24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4488 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4488  hypothetical protein  100 
 
 
424 aa  857    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2372  hypothetical protein  65.26 
 
 
444 aa  528  1e-149  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3187  hypothetical protein  63.42 
 
 
432 aa  521  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0947704 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3510  hypothetical protein  65.36 
 
 
419 aa  496  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.376537 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1154  hypothetical protein  48.89 
 
 
435 aa  352  8.999999999999999e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2482  hypothetical protein  30.18 
 
 
409 aa  162  8.000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0321451  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1600  hypothetical protein  36.18 
 
 
406 aa  157  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.406561  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0657  hypothetical protein  30.17 
 
 
411 aa  136  8e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1077  Miro domain protein  23.85 
 
 
444 aa  80.5  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0670  GTP-binding protein  23.59 
 
 
355 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.417298  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2153  kinase  23.53 
 
 
363 aa  66.6  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0264  GTP-binding protein  27.06 
 
 
383 aa  59.3  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1715  hypothetical protein  30.34 
 
 
192 aa  58.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691695  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14190  uncharacterized protein associated with GTPases  33.7 
 
 
401 aa  55.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0880  GTPase domain-containing protein  30.08 
 
 
284 aa  53.1  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1262  hypothetical protein  30.85 
 
 
378 aa  52.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0244924  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06120  hypothetical protein  31.15 
 
 
471 aa  52  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000493325 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1153  hypothetical protein  27.8 
 
 
614 aa  50.4  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.9167  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0248  tRNA modification GTPase TrmE  25.52 
 
 
473 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0877  GTPase domain-containing protein  31.96 
 
 
215 aa  47  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000876255  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2984  GTPase associated putative protein/domain-like protein  34.21 
 
 
168 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.22109 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1580  hypothetical protein  31.58 
 
 
195 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0874129 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0267  GTPase domain-containing protein  29.21 
 
 
221 aa  44.7  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.137333  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4076  hypothetical protein  25.62 
 
 
324 aa  44.7  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>