17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2984 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2984  GTPase associated putative protein/domain-like protein  100 
 
 
168 aa  343  7e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.22109 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1715  hypothetical protein  37.93 
 
 
192 aa  116  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691695  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1154  hypothetical protein  35.04 
 
 
435 aa  57  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1077  Miro domain protein  33.57 
 
 
444 aa  53.5  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4488  hypothetical protein  29.94 
 
 
424 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3187  hypothetical protein  30.08 
 
 
432 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0947704 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2372  hypothetical protein  27.07 
 
 
444 aa  47  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0880  GTPase domain-containing protein  29.41 
 
 
284 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1055  hypothetical protein  26.39 
 
 
342 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0973  hypothetical protein  26.39 
 
 
338 aa  46.6  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170247  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0028  hypothetical protein  27.59 
 
 
319 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0379  hypothetical protein  28.57 
 
 
330 aa  46.2  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1560  hypothetical protein  27.48 
 
 
342 aa  44.7  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  43.33 
 
 
531 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  43.33 
 
 
531 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06120  hypothetical protein  34.26 
 
 
471 aa  41.6  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000493325 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1955  GTPase domain-containing protein  27.15 
 
 
164 aa  40.8  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.387211  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>