24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3187 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3187  hypothetical protein  100 
 
 		 432 aa  892    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0947704 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2372  hypothetical protein  72.25 
 
 		 444 aa  653    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3510  hypothetical protein  74.57 
 
 		 419 aa  612  9.999999999999999e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.376537 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4488  hypothetical protein  63.42 
 
 		 424 aa  519  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1154  hypothetical protein  49.62 
 
 		 435 aa  374  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2482  hypothetical protein  30.67 
 
 		 409 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0321451  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1600  hypothetical protein  32.7 
 
 		 406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.406561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0657  hypothetical protein  34.03 
 
 		 411 aa  139  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1077  Miro domain protein  23.47 
 
 		 444 aa  87.4  4e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2153  kinase  26.61 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0264  GTP-binding protein  25.94 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0880  GTPase domain-containing protein  32.54 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1715  hypothetical protein  30.58 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691695  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14190  uncharacterized protein associated with GTPases  35.71 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1262  hypothetical protein  31.82 
 
 		 378 aa  55.1  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0244924  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0670  GTP-binding protein  28.81 
 
 		 355 aa  53.1  0.000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.417298  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0877  GTPase domain-containing protein  27.38 
 
 		 215 aa  51.2  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000876255  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06120  hypothetical protein  29.67 
 
 		 471 aa  50.4  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000493325 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2984  GTPase associated putative protein/domain-like protein  30.08 
 
 		 168 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.22109 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1580  hypothetical protein  38.55 
 
 		 195 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0874129 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1153  hypothetical protein  28.57 
 
 		 614 aa  45.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.9167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  26.61 
 
 		 298 aa  45.1  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0267  GTPase domain-containing protein  27.11 
 
 		 221 aa  43.5  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.137333  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0379  hypothetical protein  26.79 
 
 		 330 aa  43.1  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>