29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1154 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1154  hypothetical protein  100 
 
 		 435 aa  872    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3187  hypothetical protein  49.62 
 
 		 432 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0947704 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2372  hypothetical protein  50.79 
 
 		 444 aa  394  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4488  hypothetical protein  48.63 
 
 		 424 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3510  hypothetical protein  49.5 
 
 		 419 aa  368  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.376537 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2482  hypothetical protein  35.08 
 
 		 409 aa  172  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0321451  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1600  hypothetical protein  32.99 
 
 		 406 aa  136  8e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.406561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0657  hypothetical protein  32.56 
 
 		 411 aa  126  7e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1077  Miro domain protein  24.81 
 
 		 444 aa  92.8  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2153  kinase  26.96 
 
 		 363 aa  89.4  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14190  uncharacterized protein associated with GTPases  35.65 
 
 		 401 aa  63.5  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0264  GTP-binding protein  27.9 
 
 		 383 aa  62  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2984  GTPase associated putative protein/domain-like protein  35.04 
 
 		 168 aa  60.8  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.22109 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1262  hypothetical protein  35.58 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0244924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0880  GTPase domain-containing protein  37 
 
 		 284 aa  53.9  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1715  hypothetical protein  30.08 
 
 		 192 aa  53.1  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691695  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06120  hypothetical protein  35.23 
 
 		 471 aa  53.1  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000493325 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0379  hypothetical protein  25.49 
 
 		 330 aa  50.4  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1153  hypothetical protein  29.41 
 
 		 614 aa  49.7  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.9167  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0670  GTP-binding protein  30.43 
 
 		 355 aa  48.5  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.417298  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2557  hypothetical protein  31.93 
 
 		 353 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3902  GTP-binding protein HSR1-related  23.27 
 
 		 829 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12168  normal  0.150325 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0103  GTP-binding protein  30.77 
 
 		 440 aa  47.8  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000228129  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1560  hypothetical protein  31.15 
 
 		 342 aa  47.8  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0106  GTP-binding protein  31.36 
 
 		 440 aa  47.8  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3852  GTP-binding protein HSR1-related  23.97 
 
 		 1415 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  24.52 
 
 		 531 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  24.52 
 
 		 531 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1955  GTPase domain-containing protein  27.78 
 
 		 164 aa  43.1  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.387211  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>