40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0264 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0264  GTP-binding protein  100 
 
 		 383 aa  766    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0670  GTP-binding protein  30.5 
 
 		 355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.417298  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3187  hypothetical protein  25.94 
 
 		 432 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0947704 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0267  GTPase domain-containing protein  41.03 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.137333  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0877  GTPase domain-containing protein  38.79 
 
 		 215 aa  81.6  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000876255  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2482  hypothetical protein  27.46 
 
 		 409 aa  67  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0321451  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1077  Miro domain protein  26.42 
 
 		 444 aa  67  0.0000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4488  hypothetical protein  26.61 
 
 		 424 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2372  hypothetical protein  25 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1154  hypothetical protein  28.14 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1600  hypothetical protein  32.29 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.406561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1955  GTPase domain-containing protein  30.41 
 
 		 164 aa  57  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.387211  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3738  hypothetical protein  46.03 
 
 		 618 aa  51.6  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3510  hypothetical protein  25 
 
 		 419 aa  50.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.376537 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3699  hypothetical protein  34.23 
 
 		 189 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0807285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3137  GTP-binding protein HSR1-related  30.53 
 
 		 295 aa  47.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0657  hypothetical protein  28.09 
 
 		 411 aa  46.6  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  25.38 
 
 		 291 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1349  hypothetical protein  29.58 
 
 		 566 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1080  small GTP-binding protein  23.71 
 
 		 484 aa  45.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1825  GTP-binding protein Era  30.94 
 
 		 309 aa  44.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1394  hypothetical protein  46.51 
 
 		 543 aa  44.7  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0036  ribosome-associated GTPase  45.9 
 
 		 344 aa  44.3  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1458  GTP-binding protein EngA  33.11 
 
 		 487 aa  44.3  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.961762  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4459  small GTP-binding protein  23.16 
 
 		 520 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1715  hypothetical protein  28.18 
 
 		 192 aa  43.5  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691695  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1353  putative ABC transporter  48.72 
 
 		 667 aa  43.5  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00435841  hitchhiker  0.000139423 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2087  ribosome-associated GTPase  39.24 
 
 		 349 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530476  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4307  GTP-binding protein HSR1-related  36.47 
 
 		 650 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2042  ribosome-associated GTPase  39.24 
 
 		 349 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000718459 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2010  ribosome-associated GTPase  45.9 
 
 		 349 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2008  ribosome-associated GTPase  39.24 
 
 		 364 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2121  ribosome-associated GTPase  39.24 
 
 		 349 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.209175  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1820  ribosome-associated GTPase  39.24 
 
 		 364 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1836  ribosome-associated GTPase  39.24 
 
 		 364 aa  43.5  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.472013  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1866  ribosome-associated GTPase  39.24 
 
 		 364 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.360553  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74138  septin  23.97 
 
 		 345 aa  43.1  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.314588  normal  0.29916 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3299  ribosome-associated GTPase  44.26 
 
 		 349 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0506498 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1744  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 		 314 aa  42.7  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000728906  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  25.81 
 
 		 305 aa  42.7  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>