
 		 424 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1154  hypothetical protein  35.65 
 
 		 435 aa  54.7  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0379  hypothetical protein  33.33 
 
 		 330 aa  53.5  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3510  hypothetical protein  35.8 
 
 		 419 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.376537 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16501  GTPase SAR1 and related small G proteins  28 
 
 		 532 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.569133 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0670  GTP-binding protein  31.16 
 
 		 355 aa  47.8  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.417298  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2482  hypothetical protein  26.19 
 
 		 409 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0321451  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10221  GTPase SAR1 and related small G protein  27.12 
 
 		 516 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.524471  normal  0.183753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1544  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.37 
 
 		 517 aa  43.9  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0624831 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>