205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1153 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1153  hypothetical protein  100 
 
 		 614 aa  1210    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.9167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2380  GTP-binding protein, HSR1-related  44.85 
 
 		 635 aa  479  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2089  small GTP-binding protein domain-containing protein  44.41 
 
 		 637 aa  478  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000643797  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4767  GTP-binding protein HSR1-related  45.34 
 
 		 629 aa  458  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.049365  hitchhiker  0.000697216 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4307  GTP-binding protein HSR1-related  43.36 
 
 		 650 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0656  GTP-binding protein HSR1-related protein  29.61 
 
 		 512 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.53051  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4133  GTP-binding protein HSR1-related protein  35.14 
 
 		 840 aa  93.6  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2152  GTP-binding protein, HSR1-related  22.77 
 
 		 523 aa  93.6  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1599  GTP-binding protein, HSR1-related  26.33 
 
 		 500 aa  90.5  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1388  GTP-binding protein HSR1-related protein  28.57 
 
 		 291 aa  59.3  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2138  putative GTPase  29.26 
 
 		 290 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2882  GTP-binding protein HSR1-related  29.33 
 
 		 291 aa  55.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2482  hypothetical protein  31.67 
 
 		 409 aa  55.5  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0321451  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2292  GTP-binding protein EngA  33.59 
 
 		 465 aa  54.7  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0406895  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2204  GTP-binding protein EngA  33.59 
 
 		 465 aa  54.7  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199328  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  25.37 
 
 		 303 aa  54.7  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1393  putative GTPase  28.85 
 
 		 290 aa  54.3  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1972  GTP-binding protein Era  27.69 
 
 		 289 aa  53.9  0.000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1543  GTP-binding protein Era  29.47 
 
 		 314 aa  53.9  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1162  GTP-binding protein Era  27.01 
 
 		 303 aa  53.5  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2251  putative GTPase  28.85 
 
 		 290 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.796861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1654  GTP-binding protein EngA  32.06 
 
 		 465 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1071  putative GTPase  27.95 
 
 		 290 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0467468 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  27.27 
 
 		 315 aa  52.4  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04795  GTP-binding protein EngA  28.06 
 
 		 434 aa  53.1  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2155  GTP-binding protein EngA  34.85 
 
 		 471 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.616734  normal  0.133544 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0033  GTP-binding protein Era  26.02 
 
 		 305 aa  51.6  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1077  Miro domain protein  28.49 
 
 		 444 aa  51.6  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  27.27 
 
 		 291 aa  51.2  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  21.58 
 
 		 307 aa  51.2  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1369  GTP-binding protein EngA  30.33 
 
 		 434 aa  50.4  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.911808  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2662  small GTP-binding protein  33.04 
 
 		 453 aa  50.4  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.144738  hitchhiker  0.00576403 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1879  GTP-binding protein EngA  29.41 
 
 		 437 aa  50.4  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4891  putative GTPase  26.79 
 
 		 290 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2103  GTP-binding protein EngA  37.11 
 
 		 441 aa  50.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3202  putative GTPase  26.96 
 
 		 294 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  30.33 
 
 		 437 aa  50.4  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1458  GTP-binding protein EngA  29.13 
 
 		 445 aa  50.1  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548717  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3346  putative GTPase  27.95 
 
 		 290 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1395  GTP-binding protein EngA  25.5 
 
 		 441 aa  49.3  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4797  putative GTPase  26.11 
 
 		 294 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21922  predicted protein  24.4 
 
 		 306 aa  49.3  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1154  hypothetical protein  29.41 
 
 		 435 aa  49.3  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0789  small GTP-binding protein  25.22 
 
 		 443 aa  49.3  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000826073  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  22.54 
 
 		 936 aa  49.3  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3402  putative GTPase  26.11 
 
 		 294 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4685  putative GTPase  26.6 
 
 		 294 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  25.69 
 
 		 298 aa  48.5  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  24.48 
 
 		 450 aa  48.9  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  33.58 
 
 		 454 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2156  GTP-binding protein Era  29.29 
 
