22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2372 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3187  hypothetical protein  72.25 
 
 		 432 aa  653    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0947704 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2372  hypothetical protein  100 
 
 		 444 aa  917    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3510  hypothetical protein  73.01 
 
 		 419 aa  612  9.999999999999999e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.376537 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4488  hypothetical protein  65 
 
 		 424 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1154  hypothetical protein  50.79 
 
 		 435 aa  374  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2482  hypothetical protein  31.37 
 
 		 409 aa  155  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0321451  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1600  hypothetical protein  35.13 
 
 		 406 aa  150  5e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.406561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0657  hypothetical protein  33.81 
 
 		 411 aa  143  6e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1077  Miro domain protein  22.79 
 
 		 444 aa  80.5  0.00000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2153  kinase  24.33 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1262  hypothetical protein  35.23 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0244924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14190  uncharacterized protein associated with GTPases  35.71 
 
 		 401 aa  56.6  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0880  GTPase domain-containing protein  34.68 
 
 		 284 aa  55.1  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1715  hypothetical protein  29.6 
 
 		 192 aa  53.5  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691695  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06120  hypothetical protein  33.68 
 
 		 471 aa  52.4  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000493325 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0264  GTP-binding protein  25.2 
 
 		 383 aa  50.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0670  GTP-binding protein  27.34 
 
 		 355 aa  50.1  0.00009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.417298  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1580  hypothetical protein  28.95 
 
 		 195 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0874129 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2984  GTPase associated putative protein/domain-like protein  27.07 
 
 		 168 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.22109 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0379  hypothetical protein  27.07 
 
 		 330 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0877  GTPase domain-containing protein  27.34 
 
 		 215 aa  45.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000876255  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1153  hypothetical protein  25.82 
 
 		 614 aa  43.9  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.9167  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>