22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0880 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0880  GTPase domain-containing protein  100 
 
 		 284 aa  554  1e-157  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1262  hypothetical protein  52 
 
 		 378 aa  121  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0244924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14190  uncharacterized protein associated with GTPases  52.42 
 
 		 401 aa  121  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0675  hypothetical protein  34.15 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0364288  normal  0.525863 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06120  hypothetical protein  42.95 
 
 		 471 aa  107  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000493325 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0379  hypothetical protein  31.21 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0836  hypothetical protein  31.67 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00104213  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2557  hypothetical protein  33.33 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3187  hypothetical protein  32.54 
 
 		 432 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0947704 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1715  hypothetical protein  33.54 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691695  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4329  hypothetical protein  29.9 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.461549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2372  hypothetical protein  34.68 
 
 		 444 aa  60.5  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0213  hypothetical protein  34.88 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4488  hypothetical protein  30.08 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2984  GTPase associated putative protein/domain-like protein  30.6 
 
 		 168 aa  53.5  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.22109 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0670  GTP-binding protein  26.36 
 
 		 355 aa  53.1  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.417298  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1154  hypothetical protein  37 
 
 		 435 aa  52.4  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3510  hypothetical protein  34.26 
 
 		 419 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.376537 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2153  kinase  36.96 
 
 		 363 aa  46.6  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1077  Miro domain protein  29.55 
 
 		 444 aa  45.4  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2832  hypothetical protein  27.69 
 
 		 191 aa  43.9  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2482  hypothetical protein  26.27 
 
 		 409 aa  43.9  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0321451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>