 		 310 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151042 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1043  GTP-binding protein HSR1-related protein  24.88 
 
 		 287 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3353  GTP-binding protein HSR1-related protein  24.3 
 
 		 287 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  26.83 
 
 		 458 aa  48.5  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1122  GTP-binding protein EngA  30.91 
 
 		 497 aa  48.5  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.827994  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2815  ribosome-associated GTPase EngA  30.6 
 
 		 478 aa  48.5  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.560303  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3682  protein of unknown function ATP binding  33.59 
 
 		 182 aa  48.5  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.109872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0426  GTP-binding protein EngA  23.91 
 
 		 442 aa  48.5  0.0004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.000271389  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2016  GTP-binding protein EngA  27.22 
 
 		 435 aa  48.1  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  32.89 
 
 		 458 aa  48.1  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06890  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  28.46 
 
 		 444 aa  48.1  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.632761 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  25.34 
 
 		 884 aa  47.8  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  25.68 
 
 		 980 aa  47.8  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1204  GTP-binding protein EngA  25 
 
 		 442 aa  47.8  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.109244  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  26.09 
 
 		 882 aa  47.8  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  24.06 
 
 		 887 aa  47.8  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1227  GTP-binding protein EngA  22.99 
 
 		 436 aa  47.8  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.718862  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0953  ribosome-associated GTPase EngA  30.6 
 
 		 437 aa  47.4  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  25.22 
 
 		 986 aa  47.8  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0076  GTP-binding protein EngA  27.22 
 
 		 490 aa  47.4  0.0008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0791238  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1653  small GTP-binding protein Era  26.53 
 
 		 310 aa  47.4  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0359  GTP-binding protein EngA  31.03 
 
 		 436 aa  47.4  0.0008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1160  GTP-binding protein EngA  29.81 
 
 		 439 aa  47.4  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0769833  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0861  GTP-binding protein Era  26.07 
 
 		 353 aa  47.4  0.0009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0497  GTPase  33.33 
 
 		 420 aa  47.4  0.0009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  28.26 
 
 		 300 aa  47.4  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1177  GTP-binding protein  26.97 
 
 		 441 aa  47  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3308  GTP-binding protein EngA  32.04 
 
 		 487 aa  47  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  21.88 
 
 		 301 aa  47  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  25.98 
 
 		 463 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3510  hypothetical protein  26.5 
 
 		 419 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.376537 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0421  GTP-binding protein EngA  36.05 
 
 		 437 aa  47  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0613118  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1232  GTP-binding protein EngA  32.04 
 
 		 488 aa  47  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1303  GTP-binding protein EngA  32.04 
 
 		 488 aa  47  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1377  GTP-binding protein EngA  32.04 
 
 		 488 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.694687  normal  0.70956 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14830  GTP-binding protein EngA  28.47 
 
 		 470 aa  46.6  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.778091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0593  GTP-binding protein Era  27.88 
 
 		 354 aa  46.6  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3144  GTP-binding protein EngA  32.04 
 
 		 488 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0749903 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  25 
 
 		 921 aa  46.6  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1024  GTP-binding protein EngA  24.39 
 
 		 440 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127427  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2986  GTP-binding protein EngA  32.04 
 
 		 488 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.306969  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0251  GTP-binding protein Era  25 
 
 		 311 aa  47  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2648  GTP-binding protein EngA  32.04 
 
 		 488 aa  46.6  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  24.11 
 
 		 450 aa  46.6  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2293  GTP-binding protein Era  26.53 
 
 		 310 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0382696  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0930  GTP-binding protein HSR1-related  26.2 
 
 		 288 aa  46.6  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.518572  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0764  GTP-binding protein EngA  31.31 
 
 		 437 aa  46.6  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000517804  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3001  GTP-binding protein EngA  32.04 
 
 		 488 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2941  GTP-binding protein HSR1-related  32.84 
 
 		 508 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.781995 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0053  GTP-binding protein EngA  23.97 
 
 		 460 aa  46.6  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>